Protein–RNA interactions for Protein: B2RRL2

Jrkl, Jerky protein homolog-like, mousemouse

Predictions only

Length 523 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
JrklB2RRL2 Agap3-205ENSMUST00000199856 2685 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
JrklB2RRL2 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
JrklB2RRL2 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
JrklB2RRL2 Tmem136-202ENSMUST00000213544 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
JrklB2RRL2 Coq5-201ENSMUST00000040421 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
JrklB2RRL2 Rnf169-201ENSMUST00000080817 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
JrklB2RRL2 Nf2-205ENSMUST00000109910 4720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
JrklB2RRL2 Mrgprf-202ENSMUST00000117718 1935 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
JrklB2RRL2 Exoc3l2-202ENSMUST00000137613 4016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
JrklB2RRL2 Bin2-204ENSMUST00000182775 1908 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
JrklB2RRL2 Tsnax-202ENSMUST00000212603 2169 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
JrklB2RRL2 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
JrklB2RRL2 Icam5-201ENSMUST00000019616 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
JrklB2RRL2 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
JrklB2RRL2 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
JrklB2RRL2 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
JrklB2RRL2 Gm37805-201ENSMUST00000192612 1094 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
JrklB2RRL2 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
JrklB2RRL2 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
JrklB2RRL2 Zfp768-201ENSMUST00000060783 2356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
JrklB2RRL2 Fst-202ENSMUST00000223640 2612 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
JrklB2RRL2 Usp13-202ENSMUST00000108228 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
JrklB2RRL2 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
JrklB2RRL2 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
JrklB2RRL2 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
JrklB2RRL2 Whrn-205ENSMUST00000095038 2665 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
JrklB2RRL2 Smim15-205ENSMUST00000225972 2097 ntAPPRIS P1 BASIC18.72■□□□□ 0.59
JrklB2RRL2 Gm38308-201ENSMUST00000194934 1809 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
JrklB2RRL2 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
JrklB2RRL2 Prdm6-203ENSMUST00000115399 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
JrklB2RRL2 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
JrklB2RRL2 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
JrklB2RRL2 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
JrklB2RRL2 Lysmd4-209ENSMUST00000208998 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
JrklB2RRL2 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
JrklB2RRL2 Golga7-202ENSMUST00000121783 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
JrklB2RRL2 AC163637.2-201ENSMUST00000213826 1945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
JrklB2RRL2 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
JrklB2RRL2 Deaf1-209ENSMUST00000211537 2882 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
JrklB2RRL2 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
JrklB2RRL2 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
JrklB2RRL2 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
JrklB2RRL2 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
JrklB2RRL2 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
JrklB2RRL2 Hspa5-202ENSMUST00000100171 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
JrklB2RRL2 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
JrklB2RRL2 Wnt10b-202ENSMUST00000166022 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
JrklB2RRL2 Fst-201ENSMUST00000022287 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
JrklB2RRL2 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
JrklB2RRL2 Gm9954-202ENSMUST00000198686 4725 ntBASIC18.71■□□□□ 0.58
JrklB2RRL2 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.58
JrklB2RRL2 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
JrklB2RRL2 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
JrklB2RRL2 Larp4b-201ENSMUST00000091829 5720 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
JrklB2RRL2 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
JrklB2RRL2 C2cd4c-202ENSMUST00000178228 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
JrklB2RRL2 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
JrklB2RRL2 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC18.7■□□□□ 0.58
JrklB2RRL2 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
JrklB2RRL2 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
JrklB2RRL2 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
JrklB2RRL2 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
JrklB2RRL2 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
JrklB2RRL2 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
JrklB2RRL2 Tacc3-203ENSMUST00000114426 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
JrklB2RRL2 Fbxo47-201ENSMUST00000093939 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
JrklB2RRL2 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
JrklB2RRL2 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
JrklB2RRL2 AC121961.1-201ENSMUST00000218594 1779 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
JrklB2RRL2 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
JrklB2RRL2 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC18.69■□□□□ 0.58
JrklB2RRL2 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
JrklB2RRL2 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
JrklB2RRL2 Asb1-202ENSMUST00000086843 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
JrklB2RRL2 Pfn2-201ENSMUST00000066882 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
JrklB2RRL2 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
JrklB2RRL2 C1ql3-201ENSMUST00000061545 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
JrklB2RRL2 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
JrklB2RRL2 Atp8b2-201ENSMUST00000069805 5559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
JrklB2RRL2 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
JrklB2RRL2 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
JrklB2RRL2 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
JrklB2RRL2 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
JrklB2RRL2 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
JrklB2RRL2 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC18.68■□□□□ 0.58
JrklB2RRL2 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
JrklB2RRL2 Uhmk1-202ENSMUST00000123399 7775 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
JrklB2RRL2 Dach1-202ENSMUST00000071533 5219 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
JrklB2RRL2 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
JrklB2RRL2 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
JrklB2RRL2 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
JrklB2RRL2 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
JrklB2RRL2 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
JrklB2RRL2 Pick1-201ENSMUST00000018295 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
JrklB2RRL2 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
JrklB2RRL2 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
JrklB2RRL2 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
JrklB2RRL2 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
JrklB2RRL2 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
JrklB2RRL2 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.3 ms