Protein–RNA interactions for Protein: E9Q9N3

Vmn1r152, Vomeronasal type-1 receptor, mousemouse

Predictions only

Length 307 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn1r152E9Q9N3 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Vmn1r152E9Q9N3 Zc3h15-201ENSMUST00000081591 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Vmn1r152E9Q9N3 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Vmn1r152E9Q9N3 Mboat1-201ENSMUST00000047311 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Vmn1r152E9Q9N3 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Vmn1r152E9Q9N3 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Vmn1r152E9Q9N3 Man1c1-201ENSMUST00000038628 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Vmn1r152E9Q9N3 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Vmn1r152E9Q9N3 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Vmn1r152E9Q9N3 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Vmn1r152E9Q9N3 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Vmn1r152E9Q9N3 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Vmn1r152E9Q9N3 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Vmn1r152E9Q9N3 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Vmn1r152E9Q9N3 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Vmn1r152E9Q9N3 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Vmn1r152E9Q9N3 Arhgef9-208ENSMUST00000128565 2285 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Vmn1r152E9Q9N3 Bin2-204ENSMUST00000182775 1908 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Vmn1r152E9Q9N3 Crocc-211ENSMUST00000168157 6244 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Vmn1r152E9Q9N3 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Vmn1r152E9Q9N3 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Vmn1r152E9Q9N3 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Vmn1r152E9Q9N3 Dixdc1-207ENSMUST00000121634 2420 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Vmn1r152E9Q9N3 Trpc4ap-202ENSMUST00000103140 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Vmn1r152E9Q9N3 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Vmn1r152E9Q9N3 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Vmn1r152E9Q9N3 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Vmn1r152E9Q9N3 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Vmn1r152E9Q9N3 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Vmn1r152E9Q9N3 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Vmn1r152E9Q9N3 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Vmn1r152E9Q9N3 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Vmn1r152E9Q9N3 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Vmn1r152E9Q9N3 Zfp282-201ENSMUST00000061890 5573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Vmn1r152E9Q9N3 Keap1-206ENSMUST00000216436 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Vmn1r152E9Q9N3 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Vmn1r152E9Q9N3 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Vmn1r152E9Q9N3 B3gat2-202ENSMUST00000140583 1737 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Vmn1r152E9Q9N3 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Vmn1r152E9Q9N3 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Vmn1r152E9Q9N3 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Vmn1r152E9Q9N3 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Vmn1r152E9Q9N3 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Vmn1r152E9Q9N3 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Vmn1r152E9Q9N3 Gm5828-201ENSMUST00000071842 1860 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Vmn1r152E9Q9N3 Zfp804a-201ENSMUST00000047527 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Vmn1r152E9Q9N3 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Vmn1r152E9Q9N3 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Vmn1r152E9Q9N3 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Vmn1r152E9Q9N3 Cdk19-201ENSMUST00000044672 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Vmn1r152E9Q9N3 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Vmn1r152E9Q9N3 Ano10-206ENSMUST00000216670 2108 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Vmn1r152E9Q9N3 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Vmn1r152E9Q9N3 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Vmn1r152E9Q9N3 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Vmn1r152E9Q9N3 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Vmn1r152E9Q9N3 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Vmn1r152E9Q9N3 Atp6v0a2-201ENSMUST00000037865 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Vmn1r152E9Q9N3 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Vmn1r152E9Q9N3 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Vmn1r152E9Q9N3 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Vmn1r152E9Q9N3 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Vmn1r152E9Q9N3 Zfp219-204ENSMUST00000226522 2804 ntAPPRIS P2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Vmn1r152E9Q9N3 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Vmn1r152E9Q9N3 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Vmn1r152E9Q9N3 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Vmn1r152E9Q9N3 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Vmn1r152E9Q9N3 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Vmn1r152E9Q9N3 Slc25a47-202ENSMUST00000221080 1890 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Vmn1r152E9Q9N3 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Vmn1r152E9Q9N3 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Vmn1r152E9Q9N3 Egln2-202ENSMUST00000108382 1756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Vmn1r152E9Q9N3 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Vmn1r152E9Q9N3 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Vmn1r152E9Q9N3 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Vmn1r152E9Q9N3 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Vmn1r152E9Q9N3 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Vmn1r152E9Q9N3 Tpd52l1-201ENSMUST00000000305 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Vmn1r152E9Q9N3 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Vmn1r152E9Q9N3 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Vmn1r152E9Q9N3 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Vmn1r152E9Q9N3 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Vmn1r152E9Q9N3 AC122335.2-201ENSMUST00000213901 6181 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Vmn1r152E9Q9N3 Gm10461-201ENSMUST00000202073 4786 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Vmn1r152E9Q9N3 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Vmn1r152E9Q9N3 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Vmn1r152E9Q9N3 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Vmn1r152E9Q9N3 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Vmn1r152E9Q9N3 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Vmn1r152E9Q9N3 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Vmn1r152E9Q9N3 Elof1-204ENSMUST00000214394 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Vmn1r152E9Q9N3 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Vmn1r152E9Q9N3 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Vmn1r152E9Q9N3 Tgds-204ENSMUST00000228543 1594 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Vmn1r152E9Q9N3 Zscan12-201ENSMUST00000053293 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Vmn1r152E9Q9N3 Efnb2-201ENSMUST00000001319 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Vmn1r152E9Q9N3 Abhd5-202ENSMUST00000111497 2576 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Vmn1r152E9Q9N3 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Vmn1r152E9Q9N3 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Vmn1r152E9Q9N3 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.5 ms