Protein–RNA interactions for Protein: B9EK86

Vmn1r180, Vomeronasal type-1 receptor, mousemouse

Predictions only

Length 305 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn1r180B9EK86 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Vmn1r180B9EK86 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Vmn1r180B9EK86 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Vmn1r180B9EK86 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Vmn1r180B9EK86 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Vmn1r180B9EK86 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Vmn1r180B9EK86 Nf2-205ENSMUST00000109910 4720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Vmn1r180B9EK86 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Vmn1r180B9EK86 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Vmn1r180B9EK86 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Vmn1r180B9EK86 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Vmn1r180B9EK86 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Vmn1r180B9EK86 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Vmn1r180B9EK86 Agap3-205ENSMUST00000199856 2685 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Vmn1r180B9EK86 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Vmn1r180B9EK86 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Vmn1r180B9EK86 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Vmn1r180B9EK86 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Vmn1r180B9EK86 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Vmn1r180B9EK86 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Vmn1r180B9EK86 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Vmn1r180B9EK86 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Vmn1r180B9EK86 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Vmn1r180B9EK86 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Vmn1r180B9EK86 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Vmn1r180B9EK86 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Vmn1r180B9EK86 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Vmn1r180B9EK86 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Vmn1r180B9EK86 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Vmn1r180B9EK86 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Vmn1r180B9EK86 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Vmn1r180B9EK86 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Vmn1r180B9EK86 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Vmn1r180B9EK86 Prex1-201ENSMUST00000036719 6533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Vmn1r180B9EK86 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Vmn1r180B9EK86 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Vmn1r180B9EK86 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Vmn1r180B9EK86 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Vmn1r180B9EK86 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Vmn1r180B9EK86 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Vmn1r180B9EK86 Adra2a-201ENSMUST00000036700 3801 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Vmn1r180B9EK86 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Vmn1r180B9EK86 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Vmn1r180B9EK86 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Vmn1r180B9EK86 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Vmn1r180B9EK86 Sqstm1-201ENSMUST00000015981 2673 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Vmn1r180B9EK86 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Vmn1r180B9EK86 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Vmn1r180B9EK86 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Vmn1r180B9EK86 Dzip3-202ENSMUST00000121869 5820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Vmn1r180B9EK86 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Vmn1r180B9EK86 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Vmn1r180B9EK86 Ptprt-201ENSMUST00000109441 6623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Vmn1r180B9EK86 Gm44832-201ENSMUST00000208849 2303 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Vmn1r180B9EK86 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Vmn1r180B9EK86 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Vmn1r180B9EK86 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Vmn1r180B9EK86 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Vmn1r180B9EK86 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Vmn1r180B9EK86 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Vmn1r180B9EK86 Mapk8ip3-221ENSMUST00000178969 5579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Vmn1r180B9EK86 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Vmn1r180B9EK86 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Vmn1r180B9EK86 Amfr-201ENSMUST00000053766 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Vmn1r180B9EK86 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Vmn1r180B9EK86 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Vmn1r180B9EK86 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Vmn1r180B9EK86 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Vmn1r180B9EK86 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Vmn1r180B9EK86 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Vmn1r180B9EK86 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Vmn1r180B9EK86 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Vmn1r180B9EK86 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Vmn1r180B9EK86 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Vmn1r180B9EK86 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Vmn1r180B9EK86 Fmr1-201ENSMUST00000088546 4409 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Vmn1r180B9EK86 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Vmn1r180B9EK86 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Vmn1r180B9EK86 Dixdc1-207ENSMUST00000121634 2420 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Vmn1r180B9EK86 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Vmn1r180B9EK86 Myo5b-201ENSMUST00000074157 6745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Vmn1r180B9EK86 Rimbp3-201ENSMUST00000169803 5787 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Vmn1r180B9EK86 Ube3c-201ENSMUST00000049453 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Vmn1r180B9EK86 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Vmn1r180B9EK86 Mid2-202ENSMUST00000112990 6271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Vmn1r180B9EK86 Nbea-201ENSMUST00000029374 10986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Vmn1r180B9EK86 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Vmn1r180B9EK86 Plekha7-210ENSMUST00000182834 5257 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Vmn1r180B9EK86 Fam171b-201ENSMUST00000051454 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Vmn1r180B9EK86 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Vmn1r180B9EK86 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Vmn1r180B9EK86 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Vmn1r180B9EK86 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Vmn1r180B9EK86 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Vmn1r180B9EK86 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Vmn1r180B9EK86 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Vmn1r180B9EK86 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Vmn1r180B9EK86 Galnt13-204ENSMUST00000112636 7530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Vmn1r180B9EK86 Trim67-202ENSMUST00000167588 8735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Vmn1r180B9EK86 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.4 ms