Protein–RNA interactions for Protein: E9Q373

Vmn1r238, Vomeronasal type-1 receptor, mousemouse

Predictions only

Length 306 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn1r238E9Q373 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Vmn1r238E9Q373 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Vmn1r238E9Q373 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Vmn1r238E9Q373 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Vmn1r238E9Q373 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
Vmn1r238E9Q373 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Vmn1r238E9Q373 Diaph1-205ENSMUST00000115634 5666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Vmn1r238E9Q373 Btnl9-201ENSMUST00000046522 5273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Vmn1r238E9Q373 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Vmn1r238E9Q373 Cpeb2-204ENSMUST00000166713 6846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Vmn1r238E9Q373 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Vmn1r238E9Q373 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Vmn1r238E9Q373 Akt2-205ENSMUST00000108344 4544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Vmn1r238E9Q373 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Vmn1r238E9Q373 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Vmn1r238E9Q373 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Vmn1r238E9Q373 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Vmn1r238E9Q373 C1ql3-201ENSMUST00000061545 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Vmn1r238E9Q373 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Vmn1r238E9Q373 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Vmn1r238E9Q373 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Vmn1r238E9Q373 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Vmn1r238E9Q373 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Vmn1r238E9Q373 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Vmn1r238E9Q373 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Vmn1r238E9Q373 Ptpre-201ENSMUST00000073961 5410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Vmn1r238E9Q373 Letm1-201ENSMUST00000005431 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Vmn1r238E9Q373 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Vmn1r238E9Q373 Myrip-201ENSMUST00000048121 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Vmn1r238E9Q373 Fbxo47-201ENSMUST00000093939 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Vmn1r238E9Q373 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Vmn1r238E9Q373 Bin2-204ENSMUST00000182775 1908 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Vmn1r238E9Q373 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Vmn1r238E9Q373 Adcy2-201ENSMUST00000022013 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Vmn1r238E9Q373 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Vmn1r238E9Q373 Rasl10b-204ENSMUST00000175848 3249 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Vmn1r238E9Q373 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Vmn1r238E9Q373 Gm37805-201ENSMUST00000192612 1094 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Vmn1r238E9Q373 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Vmn1r238E9Q373 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Vmn1r238E9Q373 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Vmn1r238E9Q373 Cyth2-201ENSMUST00000056820 2527 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Vmn1r238E9Q373 Coq5-201ENSMUST00000040421 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Vmn1r238E9Q373 Golga7-202ENSMUST00000121783 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Vmn1r238E9Q373 Gm10461-201ENSMUST00000202073 4786 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Vmn1r238E9Q373 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Vmn1r238E9Q373 Tmem79-201ENSMUST00000001456 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Vmn1r238E9Q373 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Vmn1r238E9Q373 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Vmn1r238E9Q373 Runx1t1-201ENSMUST00000006761 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Vmn1r238E9Q373 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Vmn1r238E9Q373 Gm19439-201ENSMUST00000198195 2273 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
Vmn1r238E9Q373 Fst-201ENSMUST00000022287 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Vmn1r238E9Q373 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Vmn1r238E9Q373 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Vmn1r238E9Q373 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Vmn1r238E9Q373 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Vmn1r238E9Q373 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Vmn1r238E9Q373 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Vmn1r238E9Q373 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Vmn1r238E9Q373 Nfatc2-205ENSMUST00000137451 2369 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Vmn1r238E9Q373 A930012L18Rik-201ENSMUST00000181094 2364 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Vmn1r238E9Q373 Slc2a13-202ENSMUST00000109283 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Vmn1r238E9Q373 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Vmn1r238E9Q373 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Vmn1r238E9Q373 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Vmn1r238E9Q373 Aatk-203ENSMUST00000103020 5687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Vmn1r238E9Q373 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Vmn1r238E9Q373 Cables1-201ENSMUST00000046948 3202 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Vmn1r238E9Q373 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Vmn1r238E9Q373 Arhgef19-201ENSMUST00000006618 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Vmn1r238E9Q373 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Vmn1r238E9Q373 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
Vmn1r238E9Q373 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Vmn1r238E9Q373 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Vmn1r238E9Q373 Snx14-205ENSMUST00000173011 2238 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Vmn1r238E9Q373 Pick1-201ENSMUST00000018295 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Vmn1r238E9Q373 Trim68-201ENSMUST00000082175 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Vmn1r238E9Q373 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Vmn1r238E9Q373 Arrb2-204ENSMUST00000102564 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Vmn1r238E9Q373 Lins1-203ENSMUST00000121777 2729 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Vmn1r238E9Q373 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Vmn1r238E9Q373 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Vmn1r238E9Q373 Atp2a2-201ENSMUST00000031423 4486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Vmn1r238E9Q373 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Vmn1r238E9Q373 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Vmn1r238E9Q373 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Vmn1r238E9Q373 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
Vmn1r238E9Q373 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Vmn1r238E9Q373 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Vmn1r238E9Q373 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Vmn1r238E9Q373 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Vmn1r238E9Q373 Asb1-202ENSMUST00000086843 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Vmn1r238E9Q373 Nf2-205ENSMUST00000109910 4720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Vmn1r238E9Q373 Mapk7-203ENSMUST00000108714 3069 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Vmn1r238E9Q373 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Vmn1r238E9Q373 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Vmn1r238E9Q373 Wnt10b-202ENSMUST00000166022 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Vmn1r238E9Q373 Zfp804a-201ENSMUST00000047527 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Vmn1r238E9Q373 AC163637.2-201ENSMUST00000213826 1945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.4 ms