Protein–RNA interactions for Protein: F6RGI3

Gm340, Predicted gene 340, mousemouse

Predictions only

Length 1,242 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm340F6RGI3 Cpd-201ENSMUST00000021201 7946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Gm340F6RGI3 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Gm340F6RGI3 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Gm340F6RGI3 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Gm340F6RGI3 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Gm340F6RGI3 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Gm340F6RGI3 Mtcl1-201ENSMUST00000086693 7221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Gm340F6RGI3 Hspa5-202ENSMUST00000100171 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Gm340F6RGI3 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Gm340F6RGI3 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Gm340F6RGI3 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Gm340F6RGI3 Sqstm1-201ENSMUST00000015981 2673 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Gm340F6RGI3 Coq8b-202ENSMUST00000108378 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Gm340F6RGI3 Adgra2-201ENSMUST00000033876 5760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Gm340F6RGI3 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Gm340F6RGI3 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Gm340F6RGI3 Gm11532-201ENSMUST00000128111 5272 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Gm340F6RGI3 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Gm340F6RGI3 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
Gm340F6RGI3 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Gm340F6RGI3 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Gm340F6RGI3 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
Gm340F6RGI3 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Gm340F6RGI3 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Gm340F6RGI3 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Gm340F6RGI3 Mzt1-201ENSMUST00000042662 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Gm340F6RGI3 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Gm340F6RGI3 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Gm340F6RGI3 Rbm24-201ENSMUST00000037923 3086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Gm340F6RGI3 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Gm340F6RGI3 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
Gm340F6RGI3 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
Gm340F6RGI3 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
Gm340F6RGI3 Myh7b-201ENSMUST00000092995 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Gm340F6RGI3 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Gm340F6RGI3 Hoxd4-201ENSMUST00000047904 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Gm340F6RGI3 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
Gm340F6RGI3 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Gm340F6RGI3 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Gm340F6RGI3 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Gm340F6RGI3 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
Gm340F6RGI3 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Gm340F6RGI3 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Gm340F6RGI3 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Gm340F6RGI3 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Gm340F6RGI3 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Gm340F6RGI3 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Gm340F6RGI3 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Gm340F6RGI3 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Gm340F6RGI3 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Gm340F6RGI3 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Gm340F6RGI3 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Gm340F6RGI3 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
Gm340F6RGI3 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Gm340F6RGI3 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Gm340F6RGI3 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Gm340F6RGI3 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
Gm340F6RGI3 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Gm340F6RGI3 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Gm340F6RGI3 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Gm340F6RGI3 Ccser1-203ENSMUST00000126214 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Gm340F6RGI3 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Gm340F6RGI3 Gm43548-201ENSMUST00000197139 2353 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
Gm340F6RGI3 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Gm340F6RGI3 Picalm-206ENSMUST00000207484 8209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Gm340F6RGI3 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Gm340F6RGI3 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Gm340F6RGI3 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Gm340F6RGI3 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Gm340F6RGI3 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Gm340F6RGI3 Gm26798-201ENSMUST00000181384 2837 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Gm340F6RGI3 Mta1-201ENSMUST00000009099 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Gm340F6RGI3 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Gm340F6RGI3 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Gm340F6RGI3 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Gm340F6RGI3 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Gm340F6RGI3 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Gm340F6RGI3 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Gm340F6RGI3 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Gm340F6RGI3 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Gm340F6RGI3 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Gm340F6RGI3 Farp1-201ENSMUST00000026635 4885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Gm340F6RGI3 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Gm340F6RGI3 Csnk1a1-206ENSMUST00000165721 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Gm340F6RGI3 Gm44832-201ENSMUST00000208849 2303 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
Gm340F6RGI3 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Gm340F6RGI3 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Gm340F6RGI3 Zranb2-203ENSMUST00000106058 2924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Gm340F6RGI3 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Gm340F6RGI3 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Gm340F6RGI3 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Gm340F6RGI3 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Gm340F6RGI3 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Gm340F6RGI3 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Gm340F6RGI3 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Gm340F6RGI3 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Gm340F6RGI3 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Gm340F6RGI3 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Gm340F6RGI3 AC154231.1-201ENSMUST00000220564 2175 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
Gm340F6RGI3 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43 ms