Protein–RNA interactions for Protein: J3QPD3

Gm8356, Predicted gene 8356, mousemouse

Predictions only

Length 205 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm8356J3QPD3 Itsn1-203ENSMUST00000095909 6103 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Gm8356J3QPD3 Stox1-202ENSMUST00000133371 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Gm8356J3QPD3 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Gm8356J3QPD3 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Gm8356J3QPD3 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Gm8356J3QPD3 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Gm8356J3QPD3 Klhl5-204ENSMUST00000204097 3149 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Gm8356J3QPD3 Tsnax-202ENSMUST00000212603 2169 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Gm8356J3QPD3 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Gm8356J3QPD3 Gm16054-201ENSMUST00000139469 1819 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Gm8356J3QPD3 Rsph6a-201ENSMUST00000035521 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Gm8356J3QPD3 Snx14-205ENSMUST00000173011 2238 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gm8356J3QPD3 Tmem136-202ENSMUST00000213544 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gm8356J3QPD3 Rraga-201ENSMUST00000091064 1618 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gm8356J3QPD3 Galnt13-204ENSMUST00000112636 7530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gm8356J3QPD3 Tbc1d2b-202ENSMUST00000128874 3473 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gm8356J3QPD3 Mef2d-201ENSMUST00000001455 5401 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gm8356J3QPD3 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Gm8356J3QPD3 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gm8356J3QPD3 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gm8356J3QPD3 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gm8356J3QPD3 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gm8356J3QPD3 Mapk7-203ENSMUST00000108714 3069 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gm8356J3QPD3 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gm8356J3QPD3 Lrrc14-202ENSMUST00000127208 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gm8356J3QPD3 Ing1-207ENSMUST00000211007 2241 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gm8356J3QPD3 Ddx41-204ENSMUST00000224765 2199 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Gm8356J3QPD3 Rrbp1-201ENSMUST00000016072 5177 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gm8356J3QPD3 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gm8356J3QPD3 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gm8356J3QPD3 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gm8356J3QPD3 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gm8356J3QPD3 Fuz-201ENSMUST00000071207 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gm8356J3QPD3 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gm8356J3QPD3 Tmem132c-201ENSMUST00000119026 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gm8356J3QPD3 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gm8356J3QPD3 Gm15558-201ENSMUST00000126849 2018 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gm8356J3QPD3 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gm8356J3QPD3 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gm8356J3QPD3 Bcr-201ENSMUST00000164107 6839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gm8356J3QPD3 Lysmd4-209ENSMUST00000208998 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gm8356J3QPD3 Nlrp5-ps-201ENSMUST00000044683 1913 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gm8356J3QPD3 Mturn-203ENSMUST00000190641 5303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gm8356J3QPD3 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gm8356J3QPD3 Tubgcp4-203ENSMUST00000110658 4250 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gm8356J3QPD3 Rev1-201ENSMUST00000027251 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gm8356J3QPD3 Fgf23-201ENSMUST00000000186 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gm8356J3QPD3 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gm8356J3QPD3 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gm8356J3QPD3 Pick1-201ENSMUST00000018295 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gm8356J3QPD3 Tmem131l-201ENSMUST00000052342 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gm8356J3QPD3 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gm8356J3QPD3 Atp2b2-201ENSMUST00000089003 7067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gm8356J3QPD3 Ubtf-206ENSMUST00000107123 2759 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gm8356J3QPD3 Smim15-205ENSMUST00000225972 2097 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gm8356J3QPD3 Gm15408-201ENSMUST00000124198 1379 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gm8356J3QPD3 Gprin1-202ENSMUST00000135343 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gm8356J3QPD3 Ndor1-202ENSMUST00000114349 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gm8356J3QPD3 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gm8356J3QPD3 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gm8356J3QPD3 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gm8356J3QPD3 Myo9b-206ENSMUST00000212935 6316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gm8356J3QPD3 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gm8356J3QPD3 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gm8356J3QPD3 Prdm6-203ENSMUST00000115399 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gm8356J3QPD3 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gm8356J3QPD3 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gm8356J3QPD3 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gm8356J3QPD3 Fam20c-201ENSMUST00000026972 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gm8356J3QPD3 Ece2-202ENSMUST00000122306 2495 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gm8356J3QPD3 Icam5-201ENSMUST00000019616 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gm8356J3QPD3 Acvr2a-201ENSMUST00000063886 5686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gm8356J3QPD3 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gm8356J3QPD3 Lrp5-201ENSMUST00000025856 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gm8356J3QPD3 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gm8356J3QPD3 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gm8356J3QPD3 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gm8356J3QPD3 Capn1-202ENSMUST00000164843 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gm8356J3QPD3 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gm8356J3QPD3 Inpp5f-201ENSMUST00000043138 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gm8356J3QPD3 Fjx1-201ENSMUST00000099678 3134 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gm8356J3QPD3 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gm8356J3QPD3 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gm8356J3QPD3 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gm8356J3QPD3 5330438I03Rik-201ENSMUST00000168347 2845 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Gm8356J3QPD3 Lhfpl4-201ENSMUST00000162280 4762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gm8356J3QPD3 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gm8356J3QPD3 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gm8356J3QPD3 Gm17055-201ENSMUST00000166951 2232 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gm8356J3QPD3 Sarm1-202ENSMUST00000108287 4868 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gm8356J3QPD3 Rnf26-208ENSMUST00000185479 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gm8356J3QPD3 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gm8356J3QPD3 Arhgef19-201ENSMUST00000006618 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gm8356J3QPD3 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gm8356J3QPD3 Agbl5-215ENSMUST00000202060 3121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gm8356J3QPD3 Mark3-202ENSMUST00000084953 3365 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gm8356J3QPD3 Armc10-202ENSMUST00000095495 2700 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gm8356J3QPD3 Tpd52-205ENSMUST00000120143 6317 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gm8356J3QPD3 Fgf22-202ENSMUST00000219228 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gm8356J3QPD3 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19 ms