Protein–RNA interactions for Protein: J3QJW5

Cldn34c3, Claudin 34C3, mousemouse

Predictions only

Length 233 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn34c3J3QJW5 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Cldn34c3J3QJW5 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Cldn34c3J3QJW5 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Cldn34c3J3QJW5 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Cldn34c3J3QJW5 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Cldn34c3J3QJW5 Tbc1d9b-202ENSMUST00000101270 5213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Cldn34c3J3QJW5 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Cldn34c3J3QJW5 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Cldn34c3J3QJW5 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Cldn34c3J3QJW5 Rybp-201ENSMUST00000101118 4503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Cldn34c3J3QJW5 Adnp-202ENSMUST00000088001 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Cldn34c3J3QJW5 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Cldn34c3J3QJW5 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Cldn34c3J3QJW5 Gm11373-201ENSMUST00000129791 2819 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Cldn34c3J3QJW5 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Cldn34c3J3QJW5 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Cldn34c3J3QJW5 Tmem151b-201ENSMUST00000180252 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Cldn34c3J3QJW5 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Cldn34c3J3QJW5 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Cldn34c3J3QJW5 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Cldn34c3J3QJW5 Map4k5-210ENSMUST00000171211 4334 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Cldn34c3J3QJW5 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Cldn34c3J3QJW5 Cacna1b-204ENSMUST00000102939 9736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Cldn34c3J3QJW5 Keap1-206ENSMUST00000216436 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Cldn34c3J3QJW5 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Cldn34c3J3QJW5 Atp2c1-201ENSMUST00000038118 4876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Cldn34c3J3QJW5 Shq1-202ENSMUST00000113312 6816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Cldn34c3J3QJW5 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Cldn34c3J3QJW5 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Cldn34c3J3QJW5 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Cldn34c3J3QJW5 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Cldn34c3J3QJW5 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Cldn34c3J3QJW5 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Cldn34c3J3QJW5 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Cldn34c3J3QJW5 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Cldn34c3J3QJW5 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Cldn34c3J3QJW5 Plekhf2-201ENSMUST00000054776 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Cldn34c3J3QJW5 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Cldn34c3J3QJW5 Smu1-201ENSMUST00000030117 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Cldn34c3J3QJW5 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Cldn34c3J3QJW5 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Cldn34c3J3QJW5 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Cldn34c3J3QJW5 Rab6b-201ENSMUST00000035155 5007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Cldn34c3J3QJW5 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Cldn34c3J3QJW5 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Cldn34c3J3QJW5 Sulf2-201ENSMUST00000088086 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Cldn34c3J3QJW5 Gm45606-201ENSMUST00000209836 2795 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Cldn34c3J3QJW5 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Cldn34c3J3QJW5 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Cldn34c3J3QJW5 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Cldn34c3J3QJW5 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Cldn34c3J3QJW5 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Cldn34c3J3QJW5 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Cldn34c3J3QJW5 Acvr2b-205ENSMUST00000215746 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Cldn34c3J3QJW5 Iqgap2-201ENSMUST00000068603 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Cldn34c3J3QJW5 Adam22-205ENSMUST00000115385 2318 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Cldn34c3J3QJW5 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Cldn34c3J3QJW5 Fst-202ENSMUST00000223640 2612 ntBASIC14.71□□□□□ -0.06
Cldn34c3J3QJW5 Rbm11-202ENSMUST00000114249 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.06
Cldn34c3J3QJW5 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Cldn34c3J3QJW5 Neo1-201ENSMUST00000068664 7379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Cldn34c3J3QJW5 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cldn34c3J3QJW5 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cldn34c3J3QJW5 Wipf1-201ENSMUST00000094681 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cldn34c3J3QJW5 Atp9a-203ENSMUST00000109176 3691 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cldn34c3J3QJW5 Ankrd17-202ENSMUST00000081914 8057 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cldn34c3J3QJW5 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cldn34c3J3QJW5 Rnaseh2a-202ENSMUST00000109736 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cldn34c3J3QJW5 A730060N03Rik-201ENSMUST00000174277 2124 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cldn34c3J3QJW5 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Cldn34c3J3QJW5 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cldn34c3J3QJW5 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cldn34c3J3QJW5 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cldn34c3J3QJW5 Gm26634-201ENSMUST00000181146 1511 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cldn34c3J3QJW5 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Cldn34c3J3QJW5 Zfp512b-201ENSMUST00000108789 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cldn34c3J3QJW5 Ssc4d-204ENSMUST00000111153 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cldn34c3J3QJW5 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cldn34c3J3QJW5 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cldn34c3J3QJW5 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Cldn34c3J3QJW5 Ttc14-203ENSMUST00000117915 4913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Cldn34c3J3QJW5 Klf13-201ENSMUST00000063694 6396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Cldn34c3J3QJW5 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Cldn34c3J3QJW5 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Cldn34c3J3QJW5 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Cldn34c3J3QJW5 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Cldn34c3J3QJW5 Fam135a-201ENSMUST00000027337 5536 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Cldn34c3J3QJW5 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Cldn34c3J3QJW5 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Cldn34c3J3QJW5 Ptprd-206ENSMUST00000107289 9899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Cldn34c3J3QJW5 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Cldn34c3J3QJW5 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Cldn34c3J3QJW5 Gm44832-201ENSMUST00000208849 2303 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Cldn34c3J3QJW5 Fam120c-201ENSMUST00000073364 5463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Cldn34c3J3QJW5 St8sia1-201ENSMUST00000032421 8991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Cldn34c3J3QJW5 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Cldn34c3J3QJW5 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Cldn34c3J3QJW5 Fbxl3-201ENSMUST00000022720 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Cldn34c3J3QJW5 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Cldn34c3J3QJW5 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC14.68□□□□□ -0.06
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