Protein–RNA interactions for Protein: H3BIW7

Gm29394, Predicted gene 29394, mousemouse

Predictions only

Length 199 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm29394H3BIW7 Fbxo47-201ENSMUST00000093939 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Gm29394H3BIW7 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Gm29394H3BIW7 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Gm29394H3BIW7 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Gm29394H3BIW7 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Gm29394H3BIW7 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Gm29394H3BIW7 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Gm29394H3BIW7 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Gm29394H3BIW7 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Gm29394H3BIW7 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Gm29394H3BIW7 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Gm29394H3BIW7 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Gm29394H3BIW7 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Gm29394H3BIW7 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Gm29394H3BIW7 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Gm29394H3BIW7 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Gm29394H3BIW7 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Gm29394H3BIW7 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Gm29394H3BIW7 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Gm29394H3BIW7 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Gm29394H3BIW7 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Gm29394H3BIW7 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Gm29394H3BIW7 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Gm29394H3BIW7 Gm9194-201ENSMUST00000220749 1447 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Gm29394H3BIW7 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Gm29394H3BIW7 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Gm29394H3BIW7 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Gm29394H3BIW7 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Gm29394H3BIW7 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Gm29394H3BIW7 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Gm29394H3BIW7 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Gm29394H3BIW7 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Gm29394H3BIW7 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Gm29394H3BIW7 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Gm29394H3BIW7 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Gm29394H3BIW7 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Gm29394H3BIW7 Plekhg3-207ENSMUST00000219063 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Gm29394H3BIW7 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Gm29394H3BIW7 B3gat2-202ENSMUST00000140583 1737 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Gm29394H3BIW7 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Gm29394H3BIW7 Atrnl1-201ENSMUST00000077282 6581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Gm29394H3BIW7 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Gm29394H3BIW7 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Gm29394H3BIW7 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Gm29394H3BIW7 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Gm29394H3BIW7 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Gm29394H3BIW7 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Gm29394H3BIW7 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Gm29394H3BIW7 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Gm29394H3BIW7 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Gm29394H3BIW7 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Gm29394H3BIW7 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Gm29394H3BIW7 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
Gm29394H3BIW7 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Gm29394H3BIW7 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Gm29394H3BIW7 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Gm29394H3BIW7 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Gm29394H3BIW7 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Gm29394H3BIW7 Gm16054-201ENSMUST00000139469 1819 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Gm29394H3BIW7 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Gm29394H3BIW7 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Gm29394H3BIW7 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Gm29394H3BIW7 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Gm29394H3BIW7 Anks1b-225ENSMUST00000182966 1625 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Gm29394H3BIW7 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Gm29394H3BIW7 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Gm29394H3BIW7 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Gm29394H3BIW7 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Gm29394H3BIW7 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Gm29394H3BIW7 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Gm29394H3BIW7 B230208B08Rik-201ENSMUST00000173049 404 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Gm29394H3BIW7 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Gm29394H3BIW7 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Gm29394H3BIW7 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Gm29394H3BIW7 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Gm29394H3BIW7 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Gm29394H3BIW7 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Gm29394H3BIW7 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Gm29394H3BIW7 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Gm29394H3BIW7 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Gm29394H3BIW7 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Gm29394H3BIW7 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Gm29394H3BIW7 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Gm29394H3BIW7 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Gm29394H3BIW7 Elof1-204ENSMUST00000214394 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Gm29394H3BIW7 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Gm29394H3BIW7 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Gm29394H3BIW7 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Gm29394H3BIW7 Gnb2-204ENSMUST00000111027 1610 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Gm29394H3BIW7 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Gm29394H3BIW7 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Gm29394H3BIW7 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Gm29394H3BIW7 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Gm29394H3BIW7 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Gm29394H3BIW7 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Gm29394H3BIW7 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Gm29394H3BIW7 Gm6209-202ENSMUST00000194629 1506 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Gm29394H3BIW7 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Gm29394H3BIW7 Mdfic-202ENSMUST00000120512 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Gm29394H3BIW7 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.5 ms