Protein–RNA interactions for Protein: G3UVU6

Gm20517, Mediator of RNA polymerase II transcription subunit 20, mousemouse

Predictions only

Length 152 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm20517G3UVU6 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gm20517G3UVU6 Kbtbd13-201ENSMUST00000068307 2969 ntAPPRIS P1 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gm20517G3UVU6 Pfn2-201ENSMUST00000066882 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gm20517G3UVU6 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gm20517G3UVU6 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gm20517G3UVU6 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gm20517G3UVU6 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gm20517G3UVU6 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gm20517G3UVU6 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gm20517G3UVU6 Ecel1-204ENSMUST00000161002 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gm20517G3UVU6 G3bp2-202ENSMUST00000164378 3026 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gm20517G3UVU6 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gm20517G3UVU6 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gm20517G3UVU6 Kdm2a-202ENSMUST00000075856 7242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gm20517G3UVU6 Csnk1g3-201ENSMUST00000069597 4394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gm20517G3UVU6 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gm20517G3UVU6 Col11a2-203ENSMUST00000114255 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gm20517G3UVU6 Trim68-201ENSMUST00000082175 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gm20517G3UVU6 Dynll2-202ENSMUST00000107923 2443 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gm20517G3UVU6 Spdef-202ENSMUST00000114870 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gm20517G3UVU6 Gm16754-201ENSMUST00000181222 2077 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gm20517G3UVU6 Etnk1-204ENSMUST00000205256 2647 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gm20517G3UVU6 4930426D05Rik-202ENSMUST00000139804 1650 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gm20517G3UVU6 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gm20517G3UVU6 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gm20517G3UVU6 Ankrd13a-201ENSMUST00000102578 3717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gm20517G3UVU6 Cul4a-201ENSMUST00000016680 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gm20517G3UVU6 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Gm20517G3UVU6 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gm20517G3UVU6 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gm20517G3UVU6 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Gm20517G3UVU6 Glrx2-210ENSMUST00000185362 3337 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gm20517G3UVU6 Bin2-204ENSMUST00000182775 1908 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gm20517G3UVU6 Gm15635-204ENSMUST00000208024 2539 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Gm20517G3UVU6 Nrl-201ENSMUST00000062232 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gm20517G3UVU6 Dtnb-222ENSMUST00000174479 3689 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gm20517G3UVU6 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gm20517G3UVU6 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gm20517G3UVU6 Eps8-201ENSMUST00000058210 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gm20517G3UVU6 Rnf157-201ENSMUST00000100202 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gm20517G3UVU6 Mroh5-201ENSMUST00000071419 2766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gm20517G3UVU6 5330438I03Rik-201ENSMUST00000168347 2845 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Gm20517G3UVU6 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gm20517G3UVU6 Iqsec2-203ENSMUST00000112605 6017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gm20517G3UVU6 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Gm20517G3UVU6 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Gm20517G3UVU6 Nuak1-201ENSMUST00000020220 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Gm20517G3UVU6 Fam149b-211ENSMUST00000224930 2716 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Gm20517G3UVU6 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Gm20517G3UVU6 Senp2-201ENSMUST00000023561 4499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Gm20517G3UVU6 Agfg2-201ENSMUST00000031736 2893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Gm20517G3UVU6 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Gm20517G3UVU6 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Gm20517G3UVU6 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Gm20517G3UVU6 Prkar2a-201ENSMUST00000035220 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Gm20517G3UVU6 Ptpra-201ENSMUST00000028769 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Gm20517G3UVU6 Cadm3-201ENSMUST00000005470 2518 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Gm20517G3UVU6 Clasp2-204ENSMUST00000213663 2727 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Gm20517G3UVU6 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Gm20517G3UVU6 Bcor-206ENSMUST00000124033 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Gm20517G3UVU6 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Gm20517G3UVU6 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Gm20517G3UVU6 Scly-201ENSMUST00000027532 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Gm20517G3UVU6 Kdm5b-203ENSMUST00000112198 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Gm20517G3UVU6 Chpt1-201ENSMUST00000020253 3898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Gm20517G3UVU6 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Gm20517G3UVU6 Zcchc6-207ENSMUST00000225576 2499 ntBASIC13.52□□□□□ -0.24
Gm20517G3UVU6 Cadps2-212ENSMUST00000163871 4969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.24
Gm20517G3UVU6 Shank1-203ENSMUST00000107938 9826 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.24
Gm20517G3UVU6 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Gm20517G3UVU6 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Gm20517G3UVU6 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Gm20517G3UVU6 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Gm20517G3UVU6 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Gm20517G3UVU6 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Gm20517G3UVU6 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Gm20517G3UVU6 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Gm20517G3UVU6 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Gm20517G3UVU6 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Gm20517G3UVU6 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Gm20517G3UVU6 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Gm20517G3UVU6 Igdcc3-201ENSMUST00000034961 3146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Gm20517G3UVU6 Mapk8ip1-201ENSMUST00000050312 2930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Gm20517G3UVU6 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Gm20517G3UVU6 Gdf5-201ENSMUST00000040162 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Gm20517G3UVU6 I0C0044D17Rik-201ENSMUST00000097964 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Gm20517G3UVU6 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Gm20517G3UVU6 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Gm20517G3UVU6 Tfap2a-208ENSMUST00000224999 2058 ntAPPRIS ALT1 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Gm20517G3UVU6 Zfp92-202ENSMUST00000086470 2050 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Gm20517G3UVU6 Gm26858-201ENSMUST00000180608 2040 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Gm20517G3UVU6 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Gm20517G3UVU6 Il17re-201ENSMUST00000053569 1898 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Gm20517G3UVU6 Fgf23-201ENSMUST00000000186 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Gm20517G3UVU6 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Gm20517G3UVU6 Fignl2-201ENSMUST00000178140 4206 ntAPPRIS P1 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Gm20517G3UVU6 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Gm20517G3UVU6 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Gm20517G3UVU6 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Gm20517G3UVU6 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.6 ms