Protein–RNA interactions for Protein: J3QM76

Ccdc179, Coiled-coil domain-containing protein 179, mousemouse

Predictions only

Length 67 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc179J3QM76 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Ccdc179J3QM76 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Ccdc179J3QM76 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Ccdc179J3QM76 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Ccdc179J3QM76 Gm26762-201ENSMUST00000180864 5284 ntTSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Ccdc179J3QM76 Ccdc50-203ENSMUST00000100026 7089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Ccdc179J3QM76 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Ccdc179J3QM76 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Ccdc179J3QM76 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Ccdc179J3QM76 Megf9-202ENSMUST00000107359 7924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Ccdc179J3QM76 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Ccdc179J3QM76 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Ccdc179J3QM76 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Ccdc179J3QM76 Vangl2-201ENSMUST00000027837 5698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Ccdc179J3QM76 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Ccdc179J3QM76 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Ccdc179J3QM76 Slc4a5-202ENSMUST00000113899 5039 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Ccdc179J3QM76 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Ccdc179J3QM76 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Ccdc179J3QM76 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
Ccdc179J3QM76 Dlg5-203ENSMUST00000090398 7851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Ccdc179J3QM76 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Ccdc179J3QM76 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Ccdc179J3QM76 Nadk2-202ENSMUST00000100789 3578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Ccdc179J3QM76 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
Ccdc179J3QM76 Runx2-213ENSMUST00000162878 2987 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Ccdc179J3QM76 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Ccdc179J3QM76 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Ccdc179J3QM76 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
Ccdc179J3QM76 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Ccdc179J3QM76 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
Ccdc179J3QM76 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Ccdc179J3QM76 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Ccdc179J3QM76 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Ccdc179J3QM76 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Ccdc179J3QM76 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Ccdc179J3QM76 Ttc13-202ENSMUST00000117624 3096 ntTSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Ccdc179J3QM76 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Ccdc179J3QM76 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Ccdc179J3QM76 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Ccdc179J3QM76 Apba3-211ENSMUST00000220297 2268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Ccdc179J3QM76 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Ccdc179J3QM76 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Ccdc179J3QM76 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Ccdc179J3QM76 Esyt2-205ENSMUST00000220816 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Ccdc179J3QM76 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Ccdc179J3QM76 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Ccdc179J3QM76 Lhx6-205ENSMUST00000112967 3378 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Ccdc179J3QM76 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Ccdc179J3QM76 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Ccdc179J3QM76 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Ccdc179J3QM76 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Ccdc179J3QM76 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Ccdc179J3QM76 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Ccdc179J3QM76 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Ccdc179J3QM76 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Ccdc179J3QM76 Igdcc4-202ENSMUST00000077696 6361 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Ccdc179J3QM76 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Ccdc179J3QM76 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Ccdc179J3QM76 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Ccdc179J3QM76 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Ccdc179J3QM76 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Ccdc179J3QM76 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Ccdc179J3QM76 Zfp384-208ENSMUST00000112428 3132 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Ccdc179J3QM76 Pprc1-203ENSMUST00000111899 5246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Ccdc179J3QM76 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Ccdc179J3QM76 Cblb-201ENSMUST00000114471 6648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Ccdc179J3QM76 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Ccdc179J3QM76 Lpgat1-201ENSMUST00000110855 7233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Ccdc179J3QM76 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Ccdc179J3QM76 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Ccdc179J3QM76 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Ccdc179J3QM76 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Ccdc179J3QM76 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Ccdc179J3QM76 Csnk1g3-201ENSMUST00000069597 4394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Ccdc179J3QM76 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Ccdc179J3QM76 Grk6-206ENSMUST00000224995 2971 ntBASIC11.56□□□□□ -0.56
Ccdc179J3QM76 Cadm3-201ENSMUST00000005470 2518 ntTSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Ccdc179J3QM76 Impad1-201ENSMUST00000084949 6543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Ccdc179J3QM76 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Ccdc179J3QM76 Col17a1-202ENSMUST00000086923 5477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Ccdc179J3QM76 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Ccdc179J3QM76 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Ccdc179J3QM76 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Ccdc179J3QM76 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC11.56□□□□□ -0.56
Ccdc179J3QM76 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Ccdc179J3QM76 Ism1-201ENSMUST00000099307 2944 ntTSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Ccdc179J3QM76 Zbtb45-201ENSMUST00000051390 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Ccdc179J3QM76 Cant1-204ENSMUST00000106288 2873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Ccdc179J3QM76 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Ccdc179J3QM76 Fam160b1-201ENSMUST00000036407 5630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Ccdc179J3QM76 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Ccdc179J3QM76 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Ccdc179J3QM76 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Ccdc179J3QM76 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Ccdc179J3QM76 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Ccdc179J3QM76 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Ccdc179J3QM76 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Ccdc179J3QM76 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Ccdc179J3QM76 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.2 ms