Protein–RNA interactions for Protein: J3QK46

Tmem200c, Transmembrane protein 200C, mousemouse

Predictions only

Length 637 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem200cJ3QK46 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Tmem200cJ3QK46 AC135963.1-201ENSMUST00000211640 717 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Tmem200cJ3QK46 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Tmem200cJ3QK46 Cxadr-201ENSMUST00000023572 5734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Tmem200cJ3QK46 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Tmem200cJ3QK46 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Tmem200cJ3QK46 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Tmem200cJ3QK46 Lbp-202ENSMUST00000109491 1322 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Tmem200cJ3QK46 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Tmem200cJ3QK46 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Tmem200cJ3QK46 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Tmem200cJ3QK46 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Tmem200cJ3QK46 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Tmem200cJ3QK46 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Tmem200cJ3QK46 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Tmem200cJ3QK46 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Tmem200cJ3QK46 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Tmem200cJ3QK46 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Tmem200cJ3QK46 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Tmem200cJ3QK46 Rpl18-202ENSMUST00000209287 1027 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Tmem200cJ3QK46 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Tmem200cJ3QK46 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Tmem200cJ3QK46 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Tmem200cJ3QK46 Crocc-202ENSMUST00000097816 6273 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Tmem200cJ3QK46 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Tmem200cJ3QK46 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Tmem200cJ3QK46 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Tmem200cJ3QK46 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Tmem200cJ3QK46 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Tmem200cJ3QK46 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Tmem200cJ3QK46 Chd5-202ENSMUST00000030775 9486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Tmem200cJ3QK46 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Tmem200cJ3QK46 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Tmem200cJ3QK46 Lrch3-201ENSMUST00000023491 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Tmem200cJ3QK46 Ankrd17-214ENSMUST00000218526 4938 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Tmem200cJ3QK46 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Tmem200cJ3QK46 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Tmem200cJ3QK46 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Tmem200cJ3QK46 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Tmem200cJ3QK46 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Tmem200cJ3QK46 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Tmem200cJ3QK46 Ern1-203ENSMUST00000106800 654 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Tmem200cJ3QK46 Eda-204ENSMUST00000113777 1056 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Tmem200cJ3QK46 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Tmem200cJ3QK46 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Tmem200cJ3QK46 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Tmem200cJ3QK46 Eda-201ENSMUST00000071453 1152 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Tmem200cJ3QK46 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Tmem200cJ3QK46 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Tmem200cJ3QK46 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Tmem200cJ3QK46 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Tmem200cJ3QK46 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Tmem200cJ3QK46 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Tmem200cJ3QK46 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Tmem200cJ3QK46 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Tmem200cJ3QK46 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Tmem200cJ3QK46 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Tmem200cJ3QK46 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Tmem200cJ3QK46 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Tmem200cJ3QK46 Ramp1-203ENSMUST00000188475 711 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Tmem200cJ3QK46 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Tmem200cJ3QK46 Ints8-202ENSMUST00000108318 3169 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Tmem200cJ3QK46 Rps6ka2-201ENSMUST00000024575 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Tmem200cJ3QK46 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Tmem200cJ3QK46 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Tmem200cJ3QK46 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Tmem200cJ3QK46 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Tmem200cJ3QK46 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Tmem200cJ3QK46 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Tmem200cJ3QK46 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Tmem200cJ3QK46 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Tmem200cJ3QK46 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Tmem200cJ3QK46 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Tmem200cJ3QK46 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Tmem200cJ3QK46 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Tmem200cJ3QK46 Gm2990-201ENSMUST00000180662 1118 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Tmem200cJ3QK46 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Tmem200cJ3QK46 Gm45894-202ENSMUST00000212728 1097 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Tmem200cJ3QK46 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
Tmem200cJ3QK46 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Tmem200cJ3QK46 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Tmem200cJ3QK46 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Tmem200cJ3QK46 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Tmem200cJ3QK46 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Tmem200cJ3QK46 Ulk2-201ENSMUST00000004920 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Tmem200cJ3QK46 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Tmem200cJ3QK46 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Tmem200cJ3QK46 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Tmem200cJ3QK46 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Tmem200cJ3QK46 Dmrta2os-202ENSMUST00000141893 691 ntTSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Tmem200cJ3QK46 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Tmem200cJ3QK46 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Tmem200cJ3QK46 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Tmem200cJ3QK46 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Tmem200cJ3QK46 Gm45472-201ENSMUST00000211295 1426 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Tmem200cJ3QK46 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Tmem200cJ3QK46 Rbm24-201ENSMUST00000037923 3086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Tmem200cJ3QK46 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Tmem200cJ3QK46 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Tmem200cJ3QK46 2310022A10Rik-201ENSMUST00000067386 2701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.6 ms