Protein–RNA interactions for Protein: L7N244

Gm20878, Predicted gene, 20878, mousemouse

Predictions only

Length 103 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm20878L7N244 Rapgef3-207ENSMUST00000134885 1422 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Gm20878L7N244 Hrh3-202ENSMUST00000163215 1401 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Gm20878L7N244 Trim14-201ENSMUST00000046897 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Gm20878L7N244 Tmem145-202ENSMUST00000119703 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Gm20878L7N244 Tmem80-202ENSMUST00000126510 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Gm20878L7N244 Khdc3-204ENSMUST00000173734 1228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Gm20878L7N244 4930579K19Rik-202ENSMUST00000190541 632 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Gm20878L7N244 Gm37292-201ENSMUST00000192062 758 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
Gm20878L7N244 Gm36736-201ENSMUST00000206060 646 ntTSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Gm20878L7N244 Hebp1-201ENSMUST00000045855 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Gm20878L7N244 Tollip-202ENSMUST00000055819 1100 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Gm20878L7N244 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Gm20878L7N244 Ptges3-202ENSMUST00000084771 1559 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Gm20878L7N244 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Gm20878L7N244 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Gm20878L7N244 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Gm20878L7N244 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Gm20878L7N244 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
Gm20878L7N244 Gm10459-201ENSMUST00000202708 1155 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
Gm20878L7N244 Fxyd1-208ENSMUST00000205807 539 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Gm20878L7N244 Timm23-208ENSMUST00000226683 750 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
Gm20878L7N244 Gm10273-201ENSMUST00000092511 1126 ntAPPRIS P1 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Gm20878L7N244 Ctla2a-201ENSMUST00000021880 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Gm20878L7N244 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Gm20878L7N244 Alg5-201ENSMUST00000044567 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Gm20878L7N244 Fbxo47-201ENSMUST00000093939 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Gm20878L7N244 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Gm20878L7N244 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Gm20878L7N244 Nudt22-203ENSMUST00000180765 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Gm20878L7N244 Gm7889-201ENSMUST00000185591 958 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Gm20878L7N244 Gm45618-201ENSMUST00000209890 660 ntAPPRIS P1 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Gm20878L7N244 Fkbp3-201ENSMUST00000021332 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Gm20878L7N244 Gm7367-201ENSMUST00000057611 492 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Gm20878L7N244 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Gm20878L7N244 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Gm20878L7N244 Gpr137b-ps-203ENSMUST00000220758 1942 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Gm20878L7N244 Cerkl-205ENSMUST00000143974 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Gm20878L7N244 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Gm20878L7N244 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Gm20878L7N244 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Gm20878L7N244 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Gm20878L7N244 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Gm20878L7N244 Dusp13-213ENSMUST00000184703 902 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Gm20878L7N244 Ssr2-207ENSMUST00000195014 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Gm20878L7N244 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Gm20878L7N244 Gnb2-204ENSMUST00000111027 1610 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Gm20878L7N244 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Gm20878L7N244 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Gm20878L7N244 Mmp28-204ENSMUST00000119346 1517 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Gm20878L7N244 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Gm20878L7N244 Adrb3-202ENSMUST00000117565 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Gm20878L7N244 Ruvbl1-201ENSMUST00000032165 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Gm20878L7N244 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Gm20878L7N244 Gm44544-201ENSMUST00000207052 1844 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Gm20878L7N244 Faap20-201ENSMUST00000097747 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Gm20878L7N244 Rae1-201ENSMUST00000029013 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Gm20878L7N244 Fndc11-201ENSMUST00000050026 1387 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Gm20878L7N244 Josd2-203ENSMUST00000118493 922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Gm20878L7N244 Gm3375-201ENSMUST00000203929 796 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Gm20878L7N244 Wdr74-202ENSMUST00000210512 1078 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Gm20878L7N244 Yif1b-201ENSMUST00000032809 1111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Gm20878L7N244 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Gm20878L7N244 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Gm20878L7N244 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Gm20878L7N244 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Gm20878L7N244 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Gm20878L7N244 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Gm20878L7N244 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Gm20878L7N244 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Gm20878L7N244 Slc25a39-202ENSMUST00000107098 1606 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gm20878L7N244 4930432B10Rik-202ENSMUST00000181330 1612 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gm20878L7N244 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gm20878L7N244 Gm7712-202ENSMUST00000222331 1510 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Gm20878L7N244 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gm20878L7N244 Pitx2-201ENSMUST00000029657 1680 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gm20878L7N244 Bpnt1-202ENSMUST00000110965 1046 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gm20878L7N244 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gm20878L7N244 Hilpda-202ENSMUST00000115289 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gm20878L7N244 Izumo1r-204ENSMUST00000121116 726 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gm20878L7N244 4930405A21Rik-202ENSMUST00000139042 994 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gm20878L7N244 Mrpl13-205ENSMUST00000172387 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gm20878L7N244 Mir6349-201ENSMUST00000184059 97 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Gm20878L7N244 A430033K04Rik-204ENSMUST00000200521 1110 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gm20878L7N244 Gadd45b-203ENSMUST00000220246 732 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gm20878L7N244 Mrpl28-201ENSMUST00000025014 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gm20878L7N244 A430033K04Rik-201ENSMUST00000032590 1109 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gm20878L7N244 3110070M22Rik-201ENSMUST00000099148 1123 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gm20878L7N244 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gm20878L7N244 Ndufv1-202ENSMUST00000128787 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gm20878L7N244 Ndufv1-207ENSMUST00000134479 1438 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gm20878L7N244 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gm20878L7N244 Zfp382-201ENSMUST00000098596 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gm20878L7N244 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gm20878L7N244 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gm20878L7N244 Cdkl3-203ENSMUST00000109076 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gm20878L7N244 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gm20878L7N244 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gm20878L7N244 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gm20878L7N244 Tfdp2-209ENSMUST00000188750 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gm20878L7N244 Impa1-204ENSMUST00000191670 1100 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.1 ms