Protein–RNA interactions for Protein: J9JI28

Vwa3b, von Willebrand factor A domain-containing 3B, mousemouse

Predictions only

Length 736 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vwa3bJ9JI28 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Vwa3bJ9JI28 Smim15-205ENSMUST00000225972 2097 ntAPPRIS P1 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Vwa3bJ9JI28 Ccdc149-201ENSMUST00000059428 3295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Vwa3bJ9JI28 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Vwa3bJ9JI28 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Vwa3bJ9JI28 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Vwa3bJ9JI28 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Vwa3bJ9JI28 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Vwa3bJ9JI28 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Vwa3bJ9JI28 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Vwa3bJ9JI28 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Vwa3bJ9JI28 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Vwa3bJ9JI28 Ubtf-204ENSMUST00000107117 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Vwa3bJ9JI28 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Vwa3bJ9JI28 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Vwa3bJ9JI28 Ddx59-201ENSMUST00000027655 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Vwa3bJ9JI28 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Vwa3bJ9JI28 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Vwa3bJ9JI28 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Vwa3bJ9JI28 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
Vwa3bJ9JI28 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Vwa3bJ9JI28 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Vwa3bJ9JI28 Plekhf2-201ENSMUST00000054776 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Vwa3bJ9JI28 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Vwa3bJ9JI28 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Vwa3bJ9JI28 1700018L02Rik-201ENSMUST00000187897 2485 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
Vwa3bJ9JI28 Sqstm1-201ENSMUST00000015981 2673 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Vwa3bJ9JI28 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Vwa3bJ9JI28 Pfn2-201ENSMUST00000066882 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Vwa3bJ9JI28 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Vwa3bJ9JI28 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Vwa3bJ9JI28 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
Vwa3bJ9JI28 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Vwa3bJ9JI28 Zfp768-201ENSMUST00000060783 2356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Vwa3bJ9JI28 C1ql3-201ENSMUST00000061545 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Vwa3bJ9JI28 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Vwa3bJ9JI28 Lysmd4-209ENSMUST00000208998 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Vwa3bJ9JI28 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Vwa3bJ9JI28 Slc25a47-202ENSMUST00000221080 1890 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Vwa3bJ9JI28 Snx21-201ENSMUST00000056181 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Vwa3bJ9JI28 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Vwa3bJ9JI28 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Vwa3bJ9JI28 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Vwa3bJ9JI28 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Vwa3bJ9JI28 Slc5a10-201ENSMUST00000051552 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Vwa3bJ9JI28 Dlg1-205ENSMUST00000115201 3248 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Vwa3bJ9JI28 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Vwa3bJ9JI28 Foxo3-204ENSMUST00000175881 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Vwa3bJ9JI28 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Vwa3bJ9JI28 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Vwa3bJ9JI28 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Vwa3bJ9JI28 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Vwa3bJ9JI28 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Vwa3bJ9JI28 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Vwa3bJ9JI28 Nrros-203ENSMUST00000115165 2389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Vwa3bJ9JI28 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Vwa3bJ9JI28 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Vwa3bJ9JI28 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Vwa3bJ9JI28 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Vwa3bJ9JI28 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Vwa3bJ9JI28 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Vwa3bJ9JI28 Hspa1l-201ENSMUST00000007248 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Vwa3bJ9JI28 5330438I03Rik-201ENSMUST00000168347 2845 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
Vwa3bJ9JI28 Nfatc2-205ENSMUST00000137451 2369 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Vwa3bJ9JI28 Usp13-202ENSMUST00000108228 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Vwa3bJ9JI28 Slc30a5-205ENSMUST00000225922 2722 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Vwa3bJ9JI28 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Vwa3bJ9JI28 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Vwa3bJ9JI28 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
Vwa3bJ9JI28 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Vwa3bJ9JI28 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Vwa3bJ9JI28 Agfg2-201ENSMUST00000031736 2893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Vwa3bJ9JI28 AC163637.2-201ENSMUST00000213826 1945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
Vwa3bJ9JI28 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC21.58■■□□□ 1.04
Vwa3bJ9JI28 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Vwa3bJ9JI28 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Vwa3bJ9JI28 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Vwa3bJ9JI28 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Vwa3bJ9JI28 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
Vwa3bJ9JI28 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Vwa3bJ9JI28 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Vwa3bJ9JI28 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Vwa3bJ9JI28 Ptpra-201ENSMUST00000028769 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Vwa3bJ9JI28 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Vwa3bJ9JI28 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Vwa3bJ9JI28 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Vwa3bJ9JI28 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Vwa3bJ9JI28 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Vwa3bJ9JI28 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Vwa3bJ9JI28 Stac2-201ENSMUST00000017544 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Vwa3bJ9JI28 Gm43702-201ENSMUST00000198772 2546 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
Vwa3bJ9JI28 Etnk1-204ENSMUST00000205256 2647 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Vwa3bJ9JI28 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Vwa3bJ9JI28 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Vwa3bJ9JI28 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Vwa3bJ9JI28 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Vwa3bJ9JI28 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Vwa3bJ9JI28 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Vwa3bJ9JI28 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Vwa3bJ9JI28 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
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