Protein–RNA interactions for Protein: B2RXZ1

Pnldc1, Poly(A)-specific ribonuclease PNLDC1, mousemouse

Predictions only

Length 531 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pnldc1B2RXZ1 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Pnldc1B2RXZ1 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Pnldc1B2RXZ1 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Pnldc1B2RXZ1 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Pnldc1B2RXZ1 Runx1t1-201ENSMUST00000006761 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Pnldc1B2RXZ1 BC034090-204ENSMUST00000186156 4873 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Pnldc1B2RXZ1 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Pnldc1B2RXZ1 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Pnldc1B2RXZ1 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Pnldc1B2RXZ1 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Pnldc1B2RXZ1 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Pnldc1B2RXZ1 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Pnldc1B2RXZ1 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Pnldc1B2RXZ1 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Pnldc1B2RXZ1 Ahcyl2-202ENSMUST00000102995 5155 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Pnldc1B2RXZ1 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Pnldc1B2RXZ1 Itsn1-205ENSMUST00000113996 5147 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Pnldc1B2RXZ1 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Pnldc1B2RXZ1 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Pnldc1B2RXZ1 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Pnldc1B2RXZ1 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Pnldc1B2RXZ1 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Pnldc1B2RXZ1 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Pnldc1B2RXZ1 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Pnldc1B2RXZ1 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Pnldc1B2RXZ1 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Pnldc1B2RXZ1 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Pnldc1B2RXZ1 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Pnldc1B2RXZ1 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Pnldc1B2RXZ1 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Pnldc1B2RXZ1 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
Pnldc1B2RXZ1 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Pnldc1B2RXZ1 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Pnldc1B2RXZ1 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Pnldc1B2RXZ1 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Pnldc1B2RXZ1 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Pnldc1B2RXZ1 Map3k1-201ENSMUST00000109267 6978 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Pnldc1B2RXZ1 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Pnldc1B2RXZ1 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Pnldc1B2RXZ1 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Pnldc1B2RXZ1 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Pnldc1B2RXZ1 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Pnldc1B2RXZ1 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Pnldc1B2RXZ1 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Pnldc1B2RXZ1 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Pnldc1B2RXZ1 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Pnldc1B2RXZ1 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Pnldc1B2RXZ1 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Pnldc1B2RXZ1 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Pnldc1B2RXZ1 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Pnldc1B2RXZ1 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Pnldc1B2RXZ1 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Pnldc1B2RXZ1 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Pnldc1B2RXZ1 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Pnldc1B2RXZ1 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Pnldc1B2RXZ1 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Pnldc1B2RXZ1 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Pnldc1B2RXZ1 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Pnldc1B2RXZ1 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Pnldc1B2RXZ1 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Pnldc1B2RXZ1 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Pnldc1B2RXZ1 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Pnldc1B2RXZ1 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Pnldc1B2RXZ1 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Pnldc1B2RXZ1 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Pnldc1B2RXZ1 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Pnldc1B2RXZ1 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Pnldc1B2RXZ1 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Pnldc1B2RXZ1 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Pnldc1B2RXZ1 Pitpnm2-210ENSMUST00000162812 6952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Pnldc1B2RXZ1 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Pnldc1B2RXZ1 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Pnldc1B2RXZ1 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Pnldc1B2RXZ1 Gm7290-201ENSMUST00000104990 617 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Pnldc1B2RXZ1 Gm12918-201ENSMUST00000120234 636 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Pnldc1B2RXZ1 Gm15710-201ENSMUST00000121821 636 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Pnldc1B2RXZ1 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Pnldc1B2RXZ1 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Pnldc1B2RXZ1 Gm5075-201ENSMUST00000196916 622 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Pnldc1B2RXZ1 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Pnldc1B2RXZ1 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Pnldc1B2RXZ1 Rpl13-ps6-201ENSMUST00000079761 636 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Pnldc1B2RXZ1 Rpl13-ps3-201ENSMUST00000079960 624 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Pnldc1B2RXZ1 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Pnldc1B2RXZ1 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Pnldc1B2RXZ1 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Pnldc1B2RXZ1 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Pnldc1B2RXZ1 Adcy2-201ENSMUST00000022013 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Pnldc1B2RXZ1 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Pnldc1B2RXZ1 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Pnldc1B2RXZ1 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Pnldc1B2RXZ1 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Pnldc1B2RXZ1 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.51
Pnldc1B2RXZ1 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
Pnldc1B2RXZ1 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Pnldc1B2RXZ1 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Pnldc1B2RXZ1 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Pnldc1B2RXZ1 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Pnldc1B2RXZ1 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Pnldc1B2RXZ1 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.1 ms