Protein–RNA interactions for Protein: O08542

Efna4, Ephrin-A4, mousemouse

Predictions only

Length 206 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Efna4O08542 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Efna4O08542 Rps5-202ENSMUST00000108539 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Efna4O08542 Rfesd-202ENSMUST00000167271 595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Efna4O08542 Gm42884-202ENSMUST00000202523 423 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Efna4O08542 Gm35240-201ENSMUST00000218335 661 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Efna4O08542 Grhpr-201ENSMUST00000045078 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Efna4O08542 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Efna4O08542 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Efna4O08542 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Efna4O08542 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Efna4O08542 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Efna4O08542 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Efna4O08542 Scrn2-201ENSMUST00000021249 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Efna4O08542 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Efna4O08542 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Efna4O08542 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Efna4O08542 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Efna4O08542 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Efna4O08542 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Efna4O08542 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Efna4O08542 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Efna4O08542 Gm5417-201ENSMUST00000079706 384 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Efna4O08542 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Efna4O08542 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Efna4O08542 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Efna4O08542 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Efna4O08542 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Efna4O08542 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Efna4O08542 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Efna4O08542 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Efna4O08542 Gmcl1-202ENSMUST00000113679 960 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Efna4O08542 Fev-202ENSMUST00000159232 928 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Efna4O08542 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Efna4O08542 Gm43799-201ENSMUST00000201845 579 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Efna4O08542 Gabarapl1-202ENSMUST00000204487 902 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Efna4O08542 2310033P09Rik-201ENSMUST00000020719 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Efna4O08542 Gm45337-201ENSMUST00000210537 1267 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Efna4O08542 Nme2-202ENSMUST00000072566 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Efna4O08542 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Efna4O08542 K230015D01Rik-201ENSMUST00000211969 1516 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Efna4O08542 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Efna4O08542 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Efna4O08542 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Efna4O08542 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Efna4O08542 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Efna4O08542 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Efna4O08542 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Efna4O08542 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Efna4O08542 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Efna4O08542 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Efna4O08542 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Efna4O08542 Serf1-205ENSMUST00000152286 465 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Efna4O08542 Gm10231-201ENSMUST00000181584 441 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Efna4O08542 Atp5g2-202ENSMUST00000185641 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Efna4O08542 Pthlh-202ENSMUST00000204197 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Efna4O08542 Gm10175-202ENSMUST00000208752 441 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Efna4O08542 Trappc6a-201ENSMUST00000002112 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Efna4O08542 Atp5g2-201ENSMUST00000075630 441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Efna4O08542 Gm10549-201ENSMUST00000097634 450 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Efna4O08542 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Efna4O08542 Capg-202ENSMUST00000114071 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Efna4O08542 Aqp2-201ENSMUST00000023752 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Efna4O08542 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Efna4O08542 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Efna4O08542 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Efna4O08542 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Efna4O08542 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Efna4O08542 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Efna4O08542 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Efna4O08542 Lrrc73-201ENSMUST00000095262 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Efna4O08542 Tax1bp3-201ENSMUST00000040687 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Efna4O08542 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Efna4O08542 Arrdc4-202ENSMUST00000118110 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Efna4O08542 Gm11927-201ENSMUST00000118472 759 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Efna4O08542 Alkbh1-212ENSMUST00000185301 408 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Efna4O08542 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Efna4O08542 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Efna4O08542 Aga-203ENSMUST00000211424 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Efna4O08542 Wnt10b-205ENSMUST00000226846 1204 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Efna4O08542 Uchl1-201ENSMUST00000031131 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Efna4O08542 Lat-201ENSMUST00000032997 1235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Efna4O08542 Snx12-201ENSMUST00000077876 1002 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Efna4O08542 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Efna4O08542 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Efna4O08542 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Efna4O08542 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Efna4O08542 4930461C15Rik-201ENSMUST00000133622 1302 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Efna4O08542 Tspan4-201ENSMUST00000026585 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Efna4O08542 Foxo3-204ENSMUST00000175881 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Efna4O08542 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Efna4O08542 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Efna4O08542 Cisd2-202ENSMUST00000120988 1363 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Efna4O08542 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Efna4O08542 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Efna4O08542 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Efna4O08542 Mrpl21-202ENSMUST00000025745 1138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Efna4O08542 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Efna4O08542 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Efna4O08542 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Efna4O08542 Agpat3-202ENSMUST00000105387 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.6 ms