Protein–RNA interactions for Protein: O08852

Pkd1, Polycystin-1, mousemouse

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Length 4,293 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pkd1O08852 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Pkd1O08852 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Pkd1O08852 Rasl2-9-201ENSMUST00000147835 1013 ntAPPRIS P1 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Pkd1O08852 Gm2274-201ENSMUST00000184539 609 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Pkd1O08852 Cdk2ap2-201ENSMUST00000025779 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Pkd1O08852 Adrb3-202ENSMUST00000117565 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Pkd1O08852 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Pkd1O08852 Gm15889-201ENSMUST00000159142 1083 ntTSL 3 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Pkd1O08852 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Pkd1O08852 Aicda-202ENSMUST00000160685 1292 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Pkd1O08852 Arpc4-204ENSMUST00000204802 794 ntTSL 3 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Pkd1O08852 Fam159b-201ENSMUST00000043061 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Pkd1O08852 Nsfl1c-201ENSMUST00000028949 1364 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Pkd1O08852 Ogg1-201ENSMUST00000032406 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Pkd1O08852 Kiss1r-202ENSMUST00000219745 979 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Pkd1O08852 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Pkd1O08852 Hapln2-201ENSMUST00000005014 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Pkd1O08852 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Pkd1O08852 Cyp4f41-ps-201ENSMUST00000126790 1077 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Pkd1O08852 1500009L16Rik-201ENSMUST00000150459 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Pkd1O08852 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Pkd1O08852 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Pkd1O08852 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Pkd1O08852 Cgrrf1-204ENSMUST00000140114 419 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Pkd1O08852 Gm17349-201ENSMUST00000163472 300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Pkd1O08852 AW822252-206ENSMUST00000208904 237 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Pkd1O08852 Slc25a31-201ENSMUST00000091184 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Pkd1O08852 Fbxo7-203ENSMUST00000120344 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Pkd1O08852 Agxt-201ENSMUST00000027491 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Pkd1O08852 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Pkd1O08852 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Pkd1O08852 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Pkd1O08852 Slbp-205ENSMUST00000139518 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Pkd1O08852 Gm25016-201ENSMUST00000158399 131 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Pkd1O08852 Znhit2-201ENSMUST00000162726 1281 ntAPPRIS P1 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Pkd1O08852 Gm26644-201ENSMUST00000181365 958 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Pkd1O08852 Ndufaf8-202ENSMUST00000185558 427 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Pkd1O08852 Gm45631-201ENSMUST00000210318 1244 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Pkd1O08852 Hoxa6-201ENSMUST00000062829 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Pkd1O08852 S100a16-202ENSMUST00000098911 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Pkd1O08852 Espn-209ENSMUST00000105655 1350 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Pkd1O08852 Cyb5a-204ENSMUST00000160180 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Pkd1O08852 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Pkd1O08852 Agbl4-205ENSMUST00000106591 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Pkd1O08852 4930544D05Rik-204ENSMUST00000180052 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Pkd1O08852 Gm29518-201ENSMUST00000190858 372 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Pkd1O08852 Mrps6-201ENSMUST00000047429 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Pkd1O08852 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Pkd1O08852 Mettl4-ps1-202ENSMUST00000130218 1323 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Pkd1O08852 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Pkd1O08852 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Pkd1O08852 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Pkd1O08852 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Pkd1O08852 Tpm2-203ENSMUST00000107914 1164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Pkd1O08852 4833413E03Rik-201ENSMUST00000013706 1091 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.55
Pkd1O08852 Gm13816-201ENSMUST00000152230 715 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Pkd1O08852 Tma7-201ENSMUST00000167504 944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Pkd1O08852 Prr3-209ENSMUST00000174849 581 ntTSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.55
Pkd1O08852 Vpreb1-201ENSMUST00000075017 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Pkd1O08852 Rae1-201ENSMUST00000029013 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Pkd1O08852 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Pkd1O08852 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Pkd1O08852 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Pkd1O08852 Bcat2-201ENSMUST00000033098 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Pkd1O08852 Gm27704-201ENSMUST00000185094 107 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Pkd1O08852 Ttc32-203ENSMUST00000219488 768 ntTSL 3 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Pkd1O08852 Efcab11-207ENSMUST00000223114 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Pkd1O08852 Rgcc-201ENSMUST00000022595 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Pkd1O08852 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Pkd1O08852 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Pkd1O08852 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Pkd1O08852 Hist1h2af-201ENSMUST00000073261 399 ntAPPRIS P1 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Pkd1O08852 Taar2-201ENSMUST00000079134 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Pkd1O08852 Gm44544-201ENSMUST00000207052 1844 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Pkd1O08852 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Pkd1O08852 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Pkd1O08852 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Pkd1O08852 Gm37805-201ENSMUST00000192612 1094 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Pkd1O08852 Pdcd2l-201ENSMUST00000002710 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Pkd1O08852 Cltb-201ENSMUST00000049575 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Pkd1O08852 Plpbp-202ENSMUST00000098851 1368 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Pkd1O08852 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Pkd1O08852 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Pkd1O08852 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Pkd1O08852 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Pkd1O08852 Gm16075-201ENSMUST00000135873 361 ntTSL 3 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Pkd1O08852 Il17b-201ENSMUST00000025471 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Pkd1O08852 Irak1bp1-201ENSMUST00000034783 1159 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Pkd1O08852 C1qbp-201ENSMUST00000078528 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Pkd1O08852 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Pkd1O08852 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Pkd1O08852 Fam131c-201ENSMUST00000006380 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Pkd1O08852 Ttpal-202ENSMUST00000109408 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Pkd1O08852 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Pkd1O08852 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Pkd1O08852 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Pkd1O08852 Cutc-202ENSMUST00000112047 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Pkd1O08852 Hrh3-204ENSMUST00000165248 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Pkd1O08852 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Pkd1O08852 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
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