Protein–RNA interactions for Protein: B0V2N1

Ptprs, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase S, mousemouse

Predictions only

Length 1,907 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprsB0V2N1 Atxn7l2-202ENSMUST00000117409 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
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PtprsB0V2N1 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
PtprsB0V2N1 Mag-207ENSMUST00000191081 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
PtprsB0V2N1 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
PtprsB0V2N1 C1ql3-201ENSMUST00000061545 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
PtprsB0V2N1 Gm38345-201ENSMUST00000192635 1748 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
PtprsB0V2N1 Vsig10-201ENSMUST00000086464 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
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PtprsB0V2N1 Snx12-204ENSMUST00000156473 1114 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
PtprsB0V2N1 Aldoa-ps3-201ENSMUST00000217558 306 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
PtprsB0V2N1 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
PtprsB0V2N1 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
PtprsB0V2N1 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
PtprsB0V2N1 Dixdc1-207ENSMUST00000121634 2420 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
PtprsB0V2N1 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
PtprsB0V2N1 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
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PtprsB0V2N1 Por-201ENSMUST00000005651 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
PtprsB0V2N1 Gm12527-201ENSMUST00000117967 564 ntBASIC16.96■□□□□ 0.3
PtprsB0V2N1 Gpr137b-ps-203ENSMUST00000220758 1942 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
PtprsB0V2N1 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
PtprsB0V2N1 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
PtprsB0V2N1 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
PtprsB0V2N1 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
PtprsB0V2N1 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
PtprsB0V2N1 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
PtprsB0V2N1 Lysmd4-209ENSMUST00000208998 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
PtprsB0V2N1 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
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PtprsB0V2N1 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
PtprsB0V2N1 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
PtprsB0V2N1 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
PtprsB0V2N1 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
PtprsB0V2N1 Ppp1r36-201ENSMUST00000063977 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
PtprsB0V2N1 Aqp5-201ENSMUST00000088200 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
PtprsB0V2N1 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
PtprsB0V2N1 1700101I19Rik-202ENSMUST00000186712 510 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
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PtprsB0V2N1 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
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PtprsB0V2N1 Cspg5-205ENSMUST00000199736 2107 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
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PtprsB0V2N1 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
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PtprsB0V2N1 H2-DMa-201ENSMUST00000042121 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
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PtprsB0V2N1 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
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PtprsB0V2N1 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
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PtprsB0V2N1 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
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PtprsB0V2N1 Tfap4-201ENSMUST00000005862 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
PtprsB0V2N1 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
PtprsB0V2N1 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
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PtprsB0V2N1 Rsph6a-201ENSMUST00000035521 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
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PtprsB0V2N1 Oxct2b-201ENSMUST00000102648 1735 ntAPPRIS P1 BASIC16.92■□□□□ 0.3
PtprsB0V2N1 Gm16897-201ENSMUST00000180780 2492 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
PtprsB0V2N1 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
PtprsB0V2N1 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
PtprsB0V2N1 Gm37811-201ENSMUST00000192416 2601 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
PtprsB0V2N1 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
PtprsB0V2N1 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
PtprsB0V2N1 Slc29a1-201ENSMUST00000051574 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
PtprsB0V2N1 Nfatc2-205ENSMUST00000137451 2369 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
PtprsB0V2N1 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
PtprsB0V2N1 Mpz-202ENSMUST00000111334 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
PtprsB0V2N1 Speg-204ENSMUST00000113589 833 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
PtprsB0V2N1 Gm20049-201ENSMUST00000219950 730 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
PtprsB0V2N1 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
PtprsB0V2N1 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
PtprsB0V2N1 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
PtprsB0V2N1 Smu1-201ENSMUST00000030117 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
PtprsB0V2N1 Prdm6-203ENSMUST00000115399 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
PtprsB0V2N1 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
PtprsB0V2N1 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
PtprsB0V2N1 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.91■□□□□ 0.3
PtprsB0V2N1 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
PtprsB0V2N1 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
PtprsB0V2N1 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
PtprsB0V2N1 Tex264-203ENSMUST00000169068 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
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