Protein–RNA interactions for Protein: F6Z9R1

Gm20538, Predicted gene 20538 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 75 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm20538F6Z9R1 Mvk-201ENSMUST00000043760 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.69□□□□□ -1.02
Gm20538F6Z9R1 Tgfa-201ENSMUST00000032066 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.69□□□□□ -1.02
Gm20538F6Z9R1 Man1a2-201ENSMUST00000008907 7969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.69□□□□□ -1.02
Gm20538F6Z9R1 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC8.69□□□□□ -1.02
Gm20538F6Z9R1 Runx1-201ENSMUST00000023673 5861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.69□□□□□ -1.02
Gm20538F6Z9R1 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.69□□□□□ -1.02
Gm20538F6Z9R1 Hoxd3-203ENSMUST00000111983 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.69□□□□□ -1.02
Gm20538F6Z9R1 Bsx-201ENSMUST00000067375 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.69□□□□□ -1.02
Gm20538F6Z9R1 Fam53b-203ENSMUST00000097999 5465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.69□□□□□ -1.02
Gm20538F6Z9R1 Ccdc32-201ENSMUST00000036470 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.69□□□□□ -1.02
Gm20538F6Z9R1 Nanos1-201ENSMUST00000088237 3927 ntAPPRIS P1 BASIC8.69□□□□□ -1.02
Gm20538F6Z9R1 Id2-202ENSMUST00000221761 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.69□□□□□ -1.02
Gm20538F6Z9R1 Tbxas1-201ENSMUST00000003017 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.69□□□□□ -1.02
Gm20538F6Z9R1 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.69□□□□□ -1.02
Gm20538F6Z9R1 Cwh43-201ENSMUST00000031040 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.69□□□□□ -1.02
Gm20538F6Z9R1 Coro6-204ENSMUST00000102493 2804 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC8.69□□□□□ -1.02
Gm20538F6Z9R1 Gm15567-201ENSMUST00000148699 2130 ntTSL 1 (best) BASIC8.69□□□□□ -1.02
Gm20538F6Z9R1 Plpp6-201ENSMUST00000045674 2859 ntAPPRIS P1 BASIC8.69□□□□□ -1.02
Gm20538F6Z9R1 Sfrp1-201ENSMUST00000033952 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.69□□□□□ -1.02
Gm20538F6Z9R1 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC8.69□□□□□ -1.02
Gm20538F6Z9R1 Tmem198b-201ENSMUST00000051011 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.69□□□□□ -1.02
Gm20538F6Z9R1 Nfatc2-205ENSMUST00000137451 2369 ntTSL 1 (best) BASIC8.69□□□□□ -1.02
Gm20538F6Z9R1 Sall2-202ENSMUST00000135523 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.69□□□□□ -1.02
Gm20538F6Z9R1 Atp13a3-201ENSMUST00000061350 7220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.69□□□□□ -1.02
Gm20538F6Z9R1 Sec1-201ENSMUST00000040636 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.69□□□□□ -1.02
Gm20538F6Z9R1 Col6a3-208ENSMUST00000188587 8285 ntTSL 5 BASIC8.69□□□□□ -1.02
Gm20538F6Z9R1 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.69□□□□□ -1.02
Gm20538F6Z9R1 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.69□□□□□ -1.02
Gm20538F6Z9R1 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.68□□□□□ -1.02
Gm20538F6Z9R1 Wasf1-202ENSMUST00000105509 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.68□□□□□ -1.02
Gm20538F6Z9R1 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.68□□□□□ -1.02
Gm20538F6Z9R1 Sema6b-201ENSMUST00000001256 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.68□□□□□ -1.02
Gm20538F6Z9R1 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.68□□□□□ -1.02
Gm20538F6Z9R1 Nabp1-201ENSMUST00000027279 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.68□□□□□ -1.02
Gm20538F6Z9R1 Olfr718-ps1-203ENSMUST00000215102 4913 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC8.68□□□□□ -1.02
Gm20538F6Z9R1 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC8.68□□□□□ -1.02
Gm20538F6Z9R1 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.68□□□□□ -1.02
Gm20538F6Z9R1 Ggn-205ENSMUST00000209019 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.68□□□□□ -1.02
Gm20538F6Z9R1 Nfix-203ENSMUST00000109762 2261 ntTSL 1 (best) BASIC8.68□□□□□ -1.02
Gm20538F6Z9R1 Sdc4-201ENSMUST00000017153 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.68□□□□□ -1.02
Gm20538F6Z9R1 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.68□□□□□ -1.02
Gm20538F6Z9R1 Pcnx-201ENSMUST00000021567 12139 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC8.68□□□□□ -1.02
Gm20538F6Z9R1 Lad1-201ENSMUST00000038760 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.68□□□□□ -1.02
Gm20538F6Z9R1 Camsap3-201ENSMUST00000057028 4450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.68□□□□□ -1.02
Gm20538F6Z9R1 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC8.68□□□□□ -1.02
Gm20538F6Z9R1 Rgl1-201ENSMUST00000027760 4572 ntTSL 1 (best) BASIC8.68□□□□□ -1.02
Gm20538F6Z9R1 Nid2-201ENSMUST00000022340 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.68□□□□□ -1.02
Gm20538F6Z9R1 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC8.68□□□□□ -1.02
Gm20538F6Z9R1 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC8.68□□□□□ -1.02
Gm20538F6Z9R1 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.68□□□□□ -1.02
Gm20538F6Z9R1 Prx-203ENSMUST00000108355 5433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.68□□□□□ -1.02
Gm20538F6Z9R1 Uso1-204ENSMUST00000202155 3707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.68□□□□□ -1.02
Gm20538F6Z9R1 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC8.68□□□□□ -1.02
Gm20538F6Z9R1 Gng2-204ENSMUST00000160013 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.68□□□□□ -1.02
Gm20538F6Z9R1 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.68□□□□□ -1.02
Gm20538F6Z9R1 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.68□□□□□ -1.02
Gm20538F6Z9R1 Gdf3-201ENSMUST00000032211 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.68□□□□□ -1.02
Gm20538F6Z9R1 Grb7-201ENSMUST00000019456 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.68□□□□□ -1.02
Gm20538F6Z9R1 Kat2b-ps-201ENSMUST00000128468 2490 ntBASIC8.68□□□□□ -1.02
Gm20538F6Z9R1 Phactr3-202ENSMUST00000103066 2680 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC8.67□□□□□ -1.02
Gm20538F6Z9R1 Myo18b-201ENSMUST00000086617 8280 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.67□□□□□ -1.02
Gm20538F6Z9R1 Rgs7bp-201ENSMUST00000063551 7077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.67□□□□□ -1.02
Gm20538F6Z9R1 Rnf146-202ENSMUST00000160144 4323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.67□□□□□ -1.02
Gm20538F6Z9R1 Syt6-201ENSMUST00000090697 4416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.67□□□□□ -1.02
Gm20538F6Z9R1 Gm26702-201ENSMUST00000181730 4570 ntTSL 5 BASIC8.67□□□□□ -1.02
Gm20538F6Z9R1 Kirrel-203ENSMUST00000159976 7236 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.67□□□□□ -1.02
Gm20538F6Z9R1 Dhx32-203ENSMUST00000106139 2233 ntTSL 1 (best) BASIC8.67□□□□□ -1.02
Gm20538F6Z9R1 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.67□□□□□ -1.02
Gm20538F6Z9R1 Irf8-205ENSMUST00000162001 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.67□□□□□ -1.02
Gm20538F6Z9R1 Anks1b-231ENSMUST00000183136 2786 ntTSL 5 BASIC8.67□□□□□ -1.02
Gm20538F6Z9R1 Smarcc1-204ENSMUST00000197984 3538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.67□□□□□ -1.02
Gm20538F6Z9R1 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC8.67□□□□□ -1.02
Gm20538F6Z9R1 Gpnmb-203ENSMUST00000204260 2430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.67□□□□□ -1.02
Gm20538F6Z9R1 Irgc1-204ENSMUST00000205776 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.67□□□□□ -1.02
Gm20538F6Z9R1 Fam20a-201ENSMUST00000020938 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.67□□□□□ -1.02
Gm20538F6Z9R1 Csrnp1-203ENSMUST00000214058 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.67□□□□□ -1.02
Gm20538F6Z9R1 Gm34376-201ENSMUST00000218529 2107 ntTSL 5 BASIC8.67□□□□□ -1.02
Gm20538F6Z9R1 Psip1-201ENSMUST00000030207 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.67□□□□□ -1.02
Gm20538F6Z9R1 Mpzl2-201ENSMUST00000034600 3107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.67□□□□□ -1.02
Gm20538F6Z9R1 Pomt2-201ENSMUST00000037788 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.67□□□□□ -1.02
Gm20538F6Z9R1 Gm5422-201ENSMUST00000050717 2721 ntBASIC8.67□□□□□ -1.02
Gm20538F6Z9R1 Synrg-201ENSMUST00000049714 3995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.67□□□□□ -1.02
Gm20538F6Z9R1 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.67□□□□□ -1.02
Gm20538F6Z9R1 Fam174a-202ENSMUST00000186780 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.67□□□□□ -1.02
Gm20538F6Z9R1 Tnfaip2-202ENSMUST00000109792 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.67□□□□□ -1.02
Gm20538F6Z9R1 Arhgap35-202ENSMUST00000171937 6251 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.67□□□□□ -1.02
Gm20538F6Z9R1 Phtf1-201ENSMUST00000055425 3060 ntTSL 1 (best) BASIC8.67□□□□□ -1.02
Gm20538F6Z9R1 Marveld1-201ENSMUST00000061111 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.67□□□□□ -1.02
Gm20538F6Z9R1 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.67□□□□□ -1.02
Gm20538F6Z9R1 Tepsin-203ENSMUST00000106225 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.67□□□□□ -1.02
Gm20538F6Z9R1 D16Ertd472e-203ENSMUST00000114220 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.66□□□□□ -1.02
Gm20538F6Z9R1 Nap1l4-209ENSMUST00000209098 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.66□□□□□ -1.02
Gm20538F6Z9R1 Scly-201ENSMUST00000027532 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.66□□□□□ -1.02
Gm20538F6Z9R1 Camta1-201ENSMUST00000049790 8423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC8.66□□□□□ -1.02
Gm20538F6Z9R1 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.66□□□□□ -1.02
Gm20538F6Z9R1 Kat5-201ENSMUST00000113641 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.66□□□□□ -1.02
Gm20538F6Z9R1 Cds2-201ENSMUST00000089461 8073 ntTSL 1 (best) BASIC8.66□□□□□ -1.02
Gm20538F6Z9R1 Dolpp1-202ENSMUST00000113612 1958 ntTSL 3 BASIC8.66□□□□□ -1.02
Gm20538F6Z9R1 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.66□□□□□ -1.02
Gm20538F6Z9R1 Cacna2d1-202ENSMUST00000078272 7311 ntTSL 1 (best) BASIC8.66□□□□□ -1.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.3 ms