Protein–RNA interactions for Protein: I6L890

Casp16-ps, Caspase 16, apoptosis-related cysteine peptidase, pseudogene, mousemouse

Predictions only

Length 176 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Casp16-psI6L890 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Casp16-psI6L890 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Casp16-psI6L890 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Casp16-psI6L890 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Casp16-psI6L890 AL591207.1-203ENSMUST00000222401 1380 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Casp16-psI6L890 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Casp16-psI6L890 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Casp16-psI6L890 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Casp16-psI6L890 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Casp16-psI6L890 Gm11249-201ENSMUST00000117071 859 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Casp16-psI6L890 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Casp16-psI6L890 1700101I19Rik-202ENSMUST00000186712 510 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Casp16-psI6L890 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Casp16-psI6L890 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Casp16-psI6L890 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Casp16-psI6L890 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Casp16-psI6L890 Tmem145-202ENSMUST00000119703 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Casp16-psI6L890 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Casp16-psI6L890 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Casp16-psI6L890 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Casp16-psI6L890 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Casp16-psI6L890 Crtap-201ENSMUST00000084881 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Casp16-psI6L890 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Casp16-psI6L890 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Casp16-psI6L890 Caskin1-201ENSMUST00000024958 6172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Casp16-psI6L890 Gm11927-201ENSMUST00000118472 759 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Casp16-psI6L890 Gng2-202ENSMUST00000159028 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Casp16-psI6L890 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Casp16-psI6L890 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Casp16-psI6L890 Zfp783-201ENSMUST00000095946 670 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Casp16-psI6L890 Gpr137b-ps-203ENSMUST00000220758 1942 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Casp16-psI6L890 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Casp16-psI6L890 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Casp16-psI6L890 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Casp16-psI6L890 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Casp16-psI6L890 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Casp16-psI6L890 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Casp16-psI6L890 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Casp16-psI6L890 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Casp16-psI6L890 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
Casp16-psI6L890 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Casp16-psI6L890 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Casp16-psI6L890 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Casp16-psI6L890 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Casp16-psI6L890 Tomm6-202ENSMUST00000113302 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Casp16-psI6L890 Gm13168-201ENSMUST00000121771 632 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Casp16-psI6L890 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Casp16-psI6L890 Gm18666-201ENSMUST00000190039 958 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Casp16-psI6L890 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Casp16-psI6L890 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Casp16-psI6L890 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Casp16-psI6L890 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Casp16-psI6L890 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Casp16-psI6L890 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Casp16-psI6L890 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Casp16-psI6L890 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Casp16-psI6L890 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Casp16-psI6L890 Gm38285-201ENSMUST00000192928 922 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Casp16-psI6L890 2810405F15Rik-201ENSMUST00000195368 932 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Casp16-psI6L890 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Casp16-psI6L890 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Casp16-psI6L890 Mrpl10-202ENSMUST00000054252 744 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Casp16-psI6L890 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Casp16-psI6L890 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Casp16-psI6L890 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Casp16-psI6L890 Tfdp2-209ENSMUST00000188750 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Casp16-psI6L890 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Casp16-psI6L890 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Casp16-psI6L890 Gm16054-201ENSMUST00000139469 1819 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Casp16-psI6L890 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Casp16-psI6L890 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Casp16-psI6L890 Gm13158-201ENSMUST00000122007 736 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Casp16-psI6L890 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Casp16-psI6L890 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Casp16-psI6L890 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Casp16-psI6L890 Fam98b-201ENSMUST00000028825 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Casp16-psI6L890 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Casp16-psI6L890 Gm16386-201ENSMUST00000181397 1423 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Casp16-psI6L890 Pon1-201ENSMUST00000002663 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Casp16-psI6L890 Gm45447-201ENSMUST00000209874 1805 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Casp16-psI6L890 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Casp16-psI6L890 Tnfaip8l2-201ENSMUST00000013851 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Casp16-psI6L890 Gm22240-201ENSMUST00000175225 82 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Casp16-psI6L890 Mrpl15-205ENSMUST00000146665 1569 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Casp16-psI6L890 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Casp16-psI6L890 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Casp16-psI6L890 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Casp16-psI6L890 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Casp16-psI6L890 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Casp16-psI6L890 Fmnl2-203ENSMUST00000090952 5414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Casp16-psI6L890 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Casp16-psI6L890 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Casp16-psI6L890 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Casp16-psI6L890 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Casp16-psI6L890 Nrxn2-204ENSMUST00000113461 5505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Casp16-psI6L890 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Casp16-psI6L890 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Casp16-psI6L890 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Casp16-psI6L890 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Casp16-psI6L890 Wnt10b-202ENSMUST00000166022 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.7 ms