Protein–RNA interactions for Protein: J3KMS6

Gm21818, MCG122238, isoform CRA_a, mousemouse

Predictions only

Length 170 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm21818J3KMS6 1700018L02Rik-201ENSMUST00000187897 2485 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Gm21818J3KMS6 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gm21818J3KMS6 Tbc1d9-202ENSMUST00000093393 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gm21818J3KMS6 Srcin1-203ENSMUST00000107596 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gm21818J3KMS6 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gm21818J3KMS6 Fam131b-203ENSMUST00000143278 4104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gm21818J3KMS6 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gm21818J3KMS6 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gm21818J3KMS6 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gm21818J3KMS6 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Gm21818J3KMS6 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gm21818J3KMS6 Rasgrp1-201ENSMUST00000102534 5229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gm21818J3KMS6 Tmem136-202ENSMUST00000213544 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gm21818J3KMS6 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gm21818J3KMS6 Zscan12-201ENSMUST00000053293 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gm21818J3KMS6 Dexi-203ENSMUST00000184863 2537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gm21818J3KMS6 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gm21818J3KMS6 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gm21818J3KMS6 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gm21818J3KMS6 Nadk2-202ENSMUST00000100789 3578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gm21818J3KMS6 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gm21818J3KMS6 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gm21818J3KMS6 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gm21818J3KMS6 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gm21818J3KMS6 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gm21818J3KMS6 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gm21818J3KMS6 Arhgef7-205ENSMUST00000110909 4926 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gm21818J3KMS6 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gm21818J3KMS6 Whrn-205ENSMUST00000095038 2665 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gm21818J3KMS6 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gm21818J3KMS6 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gm21818J3KMS6 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gm21818J3KMS6 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gm21818J3KMS6 Ano10-206ENSMUST00000216670 2108 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gm21818J3KMS6 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gm21818J3KMS6 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gm21818J3KMS6 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gm21818J3KMS6 Map3k10-201ENSMUST00000036453 3682 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gm21818J3KMS6 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gm21818J3KMS6 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gm21818J3KMS6 Fst-202ENSMUST00000223640 2612 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Gm21818J3KMS6 Arhgef19-201ENSMUST00000006618 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gm21818J3KMS6 A730060N03Rik-201ENSMUST00000174277 2124 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gm21818J3KMS6 Mapk8ip3-221ENSMUST00000178969 5579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gm21818J3KMS6 Clstn2-201ENSMUST00000035027 4365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gm21818J3KMS6 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gm21818J3KMS6 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Gm21818J3KMS6 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gm21818J3KMS6 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gm21818J3KMS6 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gm21818J3KMS6 Nptxr-203ENSMUST00000175858 4948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gm21818J3KMS6 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gm21818J3KMS6 Mapk7-203ENSMUST00000108714 3069 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gm21818J3KMS6 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gm21818J3KMS6 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Gm21818J3KMS6 Osbpl1a-207ENSMUST00000121808 3030 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Gm21818J3KMS6 Foxp4-204ENSMUST00000113265 3999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Gm21818J3KMS6 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gm21818J3KMS6 Eps8-201ENSMUST00000058210 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gm21818J3KMS6 Slc5a10-201ENSMUST00000051552 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gm21818J3KMS6 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gm21818J3KMS6 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gm21818J3KMS6 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gm21818J3KMS6 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gm21818J3KMS6 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gm21818J3KMS6 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gm21818J3KMS6 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gm21818J3KMS6 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gm21818J3KMS6 Pex14-201ENSMUST00000103217 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gm21818J3KMS6 Iqgap2-201ENSMUST00000068603 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gm21818J3KMS6 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Gm21818J3KMS6 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gm21818J3KMS6 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gm21818J3KMS6 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gm21818J3KMS6 Pik3r2-201ENSMUST00000034296 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gm21818J3KMS6 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gm21818J3KMS6 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gm21818J3KMS6 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gm21818J3KMS6 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gm21818J3KMS6 Nuak1-201ENSMUST00000020220 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gm21818J3KMS6 Ext2-212ENSMUST00000184931 2629 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gm21818J3KMS6 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gm21818J3KMS6 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gm21818J3KMS6 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gm21818J3KMS6 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gm21818J3KMS6 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gm21818J3KMS6 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gm21818J3KMS6 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gm21818J3KMS6 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gm21818J3KMS6 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gm21818J3KMS6 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gm21818J3KMS6 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gm21818J3KMS6 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gm21818J3KMS6 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gm21818J3KMS6 Clasp2-204ENSMUST00000213663 2727 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gm21818J3KMS6 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gm21818J3KMS6 Card10-202ENSMUST00000164826 4726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gm21818J3KMS6 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gm21818J3KMS6 Mapk1-202ENSMUST00000069107 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gm21818J3KMS6 Ocel1-203ENSMUST00000110052 5285 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18 ms