Protein–RNA interactions for Protein: A2AQ07

Tubb1, Tubulin beta-1 chain, mousemouse

Predictions only

Length 451 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tubb1A2AQ07 Insm1-201ENSMUST00000089257 3100 ntAPPRIS P1 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Tubb1A2AQ07 Icam5-201ENSMUST00000019616 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Tubb1A2AQ07 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Tubb1A2AQ07 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Tubb1A2AQ07 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
Tubb1A2AQ07 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
Tubb1A2AQ07 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Tubb1A2AQ07 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Tubb1A2AQ07 Sema6d-203ENSMUST00000077847 6444 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Tubb1A2AQ07 Gnb2-204ENSMUST00000111027 1610 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Tubb1A2AQ07 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Tubb1A2AQ07 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Tubb1A2AQ07 Rnf112-203ENSMUST00000102661 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Tubb1A2AQ07 Ldlrad4-201ENSMUST00000063775 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Tubb1A2AQ07 Ncmap-205ENSMUST00000105860 2000 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Tubb1A2AQ07 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Tubb1A2AQ07 AC163637.2-201ENSMUST00000213826 1945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Tubb1A2AQ07 Zscan12-201ENSMUST00000053293 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Tubb1A2AQ07 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Tubb1A2AQ07 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Tubb1A2AQ07 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Tubb1A2AQ07 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Tubb1A2AQ07 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Tubb1A2AQ07 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Tubb1A2AQ07 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Tubb1A2AQ07 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Tubb1A2AQ07 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Tubb1A2AQ07 2810004N23Rik-201ENSMUST00000034465 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Tubb1A2AQ07 Tgds-204ENSMUST00000228543 1594 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
Tubb1A2AQ07 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Tubb1A2AQ07 Tmem136-202ENSMUST00000213544 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Tubb1A2AQ07 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Tubb1A2AQ07 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Tubb1A2AQ07 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Tubb1A2AQ07 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Tubb1A2AQ07 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Tubb1A2AQ07 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Tubb1A2AQ07 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
Tubb1A2AQ07 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Tubb1A2AQ07 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Tubb1A2AQ07 Gm6209-202ENSMUST00000194629 1506 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Tubb1A2AQ07 Tfdp2-209ENSMUST00000188750 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Tubb1A2AQ07 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Tubb1A2AQ07 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Tubb1A2AQ07 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Tubb1A2AQ07 Nfatc2-205ENSMUST00000137451 2369 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Tubb1A2AQ07 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Tubb1A2AQ07 Pfn2-201ENSMUST00000066882 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Tubb1A2AQ07 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Tubb1A2AQ07 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Tubb1A2AQ07 Ptpra-201ENSMUST00000028769 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Tubb1A2AQ07 Elof1-204ENSMUST00000214394 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Tubb1A2AQ07 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Tubb1A2AQ07 Gm45844-202ENSMUST00000209325 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Tubb1A2AQ07 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Tubb1A2AQ07 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Tubb1A2AQ07 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Tubb1A2AQ07 Ccdc149-201ENSMUST00000059428 3295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Tubb1A2AQ07 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Tubb1A2AQ07 Anks1b-225ENSMUST00000182966 1625 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Tubb1A2AQ07 Gm45606-201ENSMUST00000209836 2795 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
Tubb1A2AQ07 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Tubb1A2AQ07 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
Tubb1A2AQ07 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
Tubb1A2AQ07 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Tubb1A2AQ07 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Tubb1A2AQ07 Ssc4d-204ENSMUST00000111153 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Tubb1A2AQ07 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Tubb1A2AQ07 Tmem260-209ENSMUST00000226422 6333 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Tubb1A2AQ07 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Tubb1A2AQ07 Prdm6-203ENSMUST00000115399 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Tubb1A2AQ07 C1ql3-201ENSMUST00000061545 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Tubb1A2AQ07 Zfp219-204ENSMUST00000226522 2804 ntAPPRIS P2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Tubb1A2AQ07 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Tubb1A2AQ07 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Tubb1A2AQ07 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Tubb1A2AQ07 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Tubb1A2AQ07 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
Tubb1A2AQ07 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Tubb1A2AQ07 Slc29a1-201ENSMUST00000051574 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Tubb1A2AQ07 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Tubb1A2AQ07 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Tubb1A2AQ07 Ano10-206ENSMUST00000216670 2108 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Tubb1A2AQ07 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Tubb1A2AQ07 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Tubb1A2AQ07 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Tubb1A2AQ07 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Tubb1A2AQ07 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Tubb1A2AQ07 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Tubb1A2AQ07 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Tubb1A2AQ07 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Tubb1A2AQ07 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Tubb1A2AQ07 Tsnax-202ENSMUST00000212603 2169 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Tubb1A2AQ07 Camkk2-211ENSMUST00000200109 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Tubb1A2AQ07 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Tubb1A2AQ07 Gpr137b-ps-203ENSMUST00000220758 1942 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Tubb1A2AQ07 5330438I03Rik-201ENSMUST00000168347 2845 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
Tubb1A2AQ07 Agfg2-201ENSMUST00000031736 2893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Tubb1A2AQ07 Arhgef9-208ENSMUST00000128565 2285 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Tubb1A2AQ07 Rassf1-201ENSMUST00000010211 1727 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.6 ms