Protein–RNA interactions for Protein: D3Z5W0

Atp6ap1l, ATPase, H+-transporting, lysosomal accessory protein 1-like, mousemouse

Predictions only

Length 336 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp6ap1lD3Z5W0 Gm11249-201ENSMUST00000117071 859 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Atp6ap1lD3Z5W0 Zfp629-207ENSMUST00000134446 670 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Atp6ap1lD3Z5W0 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Atp6ap1lD3Z5W0 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Atp6ap1lD3Z5W0 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Atp6ap1lD3Z5W0 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Atp6ap1lD3Z5W0 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Atp6ap1lD3Z5W0 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Atp6ap1lD3Z5W0 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Atp6ap1lD3Z5W0 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Atp6ap1lD3Z5W0 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Atp6ap1lD3Z5W0 B3gat2-202ENSMUST00000140583 1737 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Atp6ap1lD3Z5W0 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Atp6ap1lD3Z5W0 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Atp6ap1lD3Z5W0 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Atp6ap1lD3Z5W0 Mdfic-202ENSMUST00000120512 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Atp6ap1lD3Z5W0 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Atp6ap1lD3Z5W0 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Atp6ap1lD3Z5W0 Rps14-202ENSMUST00000118551 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Atp6ap1lD3Z5W0 Moap1-202ENSMUST00000178384 1284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Atp6ap1lD3Z5W0 Gm18666-201ENSMUST00000190039 958 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Atp6ap1lD3Z5W0 Mrpl10-202ENSMUST00000054252 744 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Atp6ap1lD3Z5W0 Dlg3-204ENSMUST00000113736 4940 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Atp6ap1lD3Z5W0 2700046G09Rik-201ENSMUST00000181612 1641 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Atp6ap1lD3Z5W0 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Atp6ap1lD3Z5W0 Gm9194-201ENSMUST00000220749 1447 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Atp6ap1lD3Z5W0 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Atp6ap1lD3Z5W0 Satb1-211ENSMUST00000152830 5993 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Atp6ap1lD3Z5W0 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Atp6ap1lD3Z5W0 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Atp6ap1lD3Z5W0 Tpd52l1-201ENSMUST00000000305 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Atp6ap1lD3Z5W0 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Atp6ap1lD3Z5W0 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Atp6ap1lD3Z5W0 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Atp6ap1lD3Z5W0 Gm11927-201ENSMUST00000118472 759 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Atp6ap1lD3Z5W0 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Atp6ap1lD3Z5W0 Fgf22-203ENSMUST00000219981 1070 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Atp6ap1lD3Z5W0 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Atp6ap1lD3Z5W0 Srcin1-201ENSMUST00000107590 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Atp6ap1lD3Z5W0 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Atp6ap1lD3Z5W0 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Atp6ap1lD3Z5W0 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Atp6ap1lD3Z5W0 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Atp6ap1lD3Z5W0 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Atp6ap1lD3Z5W0 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Atp6ap1lD3Z5W0 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Atp6ap1lD3Z5W0 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Atp6ap1lD3Z5W0 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Atp6ap1lD3Z5W0 Cebpg-202ENSMUST00000130491 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Atp6ap1lD3Z5W0 Snx12-204ENSMUST00000156473 1114 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Atp6ap1lD3Z5W0 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Atp6ap1lD3Z5W0 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Atp6ap1lD3Z5W0 Fbxo47-201ENSMUST00000093939 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Atp6ap1lD3Z5W0 Zfp783-201ENSMUST00000095946 670 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Atp6ap1lD3Z5W0 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Atp6ap1lD3Z5W0 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Atp6ap1lD3Z5W0 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Atp6ap1lD3Z5W0 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Atp6ap1lD3Z5W0 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Atp6ap1lD3Z5W0 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Atp6ap1lD3Z5W0 Slc30a9-204ENSMUST00000162372 5711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Atp6ap1lD3Z5W0 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Atp6ap1lD3Z5W0 Dip2c-203ENSMUST00000174552 8023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Atp6ap1lD3Z5W0 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Atp6ap1lD3Z5W0 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Atp6ap1lD3Z5W0 Zfp644-204ENSMUST00000112696 5785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Atp6ap1lD3Z5W0 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Atp6ap1lD3Z5W0 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Atp6ap1lD3Z5W0 Tnfaip8l2-201ENSMUST00000013851 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Atp6ap1lD3Z5W0 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Atp6ap1lD3Z5W0 Rab7-206ENSMUST00000203674 424 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Atp6ap1lD3Z5W0 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Atp6ap1lD3Z5W0 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Atp6ap1lD3Z5W0 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Atp6ap1lD3Z5W0 Gab1-202ENSMUST00000210676 4985 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Atp6ap1lD3Z5W0 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Atp6ap1lD3Z5W0 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Atp6ap1lD3Z5W0 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Atp6ap1lD3Z5W0 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Atp6ap1lD3Z5W0 Crtap-201ENSMUST00000084881 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Atp6ap1lD3Z5W0 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Atp6ap1lD3Z5W0 Gm5643-201ENSMUST00000117081 966 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Atp6ap1lD3Z5W0 Gm13158-201ENSMUST00000122007 736 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Atp6ap1lD3Z5W0 Gm45894-202ENSMUST00000212728 1097 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Atp6ap1lD3Z5W0 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Atp6ap1lD3Z5W0 Rps23-201ENSMUST00000051955 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Atp6ap1lD3Z5W0 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Atp6ap1lD3Z5W0 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Atp6ap1lD3Z5W0 Hmgxb3-201ENSMUST00000091884 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Atp6ap1lD3Z5W0 Gnb2-204ENSMUST00000111027 1610 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Atp6ap1lD3Z5W0 AL591207.1-203ENSMUST00000222401 1380 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Atp6ap1lD3Z5W0 Fmnl2-203ENSMUST00000090952 5414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Atp6ap1lD3Z5W0 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Atp6ap1lD3Z5W0 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Atp6ap1lD3Z5W0 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Atp6ap1lD3Z5W0 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Atp6ap1lD3Z5W0 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
Atp6ap1lD3Z5W0 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Atp6ap1lD3Z5W0 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Atp6ap1lD3Z5W0 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.2 ms