Protein–RNA interactions for Protein: G3X9B4

4933408B17Rik, MCG121508, mousemouse

Predictions only

Length 273 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4933408B17RikG3X9B4 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
4933408B17RikG3X9B4 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
4933408B17RikG3X9B4 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
4933408B17RikG3X9B4 Hspa5-202ENSMUST00000100171 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
4933408B17RikG3X9B4 Zmym3-201ENSMUST00000063577 6057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
4933408B17RikG3X9B4 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
4933408B17RikG3X9B4 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
4933408B17RikG3X9B4 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
4933408B17RikG3X9B4 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
4933408B17RikG3X9B4 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
4933408B17RikG3X9B4 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
4933408B17RikG3X9B4 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
4933408B17RikG3X9B4 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
4933408B17RikG3X9B4 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
4933408B17RikG3X9B4 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
4933408B17RikG3X9B4 Stox2-208ENSMUST00000211737 4573 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
4933408B17RikG3X9B4 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
4933408B17RikG3X9B4 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
4933408B17RikG3X9B4 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
4933408B17RikG3X9B4 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
4933408B17RikG3X9B4 Zfp746-201ENSMUST00000073124 3651 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
4933408B17RikG3X9B4 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
4933408B17RikG3X9B4 Shank3-202ENSMUST00000066545 4702 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
4933408B17RikG3X9B4 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
4933408B17RikG3X9B4 Arhgef10-201ENSMUST00000084207 5528 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
4933408B17RikG3X9B4 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
4933408B17RikG3X9B4 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
4933408B17RikG3X9B4 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
4933408B17RikG3X9B4 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
4933408B17RikG3X9B4 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
4933408B17RikG3X9B4 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
4933408B17RikG3X9B4 Fjx1-201ENSMUST00000099678 3134 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
4933408B17RikG3X9B4 Anks1-201ENSMUST00000025058 6844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
4933408B17RikG3X9B4 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
4933408B17RikG3X9B4 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
4933408B17RikG3X9B4 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
4933408B17RikG3X9B4 Fam160b1-201ENSMUST00000036407 5630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
4933408B17RikG3X9B4 Ccdc91-201ENSMUST00000032441 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
4933408B17RikG3X9B4 Mag-207ENSMUST00000191081 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
4933408B17RikG3X9B4 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
4933408B17RikG3X9B4 Ddx59-201ENSMUST00000027655 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
4933408B17RikG3X9B4 Megf11-210ENSMUST00000164113 6018 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
4933408B17RikG3X9B4 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
4933408B17RikG3X9B4 Tmem198-201ENSMUST00000050899 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
4933408B17RikG3X9B4 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
4933408B17RikG3X9B4 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
4933408B17RikG3X9B4 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
4933408B17RikG3X9B4 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
4933408B17RikG3X9B4 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
4933408B17RikG3X9B4 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
4933408B17RikG3X9B4 Chd4-202ENSMUST00000112390 6537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
4933408B17RikG3X9B4 Phactr2-203ENSMUST00000105545 8556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
4933408B17RikG3X9B4 Itgb4-201ENSMUST00000021107 6014 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
4933408B17RikG3X9B4 Ankrd9-202ENSMUST00000128353 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
4933408B17RikG3X9B4 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
4933408B17RikG3X9B4 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
4933408B17RikG3X9B4 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
4933408B17RikG3X9B4 Gm11373-201ENSMUST00000129791 2819 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
4933408B17RikG3X9B4 Ptpdc1-201ENSMUST00000035824 4402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
4933408B17RikG3X9B4 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
4933408B17RikG3X9B4 Snph-203ENSMUST00000109875 4910 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
4933408B17RikG3X9B4 Ptch1-201ENSMUST00000021921 7725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
4933408B17RikG3X9B4 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
4933408B17RikG3X9B4 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
4933408B17RikG3X9B4 Mcl1-201ENSMUST00000037947 3418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
4933408B17RikG3X9B4 Arhgef19-201ENSMUST00000006618 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
4933408B17RikG3X9B4 Lamc1-201ENSMUST00000027752 7622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
4933408B17RikG3X9B4 Papola-203ENSMUST00000163473 2544 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
4933408B17RikG3X9B4 Ache-202ENSMUST00000085934 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
4933408B17RikG3X9B4 Parg-201ENSMUST00000022470 4413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
4933408B17RikG3X9B4 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
4933408B17RikG3X9B4 Il17re-203ENSMUST00000101065 1973 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
4933408B17RikG3X9B4 Nr3c2-203ENSMUST00000109912 5675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
4933408B17RikG3X9B4 Gm1043-204ENSMUST00000207866 4296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
4933408B17RikG3X9B4 Nr1h2-202ENSMUST00000107910 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
4933408B17RikG3X9B4 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
4933408B17RikG3X9B4 Shank1-201ENSMUST00000107934 6477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
4933408B17RikG3X9B4 Dync1li2-201ENSMUST00000041769 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
4933408B17RikG3X9B4 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
4933408B17RikG3X9B4 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
4933408B17RikG3X9B4 Cables1-201ENSMUST00000046948 3202 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
4933408B17RikG3X9B4 Tmem56-203ENSMUST00000128909 6696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
4933408B17RikG3X9B4 Scube3-201ENSMUST00000043503 6699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
4933408B17RikG3X9B4 Whrn-205ENSMUST00000095038 2665 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
4933408B17RikG3X9B4 Bmi1-201ENSMUST00000028071 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
4933408B17RikG3X9B4 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
4933408B17RikG3X9B4 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
4933408B17RikG3X9B4 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
4933408B17RikG3X9B4 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
4933408B17RikG3X9B4 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
4933408B17RikG3X9B4 Gm43702-201ENSMUST00000198772 2546 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
4933408B17RikG3X9B4 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
4933408B17RikG3X9B4 Ankhd1-214ENSMUST00000155329 8223 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
4933408B17RikG3X9B4 Cask-201ENSMUST00000033321 4057 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
4933408B17RikG3X9B4 Keap1-206ENSMUST00000216436 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
4933408B17RikG3X9B4 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
4933408B17RikG3X9B4 Anks1b-208ENSMUST00000182053 1649 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
4933408B17RikG3X9B4 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
4933408B17RikG3X9B4 Pik3r2-201ENSMUST00000034296 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
4933408B17RikG3X9B4 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.8 ms