Protein–RNA interactions for Protein: A2CFD5

Btbd35f28, BTB domain-containing 35, family member 28, mousemouse

Predictions only

Length 498 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Btbd35f28A2CFD5 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Btbd35f28A2CFD5 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Btbd35f28A2CFD5 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Btbd35f28A2CFD5 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Btbd35f28A2CFD5 Wdr41-203ENSMUST00000160115 2851 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Btbd35f28A2CFD5 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Btbd35f28A2CFD5 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Btbd35f28A2CFD5 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Btbd35f28A2CFD5 Gm26803-201ENSMUST00000181705 2011 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Btbd35f28A2CFD5 Dgke-202ENSMUST00000107894 8347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Btbd35f28A2CFD5 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Btbd35f28A2CFD5 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Btbd35f28A2CFD5 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Btbd35f28A2CFD5 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Btbd35f28A2CFD5 Prr14-201ENSMUST00000033095 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Btbd35f28A2CFD5 Lactbl1-201ENSMUST00000178843 2954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Btbd35f28A2CFD5 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Btbd35f28A2CFD5 Fbxl18-201ENSMUST00000035985 2831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Btbd35f28A2CFD5 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Btbd35f28A2CFD5 Itsn1-205ENSMUST00000113996 5147 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Btbd35f28A2CFD5 Retreg1-201ENSMUST00000022881 3248 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Btbd35f28A2CFD5 Trim24-201ENSMUST00000031859 4042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Btbd35f28A2CFD5 Pitpnm2-210ENSMUST00000162812 6952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Btbd35f28A2CFD5 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Btbd35f28A2CFD5 Sox14-201ENSMUST00000054819 2065 ntAPPRIS P1 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Btbd35f28A2CFD5 Igsf8-201ENSMUST00000039506 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Btbd35f28A2CFD5 Zfp746-201ENSMUST00000073124 3651 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Btbd35f28A2CFD5 Dok7-202ENSMUST00000101298 2443 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Btbd35f28A2CFD5 Klf5-201ENSMUST00000005279 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Btbd35f28A2CFD5 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Btbd35f28A2CFD5 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Btbd35f28A2CFD5 Pfn2-201ENSMUST00000066882 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Btbd35f28A2CFD5 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Btbd35f28A2CFD5 Macrod2-201ENSMUST00000043836 3552 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Btbd35f28A2CFD5 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Btbd35f28A2CFD5 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Btbd35f28A2CFD5 Chst8-204ENSMUST00000205259 1980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Btbd35f28A2CFD5 Ccnyl1-202ENSMUST00000114077 3281 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Btbd35f28A2CFD5 Paqr7-201ENSMUST00000081525 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Btbd35f28A2CFD5 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Btbd35f28A2CFD5 Diras1-201ENSMUST00000055125 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Btbd35f28A2CFD5 Hebp2-201ENSMUST00000020000 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Btbd35f28A2CFD5 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Btbd35f28A2CFD5 Yipf2-204ENSMUST00000213809 1883 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Btbd35f28A2CFD5 Gm42417-201ENSMUST00000191849 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Btbd35f28A2CFD5 Ptpre-201ENSMUST00000073961 5410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Btbd35f28A2CFD5 Card10-202ENSMUST00000164826 4726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Btbd35f28A2CFD5 Snx27-202ENSMUST00000107283 3531 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Btbd35f28A2CFD5 Fads3-201ENSMUST00000115995 3269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Btbd35f28A2CFD5 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Btbd35f28A2CFD5 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Btbd35f28A2CFD5 Susd1-202ENSMUST00000107544 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Btbd35f28A2CFD5 Haglr-201ENSMUST00000100000 2085 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Btbd35f28A2CFD5 Hnrnph1-201ENSMUST00000069304 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Btbd35f28A2CFD5 Smpdl3b-201ENSMUST00000030709 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Btbd35f28A2CFD5 Col17a1-202ENSMUST00000086923 5477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Btbd35f28A2CFD5 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Btbd35f28A2CFD5 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Btbd35f28A2CFD5 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Btbd35f28A2CFD5 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Btbd35f28A2CFD5 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Btbd35f28A2CFD5 Kmt5c-201ENSMUST00000098853 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Btbd35f28A2CFD5 Zhx1-202ENSMUST00000110168 5212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Btbd35f28A2CFD5 Zscan29-203ENSMUST00000146243 2894 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Btbd35f28A2CFD5 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Btbd35f28A2CFD5 Agbl5-208ENSMUST00000201168 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Btbd35f28A2CFD5 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Btbd35f28A2CFD5 Isoc2a-201ENSMUST00000125249 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Btbd35f28A2CFD5 Klhdc8b-210ENSMUST00000193895 2718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Btbd35f28A2CFD5 Slc16a3-202ENSMUST00000100130 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Btbd35f28A2CFD5 F830208F22Rik-202ENSMUST00000143732 2891 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Btbd35f28A2CFD5 Ddhd1-201ENSMUST00000051310 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Btbd35f28A2CFD5 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Btbd35f28A2CFD5 Abtb1-201ENSMUST00000032169 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Btbd35f28A2CFD5 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Btbd35f28A2CFD5 Fxr1-201ENSMUST00000001620 2459 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Btbd35f28A2CFD5 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Btbd35f28A2CFD5 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Btbd35f28A2CFD5 Tor1b-201ENSMUST00000028199 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Btbd35f28A2CFD5 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Btbd35f28A2CFD5 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Btbd35f28A2CFD5 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Btbd35f28A2CFD5 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Btbd35f28A2CFD5 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Btbd35f28A2CFD5 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Btbd35f28A2CFD5 Vstm5-201ENSMUST00000034413 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Btbd35f28A2CFD5 Dok4-201ENSMUST00000046461 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Btbd35f28A2CFD5 Dcaf12l2-201ENSMUST00000115057 2885 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Btbd35f28A2CFD5 Fam219b-202ENSMUST00000114200 3017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Btbd35f28A2CFD5 Atrnl1-201ENSMUST00000077282 6581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Btbd35f28A2CFD5 Tcf7l2-203ENSMUST00000111646 2839 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Btbd35f28A2CFD5 Pigs-201ENSMUST00000048073 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Btbd35f28A2CFD5 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Btbd35f28A2CFD5 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Btbd35f28A2CFD5 Cebpg-202ENSMUST00000130491 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Btbd35f28A2CFD5 Tapt1-201ENSMUST00000055128 3513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Btbd35f28A2CFD5 A830073O21Rik-202ENSMUST00000205693 3096 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Btbd35f28A2CFD5 Rhot1-201ENSMUST00000017831 3029 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Btbd35f28A2CFD5 Phf1-201ENSMUST00000073724 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Btbd35f28A2CFD5 Zc3h14-203ENSMUST00000110104 3146 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.9 ms