Protein–RNA interactions for Protein: E9Q3J7

Gm3020, Predicted gene 3020, mousemouse

Predictions only

Length 150 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm3020E9Q3J7 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Gm3020E9Q3J7 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Gm3020E9Q3J7 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Gm3020E9Q3J7 Esrrb-201ENSMUST00000021680 2136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Gm3020E9Q3J7 Zscan12-201ENSMUST00000053293 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Gm3020E9Q3J7 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Gm3020E9Q3J7 Tbc1d2b-202ENSMUST00000128874 3473 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Gm3020E9Q3J7 Usp13-202ENSMUST00000108228 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Gm3020E9Q3J7 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Gm3020E9Q3J7 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Gm3020E9Q3J7 Mrpl39-201ENSMUST00000116584 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Gm3020E9Q3J7 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Gm3020E9Q3J7 Arhgef7-205ENSMUST00000110909 4926 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Gm3020E9Q3J7 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Gm3020E9Q3J7 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Gm3020E9Q3J7 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Gm3020E9Q3J7 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Gm3020E9Q3J7 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Gm3020E9Q3J7 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
Gm3020E9Q3J7 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Gm3020E9Q3J7 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Gm3020E9Q3J7 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Gm3020E9Q3J7 Stox1-202ENSMUST00000133371 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Gm3020E9Q3J7 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Gm3020E9Q3J7 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Gm3020E9Q3J7 Mex3a-201ENSMUST00000172699 5778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Gm3020E9Q3J7 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Gm3020E9Q3J7 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Gm3020E9Q3J7 Lins1-203ENSMUST00000121777 2729 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Gm3020E9Q3J7 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Gm3020E9Q3J7 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Gm3020E9Q3J7 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Gm3020E9Q3J7 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Gm3020E9Q3J7 Fst-202ENSMUST00000223640 2612 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
Gm3020E9Q3J7 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
Gm3020E9Q3J7 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Gm3020E9Q3J7 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
Gm3020E9Q3J7 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Gm3020E9Q3J7 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Gm3020E9Q3J7 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Gm3020E9Q3J7 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Gm3020E9Q3J7 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Gm3020E9Q3J7 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Gm3020E9Q3J7 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Gm3020E9Q3J7 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Gm3020E9Q3J7 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Gm3020E9Q3J7 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Gm3020E9Q3J7 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Gm3020E9Q3J7 Glra1-201ENSMUST00000075603 2037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Gm3020E9Q3J7 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Gm3020E9Q3J7 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
Gm3020E9Q3J7 5330438I03Rik-201ENSMUST00000168347 2845 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
Gm3020E9Q3J7 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Gm3020E9Q3J7 Gnao1-207ENSMUST00000138659 5526 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Gm3020E9Q3J7 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Gm3020E9Q3J7 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Gm3020E9Q3J7 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Gm3020E9Q3J7 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Gm3020E9Q3J7 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Gm3020E9Q3J7 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Gm3020E9Q3J7 Mtcl1-201ENSMUST00000086693 7221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Gm3020E9Q3J7 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Gm3020E9Q3J7 Etnk1-204ENSMUST00000205256 2647 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Gm3020E9Q3J7 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Gm3020E9Q3J7 Mta1-201ENSMUST00000009099 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Gm3020E9Q3J7 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Gm3020E9Q3J7 Vps4a-201ENSMUST00000034388 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Gm3020E9Q3J7 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Gm3020E9Q3J7 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Gm3020E9Q3J7 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Gm3020E9Q3J7 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Gm3020E9Q3J7 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Gm3020E9Q3J7 Rap2a-201ENSMUST00000062117 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Gm3020E9Q3J7 Tmem214-202ENSMUST00000201203 6110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Gm3020E9Q3J7 Sri-205ENSMUST00000148633 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Gm3020E9Q3J7 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Gm3020E9Q3J7 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Gm3020E9Q3J7 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Gm3020E9Q3J7 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Gm3020E9Q3J7 Synm-205ENSMUST00000208815 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Gm3020E9Q3J7 Gm13032-201ENSMUST00000151848 2001 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Gm3020E9Q3J7 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Gm3020E9Q3J7 Bmt2-201ENSMUST00000045235 4143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Gm3020E9Q3J7 Atp2a2-201ENSMUST00000031423 4486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Gm3020E9Q3J7 Large1-202ENSMUST00000119826 4647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Gm3020E9Q3J7 Map4k5-210ENSMUST00000171211 4334 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Gm3020E9Q3J7 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Gm3020E9Q3J7 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Gm3020E9Q3J7 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Gm3020E9Q3J7 9330111N05Rik-202ENSMUST00000181043 2449 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Gm3020E9Q3J7 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Gm3020E9Q3J7 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Gm3020E9Q3J7 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Gm3020E9Q3J7 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Gm3020E9Q3J7 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Gm3020E9Q3J7 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Gm3020E9Q3J7 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Gm3020E9Q3J7 Ecel1-204ENSMUST00000161002 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Gm3020E9Q3J7 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Gm3020E9Q3J7 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20 ms