Protein–RNA interactions for Protein: E9PX29

Sptbn4, Spectrin beta chain, mousemouse

Predictions only

Length 2,561 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sptbn4E9PX29 Gm43347-201ENSMUST00000200226 580 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Sptbn4E9PX29 1600017P15Rik-201ENSMUST00000083427 412 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Sptbn4E9PX29 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Sptbn4E9PX29 Rpp25-201ENSMUST00000080514 1423 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Sptbn4E9PX29 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Sptbn4E9PX29 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Sptbn4E9PX29 Ism1-201ENSMUST00000099307 2944 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Sptbn4E9PX29 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Sptbn4E9PX29 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Sptbn4E9PX29 Rnf141-201ENSMUST00000106682 1101 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Sptbn4E9PX29 Rhox13-201ENSMUST00000152730 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Sptbn4E9PX29 Pnmt-201ENSMUST00000041301 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Sptbn4E9PX29 Gm9857-201ENSMUST00000050914 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Sptbn4E9PX29 Fam167b-201ENSMUST00000052835 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Sptbn4E9PX29 Fam92a-201ENSMUST00000087052 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Sptbn4E9PX29 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Sptbn4E9PX29 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Sptbn4E9PX29 Klc3-202ENSMUST00000108457 1632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Sptbn4E9PX29 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Sptbn4E9PX29 Psma3-204ENSMUST00000160864 859 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Sptbn4E9PX29 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Sptbn4E9PX29 1700037H04Rik-201ENSMUST00000028800 832 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Sptbn4E9PX29 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Sptbn4E9PX29 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Sptbn4E9PX29 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Sptbn4E9PX29 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Sptbn4E9PX29 2700046G09Rik-201ENSMUST00000181612 1641 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Sptbn4E9PX29 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Sptbn4E9PX29 Tex30-213ENSMUST00000156392 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Sptbn4E9PX29 3110040N11Rik-201ENSMUST00000026092 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Sptbn4E9PX29 Ifi27l2b-201ENSMUST00000044687 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Sptbn4E9PX29 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Sptbn4E9PX29 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Sptbn4E9PX29 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Sptbn4E9PX29 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Sptbn4E9PX29 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Sptbn4E9PX29 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Sptbn4E9PX29 Hotairm1-202ENSMUST00000132559 713 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Sptbn4E9PX29 Gm45669-201ENSMUST00000209808 459 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Sptbn4E9PX29 AC148328.1-201ENSMUST00000216448 920 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Sptbn4E9PX29 CAAA01066804.1-201ENSMUST00000217800 611 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Sptbn4E9PX29 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Sptbn4E9PX29 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Sptbn4E9PX29 Lat2-202ENSMUST00000077636 1717 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Sptbn4E9PX29 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Sptbn4E9PX29 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Sptbn4E9PX29 Arrb2-204ENSMUST00000102564 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Sptbn4E9PX29 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Sptbn4E9PX29 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Sptbn4E9PX29 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Sptbn4E9PX29 Krt27-201ENSMUST00000017732 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Sptbn4E9PX29 AL591207.1-203ENSMUST00000222401 1380 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Sptbn4E9PX29 Mcub-204ENSMUST00000153506 1005 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Sptbn4E9PX29 Gm27357-201ENSMUST00000183754 135 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Sptbn4E9PX29 Krtcap3-201ENSMUST00000054829 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Sptbn4E9PX29 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Sptbn4E9PX29 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Sptbn4E9PX29 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Sptbn4E9PX29 Babam1-201ENSMUST00000002473 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Sptbn4E9PX29 Magix-201ENSMUST00000115695 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Sptbn4E9PX29 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Sptbn4E9PX29 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Sptbn4E9PX29 Olfr129-201ENSMUST00000122318 993 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Sptbn4E9PX29 Ccdc58-202ENSMUST00000163352 970 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Sptbn4E9PX29 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Sptbn4E9PX29 Eif5a-203ENSMUST00000071026 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Sptbn4E9PX29 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Sptbn4E9PX29 Rab11b-203ENSMUST00000173860 1544 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Sptbn4E9PX29 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Sptbn4E9PX29 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Sptbn4E9PX29 Slc35g2-201ENSMUST00000093792 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Sptbn4E9PX29 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Sptbn4E9PX29 4933428P19Rik-201ENSMUST00000199616 1376 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Sptbn4E9PX29 Tnnt1-203ENSMUST00000108587 1059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Sptbn4E9PX29 Lgals3-203ENSMUST00000146468 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Sptbn4E9PX29 Gm27389-201ENSMUST00000183622 195 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Sptbn4E9PX29 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Sptbn4E9PX29 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Sptbn4E9PX29 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Sptbn4E9PX29 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Sptbn4E9PX29 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Sptbn4E9PX29 Srpx-202ENSMUST00000115543 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Sptbn4E9PX29 Gm11594-201ENSMUST00000122313 162 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Sptbn4E9PX29 Hsbp1-202ENSMUST00000212468 638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Sptbn4E9PX29 Rgcc-201ENSMUST00000022595 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Sptbn4E9PX29 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Sptbn4E9PX29 Ntng1-207ENSMUST00000131027 1485 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Sptbn4E9PX29 Ntng1-209ENSMUST00000138344 1452 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Sptbn4E9PX29 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Sptbn4E9PX29 Pcbp4-201ENSMUST00000024260 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Sptbn4E9PX29 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Sptbn4E9PX29 Speg-202ENSMUST00000113587 1254 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Sptbn4E9PX29 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Sptbn4E9PX29 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Sptbn4E9PX29 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Sptbn4E9PX29 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Sptbn4E9PX29 Gm11950-201ENSMUST00000121615 838 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Sptbn4E9PX29 Imp3-201ENSMUST00000034827 924 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Sptbn4E9PX29 Gm11748-201ENSMUST00000153825 1498 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Sptbn4E9PX29 Pts-206ENSMUST00000214873 511 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.5 ms