Protein–RNA interactions for Protein: E0CXF8

BC035044, cDNA sequence BC035044, mousemouse

Predictions only

Length 138 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BC035044E0CXF8 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
BC035044E0CXF8 Wt1-205ENSMUST00000143043 3090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
BC035044E0CXF8 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
BC035044E0CXF8 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
BC035044E0CXF8 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
BC035044E0CXF8 Cnn2-201ENSMUST00000004784 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
BC035044E0CXF8 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
BC035044E0CXF8 Fam98a-201ENSMUST00000112507 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
BC035044E0CXF8 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
BC035044E0CXF8 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
BC035044E0CXF8 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
BC035044E0CXF8 Rmnd1-201ENSMUST00000042251 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
BC035044E0CXF8 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
BC035044E0CXF8 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
BC035044E0CXF8 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
BC035044E0CXF8 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
BC035044E0CXF8 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
BC035044E0CXF8 Mterf1a-202ENSMUST00000117463 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
BC035044E0CXF8 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
BC035044E0CXF8 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
BC035044E0CXF8 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
BC035044E0CXF8 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
BC035044E0CXF8 Atxn7l2-202ENSMUST00000117409 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
BC035044E0CXF8 Kank3-201ENSMUST00000048560 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
BC035044E0CXF8 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
BC035044E0CXF8 Apbb1-214ENSMUST00000189378 2878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
BC035044E0CXF8 Ocel1-202ENSMUST00000110051 2179 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
BC035044E0CXF8 Ubac2-201ENSMUST00000039803 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
BC035044E0CXF8 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
BC035044E0CXF8 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
BC035044E0CXF8 AC121598.2-201ENSMUST00000228376 2325 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
BC035044E0CXF8 Gne-202ENSMUST00000102936 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
BC035044E0CXF8 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
BC035044E0CXF8 4930503L19Rik-201ENSMUST00000067556 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
BC035044E0CXF8 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
BC035044E0CXF8 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
BC035044E0CXF8 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
BC035044E0CXF8 Bean1-203ENSMUST00000167633 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
BC035044E0CXF8 Hikeshi-206ENSMUST00000153470 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
BC035044E0CXF8 Vsig10l-204ENSMUST00000203769 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
BC035044E0CXF8 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
BC035044E0CXF8 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
BC035044E0CXF8 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
BC035044E0CXF8 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
BC035044E0CXF8 Tmem51os1-202ENSMUST00000141769 2131 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
BC035044E0CXF8 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
BC035044E0CXF8 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
BC035044E0CXF8 Gm19554-201ENSMUST00000220934 2076 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
BC035044E0CXF8 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
BC035044E0CXF8 Gm15635-204ENSMUST00000208024 2539 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
BC035044E0CXF8 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
BC035044E0CXF8 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
BC035044E0CXF8 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
BC035044E0CXF8 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
BC035044E0CXF8 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
BC035044E0CXF8 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
BC035044E0CXF8 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
BC035044E0CXF8 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
BC035044E0CXF8 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
BC035044E0CXF8 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
BC035044E0CXF8 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
BC035044E0CXF8 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
BC035044E0CXF8 Mdfic-202ENSMUST00000120512 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
BC035044E0CXF8 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
BC035044E0CXF8 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
BC035044E0CXF8 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
BC035044E0CXF8 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
BC035044E0CXF8 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
BC035044E0CXF8 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
BC035044E0CXF8 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
BC035044E0CXF8 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
BC035044E0CXF8 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
BC035044E0CXF8 Ndor1-202ENSMUST00000114349 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
BC035044E0CXF8 Ecel1-201ENSMUST00000027463 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
BC035044E0CXF8 Fkrp-201ENSMUST00000061390 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
BC035044E0CXF8 Gm5898-201ENSMUST00000121016 2071 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
BC035044E0CXF8 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
BC035044E0CXF8 Yipf3-201ENSMUST00000095263 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
BC035044E0CXF8 Osgin2-201ENSMUST00000037198 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
BC035044E0CXF8 Nectin2-202ENSMUST00000108450 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
BC035044E0CXF8 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
BC035044E0CXF8 Slc29a1-201ENSMUST00000051574 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
BC035044E0CXF8 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
BC035044E0CXF8 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
BC035044E0CXF8 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
BC035044E0CXF8 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
BC035044E0CXF8 Rps6ka1-202ENSMUST00000105894 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
BC035044E0CXF8 Retreg1-201ENSMUST00000022881 3248 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
BC035044E0CXF8 Hps4-201ENSMUST00000035279 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
BC035044E0CXF8 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
BC035044E0CXF8 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
BC035044E0CXF8 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
BC035044E0CXF8 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
BC035044E0CXF8 Ino80e-201ENSMUST00000050833 1944 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
BC035044E0CXF8 Chst8-203ENSMUST00000154629 2079 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
BC035044E0CXF8 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
BC035044E0CXF8 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
BC035044E0CXF8 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
BC035044E0CXF8 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
BC035044E0CXF8 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.1 ms