Protein–RNA interactions for Protein: A2APF3

Ctcfl, Transcriptional repressor CTCFL, mousemouse

Predictions only

Length 636 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CtcflA2APF3 Simc1-202ENSMUST00000121401 4819 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
CtcflA2APF3 Sptbn4-202ENSMUST00000108362 4861 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
CtcflA2APF3 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
CtcflA2APF3 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
CtcflA2APF3 Sart3-201ENSMUST00000019118 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
CtcflA2APF3 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
CtcflA2APF3 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
CtcflA2APF3 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
CtcflA2APF3 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CtcflA2APF3 Usp13-202ENSMUST00000108228 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CtcflA2APF3 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CtcflA2APF3 Mturn-203ENSMUST00000190641 5303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CtcflA2APF3 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CtcflA2APF3 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CtcflA2APF3 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
CtcflA2APF3 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CtcflA2APF3 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CtcflA2APF3 Ap1g1-202ENSMUST00000093157 6899 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CtcflA2APF3 Zbtb9-201ENSMUST00000120016 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CtcflA2APF3 Nedd4l-202ENSMUST00000163516 8163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CtcflA2APF3 9330111N05Rik-202ENSMUST00000181043 2449 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CtcflA2APF3 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
CtcflA2APF3 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CtcflA2APF3 Cables1-201ENSMUST00000046948 3202 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CtcflA2APF3 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CtcflA2APF3 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CtcflA2APF3 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CtcflA2APF3 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CtcflA2APF3 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CtcflA2APF3 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CtcflA2APF3 Rbm12b1-202ENSMUST00000069128 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CtcflA2APF3 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CtcflA2APF3 Isoc2a-201ENSMUST00000125249 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CtcflA2APF3 Tbc1d2b-202ENSMUST00000128874 3473 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CtcflA2APF3 Lin9-203ENSMUST00000192561 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CtcflA2APF3 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CtcflA2APF3 Samd4-211ENSMUST00000228404 3039 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CtcflA2APF3 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CtcflA2APF3 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CtcflA2APF3 Vangl2-201ENSMUST00000027837 5698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CtcflA2APF3 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CtcflA2APF3 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CtcflA2APF3 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CtcflA2APF3 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CtcflA2APF3 Gm26821-201ENSMUST00000181954 2652 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CtcflA2APF3 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CtcflA2APF3 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CtcflA2APF3 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CtcflA2APF3 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CtcflA2APF3 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CtcflA2APF3 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CtcflA2APF3 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CtcflA2APF3 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CtcflA2APF3 Agbl5-215ENSMUST00000202060 3121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CtcflA2APF3 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CtcflA2APF3 Apaf1-202ENSMUST00000159110 6433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CtcflA2APF3 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CtcflA2APF3 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CtcflA2APF3 Rnf146-202ENSMUST00000160144 4323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CtcflA2APF3 Sri-205ENSMUST00000148633 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CtcflA2APF3 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CtcflA2APF3 Map3k10-201ENSMUST00000036453 3682 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CtcflA2APF3 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CtcflA2APF3 Tmem131l-201ENSMUST00000052342 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CtcflA2APF3 Ryr2-203ENSMUST00000220597 4924 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CtcflA2APF3 Zfp697-202ENSMUST00000178372 4703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CtcflA2APF3 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CtcflA2APF3 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CtcflA2APF3 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CtcflA2APF3 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CtcflA2APF3 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CtcflA2APF3 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CtcflA2APF3 Ubr3-201ENSMUST00000055758 8072 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CtcflA2APF3 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CtcflA2APF3 Usp32-202ENSMUST00000108075 7053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CtcflA2APF3 Slc16a7-205ENSMUST00000210780 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CtcflA2APF3 Adcy7-203ENSMUST00000169037 5198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CtcflA2APF3 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CtcflA2APF3 Bean1-204ENSMUST00000171018 3386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CtcflA2APF3 Zfp865-203ENSMUST00000085427 2751 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CtcflA2APF3 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CtcflA2APF3 Gprin1-202ENSMUST00000135343 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CtcflA2APF3 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CtcflA2APF3 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CtcflA2APF3 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CtcflA2APF3 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CtcflA2APF3 Oxr1-206ENSMUST00000170127 4251 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CtcflA2APF3 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CtcflA2APF3 Mboat1-201ENSMUST00000047311 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CtcflA2APF3 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CtcflA2APF3 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CtcflA2APF3 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
CtcflA2APF3 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CtcflA2APF3 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CtcflA2APF3 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
CtcflA2APF3 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CtcflA2APF3 Pex5-202ENSMUST00000080557 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CtcflA2APF3 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CtcflA2APF3 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CtcflA2APF3 Bambi-201ENSMUST00000025075 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
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