Protein–RNA interactions for Protein: B2RXA7

Cyp26c1, Cytochrome P450, family 26, subfamily c, polypeptide 1, mousemouse

Predictions only

Length 518 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cyp26c1B2RXA7 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Cyp26c1B2RXA7 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Cyp26c1B2RXA7 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Cyp26c1B2RXA7 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Cyp26c1B2RXA7 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Cyp26c1B2RXA7 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Cyp26c1B2RXA7 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Cyp26c1B2RXA7 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Cyp26c1B2RXA7 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Cyp26c1B2RXA7 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Cyp26c1B2RXA7 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Cyp26c1B2RXA7 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Cyp26c1B2RXA7 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Cyp26c1B2RXA7 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Cyp26c1B2RXA7 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Cyp26c1B2RXA7 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Cyp26c1B2RXA7 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Cyp26c1B2RXA7 Gm45447-201ENSMUST00000209874 1805 ntTSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Cyp26c1B2RXA7 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Cyp26c1B2RXA7 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Cyp26c1B2RXA7 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Cyp26c1B2RXA7 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC20.84■□□□□ 0.93
Cyp26c1B2RXA7 Gm6365-201ENSMUST00000054711 744 ntBASIC20.84■□□□□ 0.93
Cyp26c1B2RXA7 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Cyp26c1B2RXA7 Atp8b2-202ENSMUST00000107396 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Cyp26c1B2RXA7 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Cyp26c1B2RXA7 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Cyp26c1B2RXA7 Cpeb2-204ENSMUST00000166713 6846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Cyp26c1B2RXA7 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Cyp26c1B2RXA7 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Cyp26c1B2RXA7 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Cyp26c1B2RXA7 Adgrl1-207ENSMUST00000141158 8181 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Cyp26c1B2RXA7 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Cyp26c1B2RXA7 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC20.83■□□□□ 0.93
Cyp26c1B2RXA7 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
Cyp26c1B2RXA7 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Cyp26c1B2RXA7 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Cyp26c1B2RXA7 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Cyp26c1B2RXA7 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Cyp26c1B2RXA7 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Cyp26c1B2RXA7 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Cyp26c1B2RXA7 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Cyp26c1B2RXA7 Rassf8-203ENSMUST00000111704 5446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Cyp26c1B2RXA7 Zfp637-201ENSMUST00000112858 650 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Cyp26c1B2RXA7 Zfp637-203ENSMUST00000112860 1231 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Cyp26c1B2RXA7 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Cyp26c1B2RXA7 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Cyp26c1B2RXA7 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Cyp26c1B2RXA7 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Cyp26c1B2RXA7 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Cyp26c1B2RXA7 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Cyp26c1B2RXA7 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Cyp26c1B2RXA7 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Cyp26c1B2RXA7 Gm7290-201ENSMUST00000104990 617 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
Cyp26c1B2RXA7 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Cyp26c1B2RXA7 Gm12918-201ENSMUST00000120234 636 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
Cyp26c1B2RXA7 Gm15710-201ENSMUST00000121821 636 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
Cyp26c1B2RXA7 Gm5075-201ENSMUST00000196916 622 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
Cyp26c1B2RXA7 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
Cyp26c1B2RXA7 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
Cyp26c1B2RXA7 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Cyp26c1B2RXA7 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Cyp26c1B2RXA7 Rpl13-ps6-201ENSMUST00000079761 636 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
Cyp26c1B2RXA7 Rpl13-ps3-201ENSMUST00000079960 624 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
Cyp26c1B2RXA7 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Cyp26c1B2RXA7 B3gat2-202ENSMUST00000140583 1737 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Cyp26c1B2RXA7 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Cyp26c1B2RXA7 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Cyp26c1B2RXA7 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Cyp26c1B2RXA7 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Cyp26c1B2RXA7 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Cyp26c1B2RXA7 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
Cyp26c1B2RXA7 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Cyp26c1B2RXA7 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Cyp26c1B2RXA7 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Cyp26c1B2RXA7 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Cyp26c1B2RXA7 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Cyp26c1B2RXA7 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Cyp26c1B2RXA7 1700003E16Rik-202ENSMUST00000203203 2070 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Cyp26c1B2RXA7 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Cyp26c1B2RXA7 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Cyp26c1B2RXA7 Tmem127-201ENSMUST00000035871 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Cyp26c1B2RXA7 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Cyp26c1B2RXA7 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Cyp26c1B2RXA7 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
Cyp26c1B2RXA7 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Cyp26c1B2RXA7 Icmt-201ENSMUST00000048892 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Cyp26c1B2RXA7 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Cyp26c1B2RXA7 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
Cyp26c1B2RXA7 Hbs1l-202ENSMUST00000061324 1998 ntTSL 3 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Cyp26c1B2RXA7 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Cyp26c1B2RXA7 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Cyp26c1B2RXA7 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Cyp26c1B2RXA7 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Cyp26c1B2RXA7 Dynll2-202ENSMUST00000107923 2443 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Cyp26c1B2RXA7 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Cyp26c1B2RXA7 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Cyp26c1B2RXA7 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Cyp26c1B2RXA7 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
Cyp26c1B2RXA7 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.6 ms