Protein–RNA interactions for Protein: B1AZQ8

Cldn34b1, Claudin 34B1, mousemouse

Predictions only

Length 209 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn34b1B1AZQ8 Nrn1l-201ENSMUST00000060167 617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Cldn34b1B1AZQ8 Tmem145-202ENSMUST00000119703 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Cldn34b1B1AZQ8 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Cldn34b1B1AZQ8 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Cldn34b1B1AZQ8 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC18.08■□□□□ 0.49
Cldn34b1B1AZQ8 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Cldn34b1B1AZQ8 Flg-201ENSMUST00000050758 1488 ntBASIC18.08■□□□□ 0.49
Cldn34b1B1AZQ8 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Cldn34b1B1AZQ8 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Cldn34b1B1AZQ8 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Cldn34b1B1AZQ8 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Cldn34b1B1AZQ8 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Cldn34b1B1AZQ8 Pard3-219ENSMUST00000162309 5659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Cldn34b1B1AZQ8 Tpd52l1-201ENSMUST00000000305 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Cldn34b1B1AZQ8 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Cldn34b1B1AZQ8 Rps14-202ENSMUST00000118551 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Cldn34b1B1AZQ8 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Cldn34b1B1AZQ8 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Cldn34b1B1AZQ8 Arhgap23-203ENSMUST00000121799 5816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Cldn34b1B1AZQ8 Gpr137b-ps-203ENSMUST00000220758 1942 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Cldn34b1B1AZQ8 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Cldn34b1B1AZQ8 AL591207.1-203ENSMUST00000222401 1380 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Cldn34b1B1AZQ8 Zfp382-201ENSMUST00000098596 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Cldn34b1B1AZQ8 Tfdp2-209ENSMUST00000188750 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Cldn34b1B1AZQ8 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Cldn34b1B1AZQ8 Crtap-201ENSMUST00000084881 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Cldn34b1B1AZQ8 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Cldn34b1B1AZQ8 Gnptab-201ENSMUST00000020251 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Cldn34b1B1AZQ8 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Cldn34b1B1AZQ8 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Cldn34b1B1AZQ8 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Cldn34b1B1AZQ8 Gm15847-201ENSMUST00000121417 1065 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Cldn34b1B1AZQ8 Gm10653-202ENSMUST00000139570 835 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Cldn34b1B1AZQ8 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Cldn34b1B1AZQ8 Gm37856-201ENSMUST00000191634 999 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Cldn34b1B1AZQ8 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Cldn34b1B1AZQ8 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Cldn34b1B1AZQ8 Gm45447-201ENSMUST00000209874 1805 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Cldn34b1B1AZQ8 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Cldn34b1B1AZQ8 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Cldn34b1B1AZQ8 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Cldn34b1B1AZQ8 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Cldn34b1B1AZQ8 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Cldn34b1B1AZQ8 Gm27011-201ENSMUST00000182352 972 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Cldn34b1B1AZQ8 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Cldn34b1B1AZQ8 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Cldn34b1B1AZQ8 Scaf11-201ENSMUST00000047835 5766 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cldn34b1B1AZQ8 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cldn34b1B1AZQ8 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cldn34b1B1AZQ8 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cldn34b1B1AZQ8 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cldn34b1B1AZQ8 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cldn34b1B1AZQ8 Hist1h4c-201ENSMUST00000102967 820 ntAPPRIS P1 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cldn34b1B1AZQ8 Arl6ip4-202ENSMUST00000122394 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cldn34b1B1AZQ8 Gm20760-201ENSMUST00000179197 648 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Cldn34b1B1AZQ8 Cck-204ENSMUST00000216138 799 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cldn34b1B1AZQ8 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cldn34b1B1AZQ8 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cldn34b1B1AZQ8 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cldn34b1B1AZQ8 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cldn34b1B1AZQ8 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cldn34b1B1AZQ8 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cldn34b1B1AZQ8 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cldn34b1B1AZQ8 AC121961.1-201ENSMUST00000218594 1779 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Cldn34b1B1AZQ8 Eva1a-201ENSMUST00000042974 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cldn34b1B1AZQ8 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cldn34b1B1AZQ8 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cldn34b1B1AZQ8 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cldn34b1B1AZQ8 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Cldn34b1B1AZQ8 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cldn34b1B1AZQ8 Trmt13-210ENSMUST00000198454 880 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Cldn34b1B1AZQ8 AC135637.1-201ENSMUST00000227750 365 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Cldn34b1B1AZQ8 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cldn34b1B1AZQ8 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cldn34b1B1AZQ8 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cldn34b1B1AZQ8 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cldn34b1B1AZQ8 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cldn34b1B1AZQ8 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cldn34b1B1AZQ8 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cldn34b1B1AZQ8 Gm26657-201ENSMUST00000181745 1308 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cldn34b1B1AZQ8 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cldn34b1B1AZQ8 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cldn34b1B1AZQ8 D130020L05Rik-202ENSMUST00000220889 769 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cldn34b1B1AZQ8 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cldn34b1B1AZQ8 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cldn34b1B1AZQ8 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cldn34b1B1AZQ8 Cdkl3-203ENSMUST00000109076 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Cldn34b1B1AZQ8 Gm43213-201ENSMUST00000151866 1790 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Cldn34b1B1AZQ8 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Cldn34b1B1AZQ8 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Cldn34b1B1AZQ8 Tnfaip8-208ENSMUST00000148989 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Cldn34b1B1AZQ8 Wnt10b-202ENSMUST00000166022 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Cldn34b1B1AZQ8 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Cldn34b1B1AZQ8 Zfp783-201ENSMUST00000095946 670 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Cldn34b1B1AZQ8 Tril-201ENSMUST00000127748 5363 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Cldn34b1B1AZQ8 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Cldn34b1B1AZQ8 Gm38308-201ENSMUST00000194934 1809 ntBASIC18.02■□□□□ 0.47
Cldn34b1B1AZQ8 Chtop-203ENSMUST00000076639 1842 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Cldn34b1B1AZQ8 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cldn34b1B1AZQ8 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.9 ms