Protein–RNA interactions for Protein: B2RTN3

Zscan5b, Zinc finger and SCAN domain-containing 5B, mousemouse

Predictions only

Length 468 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zscan5bB2RTN3 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Zscan5bB2RTN3 Dmrta2os-202ENSMUST00000141893 691 ntTSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Zscan5bB2RTN3 Gm11527-201ENSMUST00000153795 596 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Zscan5bB2RTN3 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Zscan5bB2RTN3 Nrn1l-201ENSMUST00000060167 617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Zscan5bB2RTN3 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Zscan5bB2RTN3 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Zscan5bB2RTN3 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Zscan5bB2RTN3 Tmem145-202ENSMUST00000119703 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Zscan5bB2RTN3 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Zscan5bB2RTN3 Flg-201ENSMUST00000050758 1488 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
Zscan5bB2RTN3 Gnptab-201ENSMUST00000020251 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Zscan5bB2RTN3 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
Zscan5bB2RTN3 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Zscan5bB2RTN3 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Zscan5bB2RTN3 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Zscan5bB2RTN3 Gm16054-201ENSMUST00000139469 1819 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Zscan5bB2RTN3 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Zscan5bB2RTN3 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Zscan5bB2RTN3 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Zscan5bB2RTN3 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Zscan5bB2RTN3 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Zscan5bB2RTN3 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Zscan5bB2RTN3 Gm15847-201ENSMUST00000121417 1065 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
Zscan5bB2RTN3 Gm10653-202ENSMUST00000139570 835 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
Zscan5bB2RTN3 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Zscan5bB2RTN3 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Zscan5bB2RTN3 Gm37856-201ENSMUST00000191634 999 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
Zscan5bB2RTN3 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Zscan5bB2RTN3 Zfp382-201ENSMUST00000098596 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Zscan5bB2RTN3 Tfdp2-209ENSMUST00000188750 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Zscan5bB2RTN3 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Zscan5bB2RTN3 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Zscan5bB2RTN3 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Zscan5bB2RTN3 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Zscan5bB2RTN3 Tpd52l1-201ENSMUST00000000305 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Zscan5bB2RTN3 Gpr137b-ps-203ENSMUST00000220758 1942 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Zscan5bB2RTN3 AL591207.1-203ENSMUST00000222401 1380 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Zscan5bB2RTN3 Crtap-201ENSMUST00000084881 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Zscan5bB2RTN3 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Zscan5bB2RTN3 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Zscan5bB2RTN3 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Zscan5bB2RTN3 Rps14-202ENSMUST00000118551 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Zscan5bB2RTN3 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Zscan5bB2RTN3 Gm27011-201ENSMUST00000182352 972 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
Zscan5bB2RTN3 Wnt10b-205ENSMUST00000226846 1204 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
Zscan5bB2RTN3 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Zscan5bB2RTN3 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Zscan5bB2RTN3 Gm45447-201ENSMUST00000209874 1805 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Zscan5bB2RTN3 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Zscan5bB2RTN3 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Zscan5bB2RTN3 Hist1h4c-201ENSMUST00000102967 820 ntAPPRIS P1 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Zscan5bB2RTN3 Arl6ip4-202ENSMUST00000122394 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Zscan5bB2RTN3 Gm20760-201ENSMUST00000179197 648 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
Zscan5bB2RTN3 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Zscan5bB2RTN3 Trmt13-210ENSMUST00000198454 880 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
Zscan5bB2RTN3 Cck-204ENSMUST00000216138 799 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Zscan5bB2RTN3 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Zscan5bB2RTN3 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Zscan5bB2RTN3 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Zscan5bB2RTN3 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Zscan5bB2RTN3 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Zscan5bB2RTN3 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Zscan5bB2RTN3 Tril-201ENSMUST00000127748 5363 ntAPPRIS P1 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Zscan5bB2RTN3 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Zscan5bB2RTN3 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Zscan5bB2RTN3 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
Zscan5bB2RTN3 D130020L05Rik-202ENSMUST00000220889 769 ntTSL 3 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Zscan5bB2RTN3 AC135637.1-201ENSMUST00000227750 365 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
Zscan5bB2RTN3 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Zscan5bB2RTN3 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Zscan5bB2RTN3 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Zscan5bB2RTN3 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Zscan5bB2RTN3 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Zscan5bB2RTN3 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Zscan5bB2RTN3 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Zscan5bB2RTN3 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Zscan5bB2RTN3 AC121961.1-201ENSMUST00000218594 1779 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
Zscan5bB2RTN3 Eva1a-201ENSMUST00000042974 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Zscan5bB2RTN3 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Zscan5bB2RTN3 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Zscan5bB2RTN3 Gm26657-201ENSMUST00000181745 1308 ntAPPRIS P1 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Zscan5bB2RTN3 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Zscan5bB2RTN3 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Zscan5bB2RTN3 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Zscan5bB2RTN3 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Zscan5bB2RTN3 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Zscan5bB2RTN3 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Zscan5bB2RTN3 Tnfaip8-208ENSMUST00000148989 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Zscan5bB2RTN3 Lrch3-201ENSMUST00000023491 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Zscan5bB2RTN3 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Zscan5bB2RTN3 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Zscan5bB2RTN3 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Zscan5bB2RTN3 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
Zscan5bB2RTN3 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Zscan5bB2RTN3 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Zscan5bB2RTN3 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Zscan5bB2RTN3 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Zscan5bB2RTN3 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Zscan5bB2RTN3 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22 ms