Protein–RNA interactions for Protein: E9Q9Y3

Ccdc7b, Coiled-coil domain-containing 7B, mousemouse

Predictions only

Length 381 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc7bE9Q9Y3 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ccdc7bE9Q9Y3 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ccdc7bE9Q9Y3 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ccdc7bE9Q9Y3 Sulf2-201ENSMUST00000088086 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ccdc7bE9Q9Y3 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
Ccdc7bE9Q9Y3 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ccdc7bE9Q9Y3 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ccdc7bE9Q9Y3 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ccdc7bE9Q9Y3 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ccdc7bE9Q9Y3 Ntn1-202ENSMUST00000108674 5874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ccdc7bE9Q9Y3 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ccdc7bE9Q9Y3 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ccdc7bE9Q9Y3 Tbc1d13-201ENSMUST00000044556 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ccdc7bE9Q9Y3 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ccdc7bE9Q9Y3 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ccdc7bE9Q9Y3 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ccdc7bE9Q9Y3 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ccdc7bE9Q9Y3 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ccdc7bE9Q9Y3 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ccdc7bE9Q9Y3 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ccdc7bE9Q9Y3 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ccdc7bE9Q9Y3 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ccdc7bE9Q9Y3 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ccdc7bE9Q9Y3 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ccdc7bE9Q9Y3 Smu1-201ENSMUST00000030117 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ccdc7bE9Q9Y3 Ube2k-201ENSMUST00000142407 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Ccdc7bE9Q9Y3 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Ccdc7bE9Q9Y3 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Ccdc7bE9Q9Y3 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Ccdc7bE9Q9Y3 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC17.08■□□□□ 0.33
Ccdc7bE9Q9Y3 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Ccdc7bE9Q9Y3 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Ccdc7bE9Q9Y3 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
Ccdc7bE9Q9Y3 Tbc1d9-202ENSMUST00000093393 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Ccdc7bE9Q9Y3 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Ccdc7bE9Q9Y3 Htr6-202ENSMUST00000105802 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Ccdc7bE9Q9Y3 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Ccdc7bE9Q9Y3 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Ccdc7bE9Q9Y3 Mag-207ENSMUST00000191081 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Ccdc7bE9Q9Y3 Fbxl3-201ENSMUST00000022720 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ccdc7bE9Q9Y3 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ccdc7bE9Q9Y3 Rybp-201ENSMUST00000101118 4503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ccdc7bE9Q9Y3 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ccdc7bE9Q9Y3 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ccdc7bE9Q9Y3 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ccdc7bE9Q9Y3 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Ccdc7bE9Q9Y3 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ccdc7bE9Q9Y3 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ccdc7bE9Q9Y3 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ccdc7bE9Q9Y3 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ccdc7bE9Q9Y3 Edem1-201ENSMUST00000089162 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ccdc7bE9Q9Y3 Tmem151b-201ENSMUST00000180252 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ccdc7bE9Q9Y3 Exoc3l2-202ENSMUST00000137613 4016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ccdc7bE9Q9Y3 Tmem214-202ENSMUST00000201203 6110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ccdc7bE9Q9Y3 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ccdc7bE9Q9Y3 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ccdc7bE9Q9Y3 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ccdc7bE9Q9Y3 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ccdc7bE9Q9Y3 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ccdc7bE9Q9Y3 Vmn1r17-201ENSMUST00000227186 2234 ntAPPRIS P2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ccdc7bE9Q9Y3 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ccdc7bE9Q9Y3 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
Ccdc7bE9Q9Y3 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ccdc7bE9Q9Y3 Gm43042-201ENSMUST00000198676 1820 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ccdc7bE9Q9Y3 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ccdc7bE9Q9Y3 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ccdc7bE9Q9Y3 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ccdc7bE9Q9Y3 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ccdc7bE9Q9Y3 Ccdc149-201ENSMUST00000059428 3295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ccdc7bE9Q9Y3 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ccdc7bE9Q9Y3 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ccdc7bE9Q9Y3 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ccdc7bE9Q9Y3 A730060N03Rik-201ENSMUST00000174277 2124 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ccdc7bE9Q9Y3 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ccdc7bE9Q9Y3 Anks1b-208ENSMUST00000182053 1649 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ccdc7bE9Q9Y3 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ccdc7bE9Q9Y3 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ccdc7bE9Q9Y3 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ccdc7bE9Q9Y3 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
Ccdc7bE9Q9Y3 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ccdc7bE9Q9Y3 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ccdc7bE9Q9Y3 Mtcl1-201ENSMUST00000086693 7221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ccdc7bE9Q9Y3 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ccdc7bE9Q9Y3 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ccdc7bE9Q9Y3 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ccdc7bE9Q9Y3 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ccdc7bE9Q9Y3 Arih1-207ENSMUST00000171975 6971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ccdc7bE9Q9Y3 Gm37811-201ENSMUST00000192416 2601 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
Ccdc7bE9Q9Y3 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ccdc7bE9Q9Y3 Tacc3-203ENSMUST00000114426 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ccdc7bE9Q9Y3 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ccdc7bE9Q9Y3 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ccdc7bE9Q9Y3 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
Ccdc7bE9Q9Y3 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ccdc7bE9Q9Y3 9330171B17Rik-201ENSMUST00000035939 2073 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
Ccdc7bE9Q9Y3 Rnaseh2a-202ENSMUST00000109736 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ccdc7bE9Q9Y3 Arhgef9-208ENSMUST00000128565 2285 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ccdc7bE9Q9Y3 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ccdc7bE9Q9Y3 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ccdc7bE9Q9Y3 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.8 ms