Protein–RNA interactions for Protein: E9Q612

Ptpro, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase O, mousemouse

Predictions only

Length 1,226 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtproE9Q612 Uchl1-201ENSMUST00000031131 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
PtproE9Q612 Lat-201ENSMUST00000032997 1235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
PtproE9Q612 Bax-201ENSMUST00000033093 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
PtproE9Q612 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
PtproE9Q612 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
PtproE9Q612 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC19.51■□□□□ 0.71
PtproE9Q612 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
PtproE9Q612 K230015D01Rik-201ENSMUST00000211969 1516 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
PtproE9Q612 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
PtproE9Q612 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
PtproE9Q612 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
PtproE9Q612 Clta-203ENSMUST00000107847 1121 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
PtproE9Q612 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
PtproE9Q612 Gabarapl1-202ENSMUST00000204487 902 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
PtproE9Q612 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
PtproE9Q612 Trappc6a-201ENSMUST00000002112 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
PtproE9Q612 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
PtproE9Q612 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
PtproE9Q612 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
PtproE9Q612 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
PtproE9Q612 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
PtproE9Q612 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
PtproE9Q612 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
PtproE9Q612 Wnk2-205ENSMUST00000110097 6882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
PtproE9Q612 Wnk2-203ENSMUST00000091623 6897 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
PtproE9Q612 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
PtproE9Q612 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
PtproE9Q612 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
PtproE9Q612 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
PtproE9Q612 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
PtproE9Q612 Tekt1-203ENSMUST00000108503 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
PtproE9Q612 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
PtproE9Q612 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
PtproE9Q612 Fev-202ENSMUST00000159232 928 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
PtproE9Q612 Calml4-206ENSMUST00000215870 803 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
PtproE9Q612 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
PtproE9Q612 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
PtproE9Q612 Aqp2-201ENSMUST00000023752 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
PtproE9Q612 4930461C15Rik-201ENSMUST00000133622 1302 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
PtproE9Q612 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
PtproE9Q612 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
PtproE9Q612 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
PtproE9Q612 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
PtproE9Q612 4732471J01Rik-202ENSMUST00000205787 991 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
PtproE9Q612 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
PtproE9Q612 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
PtproE9Q612 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
PtproE9Q612 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
PtproE9Q612 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
PtproE9Q612 Tspan4-201ENSMUST00000026585 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
PtproE9Q612 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
PtproE9Q612 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
PtproE9Q612 Cisd2-202ENSMUST00000120988 1363 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
PtproE9Q612 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
PtproE9Q612 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
PtproE9Q612 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
PtproE9Q612 0610010K14Rik-207ENSMUST00000108577 659 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
PtproE9Q612 Ccnd3-ps-201ENSMUST00000117963 881 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
PtproE9Q612 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
PtproE9Q612 Alkbh1-212ENSMUST00000185301 408 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
PtproE9Q612 Gm21362-201ENSMUST00000194272 928 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
PtproE9Q612 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC19.47■□□□□ 0.71
PtproE9Q612 Lce1m-201ENSMUST00000029520 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
PtproE9Q612 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
PtproE9Q612 Lpin2-213ENSMUST00000156570 1586 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
PtproE9Q612 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
PtproE9Q612 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
PtproE9Q612 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
PtproE9Q612 Opa3-202ENSMUST00000161711 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
PtproE9Q612 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
PtproE9Q612 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
PtproE9Q612 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
PtproE9Q612 2210408F21Rik-211ENSMUST00000151800 750 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
PtproE9Q612 Dcxr-201ENSMUST00000026144 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
PtproE9Q612 Mrps28-201ENSMUST00000042148 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
PtproE9Q612 Limd2-202ENSMUST00000064545 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
PtproE9Q612 Coro7-202ENSMUST00000090480 1147 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
PtproE9Q612 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
PtproE9Q612 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
PtproE9Q612 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
PtproE9Q612 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
PtproE9Q612 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
PtproE9Q612 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
PtproE9Q612 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
PtproE9Q612 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.7
PtproE9Q612 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
PtproE9Q612 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
PtproE9Q612 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
PtproE9Q612 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
PtproE9Q612 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
PtproE9Q612 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
PtproE9Q612 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
PtproE9Q612 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
PtproE9Q612 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
PtproE9Q612 Map4k4-201ENSMUST00000163854 5782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
PtproE9Q612 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.44■□□□□ 0.7
PtproE9Q612 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
PtproE9Q612 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
PtproE9Q612 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
PtproE9Q612 Rint1-204ENSMUST00000117783 560 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.8 ms