Protein–RNA interactions for Protein: F8VQC1

Srp72, Signal recognition particle subunit SRP72, mousemouse

Predictions only

Length 671 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Srp72F8VQC1 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Srp72F8VQC1 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Srp72F8VQC1 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Srp72F8VQC1 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Srp72F8VQC1 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Srp72F8VQC1 Rasgrp1-201ENSMUST00000102534 5229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Srp72F8VQC1 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Srp72F8VQC1 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Srp72F8VQC1 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Srp72F8VQC1 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Srp72F8VQC1 Ube2k-201ENSMUST00000142407 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Srp72F8VQC1 Gm45906-201ENSMUST00000208911 1430 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
Srp72F8VQC1 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Srp72F8VQC1 Trpc4ap-202ENSMUST00000103140 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Srp72F8VQC1 Iqsec2-202ENSMUST00000112604 5967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Srp72F8VQC1 Tbc1d9-202ENSMUST00000093393 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Srp72F8VQC1 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Srp72F8VQC1 Gm26634-201ENSMUST00000181146 1511 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Srp72F8VQC1 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Srp72F8VQC1 Sqstm1-201ENSMUST00000015981 2673 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Srp72F8VQC1 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Srp72F8VQC1 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Srp72F8VQC1 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Srp72F8VQC1 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Srp72F8VQC1 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Srp72F8VQC1 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Srp72F8VQC1 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Srp72F8VQC1 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
Srp72F8VQC1 Aldh5a1-201ENSMUST00000037615 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Srp72F8VQC1 Mtcl1-201ENSMUST00000086693 7221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Srp72F8VQC1 Ache-202ENSMUST00000085934 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Srp72F8VQC1 1600012H06Rik-201ENSMUST00000052691 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Srp72F8VQC1 Plekhf2-201ENSMUST00000054776 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Srp72F8VQC1 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Srp72F8VQC1 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Srp72F8VQC1 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Srp72F8VQC1 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Srp72F8VQC1 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Srp72F8VQC1 4930540M05Rik-201ENSMUST00000180527 2068 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Srp72F8VQC1 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Srp72F8VQC1 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Srp72F8VQC1 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Srp72F8VQC1 Hs6st1-201ENSMUST00000088174 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Srp72F8VQC1 Mink1-205ENSMUST00000102559 4865 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Srp72F8VQC1 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Srp72F8VQC1 Rnaseh2a-202ENSMUST00000109736 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Srp72F8VQC1 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Srp72F8VQC1 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Srp72F8VQC1 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Srp72F8VQC1 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Srp72F8VQC1 Arhgef9-208ENSMUST00000128565 2285 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Srp72F8VQC1 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Srp72F8VQC1 Large1-202ENSMUST00000119826 4647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Srp72F8VQC1 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Srp72F8VQC1 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Srp72F8VQC1 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Srp72F8VQC1 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Srp72F8VQC1 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Srp72F8VQC1 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Srp72F8VQC1 Gnao1-207ENSMUST00000138659 5526 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Srp72F8VQC1 Cpd-201ENSMUST00000021201 7946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Srp72F8VQC1 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Srp72F8VQC1 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Srp72F8VQC1 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Srp72F8VQC1 Htr6-202ENSMUST00000105802 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Srp72F8VQC1 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Srp72F8VQC1 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Srp72F8VQC1 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Srp72F8VQC1 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
Srp72F8VQC1 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Srp72F8VQC1 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
Srp72F8VQC1 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Srp72F8VQC1 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Srp72F8VQC1 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Srp72F8VQC1 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Srp72F8VQC1 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Srp72F8VQC1 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Srp72F8VQC1 Kbtbd13-201ENSMUST00000068307 2969 ntAPPRIS P1 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Srp72F8VQC1 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Srp72F8VQC1 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Srp72F8VQC1 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Srp72F8VQC1 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Srp72F8VQC1 Sbf1-205ENSMUST00000144585 6165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Srp72F8VQC1 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Srp72F8VQC1 Keap1-206ENSMUST00000216436 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Srp72F8VQC1 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Srp72F8VQC1 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Srp72F8VQC1 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Srp72F8VQC1 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Srp72F8VQC1 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Srp72F8VQC1 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
Srp72F8VQC1 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Srp72F8VQC1 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Srp72F8VQC1 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Srp72F8VQC1 Gm37811-201ENSMUST00000192416 2601 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
Srp72F8VQC1 Man1c1-202ENSMUST00000054096 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Srp72F8VQC1 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Srp72F8VQC1 Rraga-201ENSMUST00000091064 1618 ntAPPRIS P1 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Srp72F8VQC1 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Srp72F8VQC1 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.2 ms