Protein–RNA interactions for Protein: E9Q1J0

Zfp558, Zinc finger protein 558, mousemouse

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zfp558E9Q1J0 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Zfp558E9Q1J0 Sorcs3-201ENSMUST00000078880 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Zfp558E9Q1J0 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Zfp558E9Q1J0 Arhgef19-201ENSMUST00000006618 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Zfp558E9Q1J0 G730003C15Rik-202ENSMUST00000189096 2309 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
Zfp558E9Q1J0 Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 9376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Zfp558E9Q1J0 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Zfp558E9Q1J0 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Zfp558E9Q1J0 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Zfp558E9Q1J0 Kif7-202ENSMUST00000178048 4524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Zfp558E9Q1J0 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Zfp558E9Q1J0 Ric1-201ENSMUST00000043610 7190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Zfp558E9Q1J0 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Zfp558E9Q1J0 Eml1-203ENSMUST00000109860 4160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Zfp558E9Q1J0 Wnt4-201ENSMUST00000045747 4194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Zfp558E9Q1J0 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
Zfp558E9Q1J0 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Zfp558E9Q1J0 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Zfp558E9Q1J0 Gm43042-201ENSMUST00000198676 1820 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Zfp558E9Q1J0 Stk35-202ENSMUST00000166282 5445 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Zfp558E9Q1J0 Ptprt-201ENSMUST00000109441 6623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Zfp558E9Q1J0 Ikzf1-203ENSMUST00000065433 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Zfp558E9Q1J0 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Zfp558E9Q1J0 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Zfp558E9Q1J0 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Zfp558E9Q1J0 Zmiz1-201ENSMUST00000007961 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Zfp558E9Q1J0 Gm45844-202ENSMUST00000209325 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Zfp558E9Q1J0 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Zfp558E9Q1J0 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Zfp558E9Q1J0 Ust-201ENSMUST00000061601 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Zfp558E9Q1J0 Mcl1-201ENSMUST00000037947 3418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Zfp558E9Q1J0 1700018L02Rik-201ENSMUST00000187897 2485 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
Zfp558E9Q1J0 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Zfp558E9Q1J0 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Zfp558E9Q1J0 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Zfp558E9Q1J0 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Zfp558E9Q1J0 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
Zfp558E9Q1J0 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Zfp558E9Q1J0 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Zfp558E9Q1J0 Ano10-206ENSMUST00000216670 2108 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Zfp558E9Q1J0 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Zfp558E9Q1J0 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Zfp558E9Q1J0 Ext2-212ENSMUST00000184931 2629 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Zfp558E9Q1J0 Gm43213-201ENSMUST00000151866 1790 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
Zfp558E9Q1J0 Ece2-202ENSMUST00000122306 2495 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Zfp558E9Q1J0 Shroom4-202ENSMUST00000103005 4839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Zfp558E9Q1J0 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Zfp558E9Q1J0 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Zfp558E9Q1J0 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Zfp558E9Q1J0 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Zfp558E9Q1J0 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Zfp558E9Q1J0 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Zfp558E9Q1J0 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Zfp558E9Q1J0 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Zfp558E9Q1J0 Taok3-203ENSMUST00000111978 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Zfp558E9Q1J0 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Zfp558E9Q1J0 Xpo4-209ENSMUST00000174545 8680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Zfp558E9Q1J0 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Zfp558E9Q1J0 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Zfp558E9Q1J0 Bmi1-201ENSMUST00000028071 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Zfp558E9Q1J0 Zscan12-201ENSMUST00000053293 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Zfp558E9Q1J0 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Zfp558E9Q1J0 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Zfp558E9Q1J0 Gsk3b-201ENSMUST00000023507 8303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Zfp558E9Q1J0 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Zfp558E9Q1J0 Alcam-201ENSMUST00000023312 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Zfp558E9Q1J0 Agfg2-201ENSMUST00000031736 2893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Zfp558E9Q1J0 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Zfp558E9Q1J0 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Zfp558E9Q1J0 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Zfp558E9Q1J0 Neo1-201ENSMUST00000068664 7379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Zfp558E9Q1J0 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
Zfp558E9Q1J0 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Zfp558E9Q1J0 Npas3-201ENSMUST00000101432 5879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Zfp558E9Q1J0 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Zfp558E9Q1J0 Tmem136-202ENSMUST00000213544 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Zfp558E9Q1J0 Chic2-201ENSMUST00000075452 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Zfp558E9Q1J0 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Zfp558E9Q1J0 Cspg5-205ENSMUST00000199736 2107 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Zfp558E9Q1J0 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Zfp558E9Q1J0 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
Zfp558E9Q1J0 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Zfp558E9Q1J0 Deaf1-209ENSMUST00000211537 2882 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Zfp558E9Q1J0 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Zfp558E9Q1J0 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
Zfp558E9Q1J0 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Zfp558E9Q1J0 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Zfp558E9Q1J0 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Zfp558E9Q1J0 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Zfp558E9Q1J0 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Zfp558E9Q1J0 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Zfp558E9Q1J0 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
Zfp558E9Q1J0 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Zfp558E9Q1J0 Fbrsl1-202ENSMUST00000069483 4720 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Zfp558E9Q1J0 Zmym3-206ENSMUST00000120107 5882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Zfp558E9Q1J0 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Zfp558E9Q1J0 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Zfp558E9Q1J0 Dexi-203ENSMUST00000184863 2537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Zfp558E9Q1J0 Dlx3-201ENSMUST00000092768 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Zfp558E9Q1J0 Xiap-203ENSMUST00000115094 6542 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
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