Protein–RNA interactions for Protein: F8VPU6

Usp9y, Ubiquitin-specific peptidase 9, Y chromosome, mousemouse

Predictions only

Length 2,556 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp9yF8VPU6 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Usp9yF8VPU6 Kxd1-202ENSMUST00000117580 696 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Usp9yF8VPU6 Kctd14-202ENSMUST00000121987 1210 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Usp9yF8VPU6 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Usp9yF8VPU6 1700045H11Rik-201ENSMUST00000128056 593 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Usp9yF8VPU6 Znhit2-201ENSMUST00000162726 1281 ntAPPRIS P1 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Usp9yF8VPU6 Gm5864-201ENSMUST00000202263 970 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Usp9yF8VPU6 Olfr572-203ENSMUST00000215782 1233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Usp9yF8VPU6 Ndufa6-201ENSMUST00000023085 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Usp9yF8VPU6 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Usp9yF8VPU6 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Usp9yF8VPU6 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Usp9yF8VPU6 Anxa2-201ENSMUST00000034756 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Usp9yF8VPU6 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Usp9yF8VPU6 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Usp9yF8VPU6 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Usp9yF8VPU6 Slc25a39-202ENSMUST00000107098 1606 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Usp9yF8VPU6 Cd164l2-201ENSMUST00000105910 986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Usp9yF8VPU6 Gm11927-201ENSMUST00000118472 759 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Usp9yF8VPU6 Hnrnph3-203ENSMUST00000119814 682 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Usp9yF8VPU6 Zfp133-ps-202ENSMUST00000124788 1079 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Usp9yF8VPU6 Ino80dos-204ENSMUST00000188602 678 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Usp9yF8VPU6 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Usp9yF8VPU6 Efcab11-207ENSMUST00000223114 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Usp9yF8VPU6 Bcl7b-203ENSMUST00000111188 1434 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Usp9yF8VPU6 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Usp9yF8VPU6 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Usp9yF8VPU6 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Usp9yF8VPU6 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Usp9yF8VPU6 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Usp9yF8VPU6 Rps27a-202ENSMUST00000102845 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Usp9yF8VPU6 Ndufb8-201ENSMUST00000026222 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Usp9yF8VPU6 Izumo2-201ENSMUST00000085422 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Usp9yF8VPU6 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Usp9yF8VPU6 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Usp9yF8VPU6 Gm19569-202ENSMUST00000184658 1305 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Usp9yF8VPU6 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Usp9yF8VPU6 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Usp9yF8VPU6 Dnajc24-201ENSMUST00000102555 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Usp9yF8VPU6 Gm15492-201ENSMUST00000156734 606 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Usp9yF8VPU6 Gm19391-201ENSMUST00000196653 999 ntTSL 3 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Usp9yF8VPU6 Taar2-201ENSMUST00000079134 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Usp9yF8VPU6 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Usp9yF8VPU6 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Usp9yF8VPU6 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Usp9yF8VPU6 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Usp9yF8VPU6 Tomm6-202ENSMUST00000113302 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Usp9yF8VPU6 Gm26938-201ENSMUST00000182839 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Usp9yF8VPU6 Gm37292-201ENSMUST00000192062 758 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Usp9yF8VPU6 Rps2-ps2-201ENSMUST00000194305 881 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Usp9yF8VPU6 Kiss1r-202ENSMUST00000219745 979 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Usp9yF8VPU6 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Usp9yF8VPU6 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Usp9yF8VPU6 1700096K18Rik-201ENSMUST00000188465 1454 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Usp9yF8VPU6 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Usp9yF8VPU6 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Usp9yF8VPU6 Crtap-201ENSMUST00000084881 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Usp9yF8VPU6 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Usp9yF8VPU6 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Usp9yF8VPU6 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Usp9yF8VPU6 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Usp9yF8VPU6 Tpm2-203ENSMUST00000107914 1164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Usp9yF8VPU6 Gm12536-201ENSMUST00000129102 358 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Usp9yF8VPU6 Mir3081-201ENSMUST00000175305 84 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Usp9yF8VPU6 Gm27463-201ENSMUST00000183569 57 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Usp9yF8VPU6 Gm29518-201ENSMUST00000190858 372 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Usp9yF8VPU6 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Usp9yF8VPU6 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Usp9yF8VPU6 2010016I18Rik-204ENSMUST00000190356 1562 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Usp9yF8VPU6 Pdlim5-211ENSMUST00000198381 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Usp9yF8VPU6 Agbl4-205ENSMUST00000106591 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Usp9yF8VPU6 Gm28050-201ENSMUST00000124394 449 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Usp9yF8VPU6 Mcub-204ENSMUST00000153506 1005 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Usp9yF8VPU6 Tnnt2-205ENSMUST00000178204 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Usp9yF8VPU6 Tnnt2-207ENSMUST00000179863 1097 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Usp9yF8VPU6 Gm26756-201ENSMUST00000181689 1294 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Usp9yF8VPU6 Tnnt2-209ENSMUST00000188028 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Usp9yF8VPU6 Pagr1a-203ENSMUST00000206416 558 ntTSL 3 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Usp9yF8VPU6 Krtap1-5-201ENSMUST00000054532 1041 ntAPPRIS P1 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Usp9yF8VPU6 S100a16-202ENSMUST00000098911 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Usp9yF8VPU6 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Usp9yF8VPU6 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Usp9yF8VPU6 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Usp9yF8VPU6 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Usp9yF8VPU6 Gm10518-201ENSMUST00000097454 1301 ntAPPRIS P1 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Usp9yF8VPU6 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Usp9yF8VPU6 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Usp9yF8VPU6 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Usp9yF8VPU6 Gm18733-201ENSMUST00000173950 856 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Usp9yF8VPU6 Prr3-209ENSMUST00000174849 581 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Usp9yF8VPU6 Anapc13-203ENSMUST00000188398 727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Usp9yF8VPU6 AC159093.1-201ENSMUST00000227779 380 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Usp9yF8VPU6 Gaa-202ENSMUST00000106258 1369 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Usp9yF8VPU6 Pdgfa-203ENSMUST00000110896 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Usp9yF8VPU6 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Usp9yF8VPU6 Fam149b-216ENSMUST00000225942 2151 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Usp9yF8VPU6 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Usp9yF8VPU6 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Usp9yF8VPU6 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Usp9yF8VPU6 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
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