Protein–RNA interactions for Protein: E9Q9R3

4930451I11Rik, RIKEN cDNA 4930451I11 gene, mousemouse

Predictions only

Length 111 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4930451I11RikE9Q9R3 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
4930451I11RikE9Q9R3 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
4930451I11RikE9Q9R3 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
4930451I11RikE9Q9R3 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
4930451I11RikE9Q9R3 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
4930451I11RikE9Q9R3 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
4930451I11RikE9Q9R3 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
4930451I11RikE9Q9R3 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
4930451I11RikE9Q9R3 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC17.03■□□□□ 0.32
4930451I11RikE9Q9R3 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
4930451I11RikE9Q9R3 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
4930451I11RikE9Q9R3 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
4930451I11RikE9Q9R3 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
4930451I11RikE9Q9R3 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
4930451I11RikE9Q9R3 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
4930451I11RikE9Q9R3 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
4930451I11RikE9Q9R3 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
4930451I11RikE9Q9R3 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
4930451I11RikE9Q9R3 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
4930451I11RikE9Q9R3 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
4930451I11RikE9Q9R3 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
4930451I11RikE9Q9R3 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
4930451I11RikE9Q9R3 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
4930451I11RikE9Q9R3 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC17.03■□□□□ 0.32
4930451I11RikE9Q9R3 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
4930451I11RikE9Q9R3 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
4930451I11RikE9Q9R3 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
4930451I11RikE9Q9R3 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
4930451I11RikE9Q9R3 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
4930451I11RikE9Q9R3 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
4930451I11RikE9Q9R3 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
4930451I11RikE9Q9R3 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
4930451I11RikE9Q9R3 Mrps10-203ENSMUST00000119945 1018 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
4930451I11RikE9Q9R3 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
4930451I11RikE9Q9R3 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
4930451I11RikE9Q9R3 1700101I19Rik-202ENSMUST00000186712 510 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
4930451I11RikE9Q9R3 D130020L05Rik-202ENSMUST00000220889 769 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
4930451I11RikE9Q9R3 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
4930451I11RikE9Q9R3 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
4930451I11RikE9Q9R3 Arrb2-204ENSMUST00000102564 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
4930451I11RikE9Q9R3 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
4930451I11RikE9Q9R3 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
4930451I11RikE9Q9R3 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
4930451I11RikE9Q9R3 Crocc-211ENSMUST00000168157 6244 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
4930451I11RikE9Q9R3 Crocc-201ENSMUST00000040222 6248 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
4930451I11RikE9Q9R3 Ubr5-201ENSMUST00000110336 9242 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
4930451I11RikE9Q9R3 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
4930451I11RikE9Q9R3 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
4930451I11RikE9Q9R3 Caskin1-201ENSMUST00000024958 6172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
4930451I11RikE9Q9R3 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
4930451I11RikE9Q9R3 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
4930451I11RikE9Q9R3 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
4930451I11RikE9Q9R3 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
4930451I11RikE9Q9R3 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC17.01■□□□□ 0.31
4930451I11RikE9Q9R3 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
4930451I11RikE9Q9R3 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC17.01■□□□□ 0.31
4930451I11RikE9Q9R3 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
4930451I11RikE9Q9R3 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
4930451I11RikE9Q9R3 Hist1h4c-201ENSMUST00000102967 820 ntAPPRIS P1 BASIC17■□□□□ 0.31
4930451I11RikE9Q9R3 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
4930451I11RikE9Q9R3 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
4930451I11RikE9Q9R3 Gm37856-201ENSMUST00000191634 999 ntBASIC17■□□□□ 0.31
4930451I11RikE9Q9R3 Cck-204ENSMUST00000216138 799 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
4930451I11RikE9Q9R3 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
4930451I11RikE9Q9R3 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
4930451I11RikE9Q9R3 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
4930451I11RikE9Q9R3 Map4k5-203ENSMUST00000110570 4498 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
4930451I11RikE9Q9R3 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
4930451I11RikE9Q9R3 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
4930451I11RikE9Q9R3 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
4930451I11RikE9Q9R3 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
4930451I11RikE9Q9R3 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
4930451I11RikE9Q9R3 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
4930451I11RikE9Q9R3 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
4930451I11RikE9Q9R3 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
4930451I11RikE9Q9R3 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
4930451I11RikE9Q9R3 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
4930451I11RikE9Q9R3 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
4930451I11RikE9Q9R3 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
4930451I11RikE9Q9R3 Rps6ka2-201ENSMUST00000024575 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
4930451I11RikE9Q9R3 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
4930451I11RikE9Q9R3 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
4930451I11RikE9Q9R3 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
4930451I11RikE9Q9R3 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
4930451I11RikE9Q9R3 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
4930451I11RikE9Q9R3 AC135637.1-201ENSMUST00000227750 365 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
4930451I11RikE9Q9R3 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
4930451I11RikE9Q9R3 Fbxo47-201ENSMUST00000093939 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
4930451I11RikE9Q9R3 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
4930451I11RikE9Q9R3 Ank1-207ENSMUST00000118733 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
4930451I11RikE9Q9R3 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
4930451I11RikE9Q9R3 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
4930451I11RikE9Q9R3 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
4930451I11RikE9Q9R3 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
4930451I11RikE9Q9R3 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
4930451I11RikE9Q9R3 Nsfl1c-203ENSMUST00000103160 1369 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
4930451I11RikE9Q9R3 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
4930451I11RikE9Q9R3 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
4930451I11RikE9Q9R3 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
4930451I11RikE9Q9R3 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.7 ms