Protein–RNA interactions for Protein: E9PVD1

Ccdc62, Coiled-coil domain-containing protein 62, mousemouse

Predictions only

Length 701 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc62E9PVD1 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ccdc62E9PVD1 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ccdc62E9PVD1 Hspa1l-201ENSMUST00000007248 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ccdc62E9PVD1 Map1lc3b-204ENSMUST00000181826 2633 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Ccdc62E9PVD1 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ccdc62E9PVD1 Gm26795-201ENSMUST00000180993 1952 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ccdc62E9PVD1 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ccdc62E9PVD1 Amfr-201ENSMUST00000053766 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ccdc62E9PVD1 A730060N03Rik-201ENSMUST00000174277 2124 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ccdc62E9PVD1 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
Ccdc62E9PVD1 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ccdc62E9PVD1 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ccdc62E9PVD1 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ccdc62E9PVD1 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ccdc62E9PVD1 Aldoa-ps3-201ENSMUST00000217558 306 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
Ccdc62E9PVD1 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ccdc62E9PVD1 Il17re-203ENSMUST00000101065 1973 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ccdc62E9PVD1 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ccdc62E9PVD1 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ccdc62E9PVD1 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ccdc62E9PVD1 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ccdc62E9PVD1 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ccdc62E9PVD1 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ccdc62E9PVD1 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
Ccdc62E9PVD1 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
Ccdc62E9PVD1 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
Ccdc62E9PVD1 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.46
Ccdc62E9PVD1 Dmtn-207ENSMUST00000228001 2437 ntBASIC17.96■□□□□ 0.46
Ccdc62E9PVD1 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ccdc62E9PVD1 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ccdc62E9PVD1 Bcor-206ENSMUST00000124033 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ccdc62E9PVD1 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ccdc62E9PVD1 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ccdc62E9PVD1 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ccdc62E9PVD1 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ccdc62E9PVD1 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ccdc62E9PVD1 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
Ccdc62E9PVD1 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
Ccdc62E9PVD1 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
Ccdc62E9PVD1 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
Ccdc62E9PVD1 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ccdc62E9PVD1 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
Ccdc62E9PVD1 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ccdc62E9PVD1 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ccdc62E9PVD1 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ccdc62E9PVD1 Slc5a10-201ENSMUST00000051552 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ccdc62E9PVD1 Fst-201ENSMUST00000022287 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ccdc62E9PVD1 Htr6-202ENSMUST00000105802 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ccdc62E9PVD1 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ccdc62E9PVD1 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ccdc62E9PVD1 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ccdc62E9PVD1 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
Ccdc62E9PVD1 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ccdc62E9PVD1 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ccdc62E9PVD1 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
Ccdc62E9PVD1 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ccdc62E9PVD1 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ccdc62E9PVD1 Camsap3-206ENSMUST00000207533 2584 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ccdc62E9PVD1 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ccdc62E9PVD1 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ccdc62E9PVD1 Gm21949-201ENSMUST00000182006 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ccdc62E9PVD1 Nuak1-201ENSMUST00000020220 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ccdc62E9PVD1 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ccdc62E9PVD1 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ccdc62E9PVD1 Map3k5-201ENSMUST00000095806 5450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ccdc62E9PVD1 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ccdc62E9PVD1 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ccdc62E9PVD1 Arhgef7-205ENSMUST00000110909 4926 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ccdc62E9PVD1 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ccdc62E9PVD1 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ccdc62E9PVD1 Tbc1d9-202ENSMUST00000093393 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ccdc62E9PVD1 Sft2d2-201ENSMUST00000043338 5535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ccdc62E9PVD1 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ccdc62E9PVD1 Slc30a5-205ENSMUST00000225922 2722 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Ccdc62E9PVD1 Lrrc14-204ENSMUST00000137649 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Ccdc62E9PVD1 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
Ccdc62E9PVD1 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Ccdc62E9PVD1 Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 9376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Ccdc62E9PVD1 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Ccdc62E9PVD1 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Ccdc62E9PVD1 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Ccdc62E9PVD1 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Ccdc62E9PVD1 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Ccdc62E9PVD1 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Ccdc62E9PVD1 Rcc1-201ENSMUST00000030726 2278 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Ccdc62E9PVD1 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Ccdc62E9PVD1 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Ccdc62E9PVD1 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
Ccdc62E9PVD1 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Ccdc62E9PVD1 Tmem94-202ENSMUST00000103033 5238 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Ccdc62E9PVD1 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Ccdc62E9PVD1 Ubr3-202ENSMUST00000112251 8081 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Ccdc62E9PVD1 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Ccdc62E9PVD1 Ddx59-201ENSMUST00000027655 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Ccdc62E9PVD1 Nfatc3-201ENSMUST00000109308 5984 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Ccdc62E9PVD1 Zfp622-201ENSMUST00000061875 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Ccdc62E9PVD1 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Ccdc62E9PVD1 Nfib-206ENSMUST00000107248 3294 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Ccdc62E9PVD1 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Ccdc62E9PVD1 Whrn-206ENSMUST00000102867 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.2 ms