Protein–RNA interactions for Protein: D3Z3K2

Ccnb1ip1, E3 ubiquitin-protein ligase CCNB1IP1, mousemouse

Predictions only

Length 276 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccnb1ip1D3Z3K2 Zbtb22-201ENSMUST00000053429 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ccnb1ip1D3Z3K2 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ccnb1ip1D3Z3K2 Gm26676-201ENSMUST00000181877 2226 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ccnb1ip1D3Z3K2 Trim7-201ENSMUST00000046903 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ccnb1ip1D3Z3K2 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ccnb1ip1D3Z3K2 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ccnb1ip1D3Z3K2 Fgf23-201ENSMUST00000000186 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ccnb1ip1D3Z3K2 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ccnb1ip1D3Z3K2 Rraga-201ENSMUST00000091064 1618 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ccnb1ip1D3Z3K2 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ccnb1ip1D3Z3K2 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ccnb1ip1D3Z3K2 Myb-201ENSMUST00000020158 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ccnb1ip1D3Z3K2 Zfand5-201ENSMUST00000025659 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ccnb1ip1D3Z3K2 Rtn4-204ENSMUST00000102842 2257 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ccnb1ip1D3Z3K2 Vps53-203ENSMUST00000108419 2209 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ccnb1ip1D3Z3K2 Gm43808-201ENSMUST00000202534 2065 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Ccnb1ip1D3Z3K2 Arhgef17-204ENSMUST00000209041 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ccnb1ip1D3Z3K2 Diras1-201ENSMUST00000055125 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ccnb1ip1D3Z3K2 Btbd11-203ENSMUST00000105307 5788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ccnb1ip1D3Z3K2 Fbxo33-201ENSMUST00000043204 3688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ccnb1ip1D3Z3K2 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ccnb1ip1D3Z3K2 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ccnb1ip1D3Z3K2 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ccnb1ip1D3Z3K2 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ccnb1ip1D3Z3K2 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ccnb1ip1D3Z3K2 Trabd-201ENSMUST00000081702 2439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ccnb1ip1D3Z3K2 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ccnb1ip1D3Z3K2 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ccnb1ip1D3Z3K2 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ccnb1ip1D3Z3K2 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ccnb1ip1D3Z3K2 Mink1-202ENSMUST00000072873 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ccnb1ip1D3Z3K2 B4galnt4-201ENSMUST00000048002 3556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ccnb1ip1D3Z3K2 Gjb3-201ENSMUST00000046532 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ccnb1ip1D3Z3K2 Tmem57-201ENSMUST00000030628 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ccnb1ip1D3Z3K2 Pex5-202ENSMUST00000080557 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ccnb1ip1D3Z3K2 Phtf1-203ENSMUST00000090685 3006 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ccnb1ip1D3Z3K2 Agfg2-202ENSMUST00000100544 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ccnb1ip1D3Z3K2 Mpped2-202ENSMUST00000111063 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ccnb1ip1D3Z3K2 Gtpbp3-208ENSMUST00000168847 2803 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ccnb1ip1D3Z3K2 Pten-201ENSMUST00000013807 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ccnb1ip1D3Z3K2 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ccnb1ip1D3Z3K2 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ccnb1ip1D3Z3K2 Nploc4-201ENSMUST00000044271 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ccnb1ip1D3Z3K2 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ccnb1ip1D3Z3K2 Slc11a1-201ENSMUST00000027368 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ccnb1ip1D3Z3K2 Mapkapk3-201ENSMUST00000035194 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ccnb1ip1D3Z3K2 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Ccnb1ip1D3Z3K2 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ccnb1ip1D3Z3K2 Dus1l-202ENSMUST00000106133 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ccnb1ip1D3Z3K2 Ocel1-202ENSMUST00000110051 2179 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ccnb1ip1D3Z3K2 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ccnb1ip1D3Z3K2 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ccnb1ip1D3Z3K2 Unc13b-201ENSMUST00000079978 6354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ccnb1ip1D3Z3K2 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Ccnb1ip1D3Z3K2 Fmnl3-202ENSMUST00000088233 4423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ccnb1ip1D3Z3K2 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ccnb1ip1D3Z3K2 Dach1-201ENSMUST00000069334 5063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ccnb1ip1D3Z3K2 Mief1-203ENSMUST00000228788 5352 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ccnb1ip1D3Z3K2 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ccnb1ip1D3Z3K2 Gpr20-201ENSMUST00000064166 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ccnb1ip1D3Z3K2 Axin1-203ENSMUST00000163421 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ccnb1ip1D3Z3K2 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ccnb1ip1D3Z3K2 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ccnb1ip1D3Z3K2 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ccnb1ip1D3Z3K2 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ccnb1ip1D3Z3K2 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Ccnb1ip1D3Z3K2 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ccnb1ip1D3Z3K2 Il6st-208ENSMUST00000184311 2985 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ccnb1ip1D3Z3K2 Kmt5b-202ENSMUST00000052699 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ccnb1ip1D3Z3K2 Nadk2-202ENSMUST00000100789 3578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ccnb1ip1D3Z3K2 Usp47-201ENSMUST00000106653 5540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ccnb1ip1D3Z3K2 Ubfd1-201ENSMUST00000033158 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ccnb1ip1D3Z3K2 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ccnb1ip1D3Z3K2 Sh3rf3-205ENSMUST00000153031 5682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ccnb1ip1D3Z3K2 Crebzf-201ENSMUST00000061767 3376 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ccnb1ip1D3Z3K2 Rgl2-201ENSMUST00000047503 3252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ccnb1ip1D3Z3K2 Klhl5-204ENSMUST00000204097 3149 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ccnb1ip1D3Z3K2 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ccnb1ip1D3Z3K2 Med9-201ENSMUST00000081980 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ccnb1ip1D3Z3K2 C230012O17Rik-201ENSMUST00000130085 2999 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ccnb1ip1D3Z3K2 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ccnb1ip1D3Z3K2 Arntl-204ENSMUST00000210238 2976 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ccnb1ip1D3Z3K2 Slc7a5-201ENSMUST00000045557 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ccnb1ip1D3Z3K2 Fxyd6-201ENSMUST00000085939 1788 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ccnb1ip1D3Z3K2 Abhd10-201ENSMUST00000066983 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ccnb1ip1D3Z3K2 Dhx30-224ENSMUST00000200066 4623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ccnb1ip1D3Z3K2 Mturn-203ENSMUST00000190641 5303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ccnb1ip1D3Z3K2 Unc13b-203ENSMUST00000107953 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ccnb1ip1D3Z3K2 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ccnb1ip1D3Z3K2 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ccnb1ip1D3Z3K2 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ccnb1ip1D3Z3K2 Chst2-201ENSMUST00000036267 7328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ccnb1ip1D3Z3K2 Wdtc1-201ENSMUST00000043305 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ccnb1ip1D3Z3K2 Col13a1-204ENSMUST00000105453 2935 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ccnb1ip1D3Z3K2 Crebl2-201ENSMUST00000046303 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ccnb1ip1D3Z3K2 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ccnb1ip1D3Z3K2 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ccnb1ip1D3Z3K2 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Ccnb1ip1D3Z3K2 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ccnb1ip1D3Z3K2 Col11a2-202ENSMUST00000114252 5620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.8 ms