Protein–RNA interactions for Protein: G3XA52

Vmn1r34, Vomeronasal type-1 receptor, mousemouse

Predictions only

Length 309 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn1r34G3XA52 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Vmn1r34G3XA52 Elof1-204ENSMUST00000214394 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Vmn1r34G3XA52 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Vmn1r34G3XA52 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Vmn1r34G3XA52 Gm10065-201ENSMUST00000076238 345 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Vmn1r34G3XA52 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Vmn1r34G3XA52 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Vmn1r34G3XA52 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Vmn1r34G3XA52 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Vmn1r34G3XA52 Cdc14b-201ENSMUST00000039318 5859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Vmn1r34G3XA52 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Vmn1r34G3XA52 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Vmn1r34G3XA52 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Vmn1r34G3XA52 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Vmn1r34G3XA52 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Vmn1r34G3XA52 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Vmn1r34G3XA52 Arhgap21-201ENSMUST00000114594 7351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Vmn1r34G3XA52 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Vmn1r34G3XA52 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Vmn1r34G3XA52 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Vmn1r34G3XA52 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Vmn1r34G3XA52 Fbxo47-201ENSMUST00000093939 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Vmn1r34G3XA52 B3gat2-202ENSMUST00000140583 1737 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Vmn1r34G3XA52 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Vmn1r34G3XA52 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Vmn1r34G3XA52 Fam98c-203ENSMUST00000134176 1189 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Vmn1r34G3XA52 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Vmn1r34G3XA52 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Vmn1r34G3XA52 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Vmn1r34G3XA52 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Vmn1r34G3XA52 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Vmn1r34G3XA52 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Vmn1r34G3XA52 Olfr322-201ENSMUST00000072030 984 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Vmn1r34G3XA52 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Vmn1r34G3XA52 Gm6209-202ENSMUST00000194629 1506 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Vmn1r34G3XA52 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Vmn1r34G3XA52 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Vmn1r34G3XA52 Fgf23-201ENSMUST00000000186 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Vmn1r34G3XA52 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Vmn1r34G3XA52 Tex264-203ENSMUST00000169068 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Vmn1r34G3XA52 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Vmn1r34G3XA52 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Vmn1r34G3XA52 Akt2-205ENSMUST00000108344 4544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Vmn1r34G3XA52 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Vmn1r34G3XA52 Ntn1-201ENSMUST00000021284 5738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Vmn1r34G3XA52 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Vmn1r34G3XA52 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Vmn1r34G3XA52 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Vmn1r34G3XA52 Ypel3-204ENSMUST00000106359 469 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Vmn1r34G3XA52 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Vmn1r34G3XA52 Vkorc1-202ENSMUST00000119922 387 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Vmn1r34G3XA52 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Vmn1r34G3XA52 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Vmn1r34G3XA52 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Vmn1r34G3XA52 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Vmn1r34G3XA52 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Vmn1r34G3XA52 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Vmn1r34G3XA52 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Vmn1r34G3XA52 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Vmn1r34G3XA52 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Vmn1r34G3XA52 Tsc22d1-214ENSMUST00000177207 1476 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Vmn1r34G3XA52 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Vmn1r34G3XA52 Atad2b-201ENSMUST00000045664 8035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Vmn1r34G3XA52 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Vmn1r34G3XA52 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Vmn1r34G3XA52 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Vmn1r34G3XA52 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Vmn1r34G3XA52 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Vmn1r34G3XA52 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Vmn1r34G3XA52 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Vmn1r34G3XA52 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Vmn1r34G3XA52 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Vmn1r34G3XA52 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Vmn1r34G3XA52 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Vmn1r34G3XA52 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Vmn1r34G3XA52 Plekhg3-207ENSMUST00000219063 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Vmn1r34G3XA52 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Vmn1r34G3XA52 Speg-204ENSMUST00000113589 833 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Vmn1r34G3XA52 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Vmn1r34G3XA52 Gm12473-201ENSMUST00000137535 579 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Vmn1r34G3XA52 Tspan2-203ENSMUST00000196611 682 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Vmn1r34G3XA52 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Vmn1r34G3XA52 Ckm-201ENSMUST00000003643 1235 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Vmn1r34G3XA52 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Vmn1r34G3XA52 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Vmn1r34G3XA52 Mdfic-202ENSMUST00000120512 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Vmn1r34G3XA52 Slc2a13-202ENSMUST00000109283 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Vmn1r34G3XA52 Dscc1-202ENSMUST00000110231 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Vmn1r34G3XA52 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Vmn1r34G3XA52 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Vmn1r34G3XA52 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Vmn1r34G3XA52 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Vmn1r34G3XA52 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Vmn1r34G3XA52 AC122335.2-201ENSMUST00000213901 6181 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Vmn1r34G3XA52 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Vmn1r34G3XA52 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Vmn1r34G3XA52 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Vmn1r34G3XA52 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Vmn1r34G3XA52 Iscu-202ENSMUST00000112311 1395 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Vmn1r34G3XA52 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.7 ms