Protein–RNA interactions for Protein: D3Z460

Gm1330, Predicted gene 1330, mousemouse

Predictions only

Length 184 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm1330D3Z460 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gm1330D3Z460 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gm1330D3Z460 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gm1330D3Z460 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gm1330D3Z460 Ldb1-205ENSMUST00000137771 2014 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gm1330D3Z460 Stam-202ENSMUST00000102960 5000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gm1330D3Z460 Fbrsl1-202ENSMUST00000069483 4720 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Gm1330D3Z460 Slc27a4-201ENSMUST00000080065 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Gm1330D3Z460 4930448E22Rik-202ENSMUST00000215242 2102 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Gm1330D3Z460 Zc3h15-201ENSMUST00000081591 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Gm1330D3Z460 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Gm1330D3Z460 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Gm1330D3Z460 Nectin2-202ENSMUST00000108450 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm1330D3Z460 Chst2-201ENSMUST00000036267 7328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm1330D3Z460 Tmem132e-201ENSMUST00000054245 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm1330D3Z460 Krt9-201ENSMUST00000059707 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm1330D3Z460 Sbf1-205ENSMUST00000144585 6165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm1330D3Z460 Pitx2-207ENSMUST00000174661 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm1330D3Z460 Rftn1-201ENSMUST00000044503 4029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm1330D3Z460 Lactbl1-201ENSMUST00000178843 2954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm1330D3Z460 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm1330D3Z460 Fgf23-201ENSMUST00000000186 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm1330D3Z460 Aaed1-202ENSMUST00000220895 2858 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm1330D3Z460 Snx27-202ENSMUST00000107283 3531 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm1330D3Z460 Unc13b-201ENSMUST00000079978 6354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm1330D3Z460 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm1330D3Z460 A130014A01Rik-201ENSMUST00000183021 2323 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm1330D3Z460 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm1330D3Z460 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm1330D3Z460 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm1330D3Z460 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm1330D3Z460 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm1330D3Z460 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm1330D3Z460 Atxn7-202ENSMUST00000223714 2954 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm1330D3Z460 Gm16712-201ENSMUST00000181962 1960 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm1330D3Z460 Agpat3-203ENSMUST00000105388 3681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm1330D3Z460 Fam219b-202ENSMUST00000114200 3017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm1330D3Z460 Snx16-201ENSMUST00000029047 2288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm1330D3Z460 Prpf40b-212ENSMUST00000145482 3308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm1330D3Z460 Grb7-201ENSMUST00000019456 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm1330D3Z460 Lrrc7-201ENSMUST00000106044 5918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm1330D3Z460 Nepro-201ENSMUST00000048788 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm1330D3Z460 Nadk2-203ENSMUST00000100790 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm1330D3Z460 Aste1-202ENSMUST00000123807 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm1330D3Z460 Rtp2-201ENSMUST00000061030 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm1330D3Z460 H2-Q4-201ENSMUST00000081435 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm1330D3Z460 Krt81-201ENSMUST00000061185 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm1330D3Z460 Erlin1-201ENSMUST00000071698 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm1330D3Z460 Dynll2-202ENSMUST00000107923 2443 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm1330D3Z460 AC069562.2-201ENSMUST00000224644 2146 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm1330D3Z460 Coq5-201ENSMUST00000040421 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm1330D3Z460 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm1330D3Z460 A830073O21Rik-202ENSMUST00000205693 3096 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm1330D3Z460 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm1330D3Z460 Impdh1-210ENSMUST00000162739 2471 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm1330D3Z460 Hmbox1-203ENSMUST00000175744 1771 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm1330D3Z460 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm1330D3Z460 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm1330D3Z460 Pde8b-208ENSMUST00000162292 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm1330D3Z460 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm1330D3Z460 Zdhhc6-201ENSMUST00000076891 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm1330D3Z460 Atp6v0a1-203ENSMUST00000103110 2716 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm1330D3Z460 Wdr41-203ENSMUST00000160115 2851 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm1330D3Z460 Dus1l-202ENSMUST00000106133 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm1330D3Z460 Dhx32-203ENSMUST00000106139 2233 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm1330D3Z460 Plppr4-201ENSMUST00000061071 5696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm1330D3Z460 Hap1-201ENSMUST00000103124 2120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm1330D3Z460 Agbl5-208ENSMUST00000201168 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm1330D3Z460 Bambi-201ENSMUST00000025075 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm1330D3Z460 Tdg-ps-201ENSMUST00000051363 2968 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm1330D3Z460 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm1330D3Z460 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm1330D3Z460 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm1330D3Z460 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm1330D3Z460 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm1330D3Z460 Txnl1-201ENSMUST00000025476 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm1330D3Z460 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm1330D3Z460 Prmt1-203ENSMUST00000207370 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm1330D3Z460 Iqsec1-202ENSMUST00000101153 8036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm1330D3Z460 Cep135-202ENSMUST00000121979 5537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm1330D3Z460 Pard6g-201ENSMUST00000070219 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm1330D3Z460 Aspscr1-205ENSMUST00000106160 1550 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm1330D3Z460 Akap8l-201ENSMUST00000050214 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm1330D3Z460 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm1330D3Z460 Gsk3b-201ENSMUST00000023507 8303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm1330D3Z460 Dok4-201ENSMUST00000046461 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm1330D3Z460 Tfap2c-201ENSMUST00000030391 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm1330D3Z460 Pnpt1-201ENSMUST00000020756 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm1330D3Z460 Chst10-206ENSMUST00000194361 2996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm1330D3Z460 Susd1-202ENSMUST00000107544 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm1330D3Z460 Zfp512b-201ENSMUST00000108789 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm1330D3Z460 Prdm6-201ENSMUST00000091900 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm1330D3Z460 Atf7-209ENSMUST00000184485 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm1330D3Z460 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm1330D3Z460 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm1330D3Z460 Fmr1-205ENSMUST00000114656 4257 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm1330D3Z460 Cnot9-201ENSMUST00000087215 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm1330D3Z460 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm1330D3Z460 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm1330D3Z460 Lrrc47-205ENSMUST00000169622 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.9 ms