Protein–RNA interactions for Protein: A2ABX0

Rbbp8nl, RBBP8 N-terminal-like, mousemouse

Predictions only

Length 614 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rbbp8nlA2ABX0 Tsc22d1-214ENSMUST00000177207 1476 ntTSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Rbbp8nlA2ABX0 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Rbbp8nlA2ABX0 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Rbbp8nlA2ABX0 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Rbbp8nlA2ABX0 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Rbbp8nlA2ABX0 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Rbbp8nlA2ABX0 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Rbbp8nlA2ABX0 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Rbbp8nlA2ABX0 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Rbbp8nlA2ABX0 Mrps18a-202ENSMUST00000123646 621 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Rbbp8nlA2ABX0 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Rbbp8nlA2ABX0 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Rbbp8nlA2ABX0 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Rbbp8nlA2ABX0 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Rbbp8nlA2ABX0 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Rbbp8nlA2ABX0 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Rbbp8nlA2ABX0 Nsfl1c-203ENSMUST00000103160 1369 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Rbbp8nlA2ABX0 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Rbbp8nlA2ABX0 Rps14-202ENSMUST00000118551 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Rbbp8nlA2ABX0 Dnajc19-204ENSMUST00000120805 551 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Rbbp8nlA2ABX0 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Rbbp8nlA2ABX0 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Rbbp8nlA2ABX0 AL591207.1-203ENSMUST00000222401 1380 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Rbbp8nlA2ABX0 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Rbbp8nlA2ABX0 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Rbbp8nlA2ABX0 Tmem126a-201ENSMUST00000032844 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Rbbp8nlA2ABX0 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Rbbp8nlA2ABX0 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
Rbbp8nlA2ABX0 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Rbbp8nlA2ABX0 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Rbbp8nlA2ABX0 Cdkl3-203ENSMUST00000109076 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Rbbp8nlA2ABX0 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Rbbp8nlA2ABX0 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Rbbp8nlA2ABX0 Wnt10b-205ENSMUST00000226846 1204 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
Rbbp8nlA2ABX0 Nrn1l-201ENSMUST00000060167 617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Rbbp8nlA2ABX0 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Rbbp8nlA2ABX0 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Rbbp8nlA2ABX0 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Rbbp8nlA2ABX0 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Rbbp8nlA2ABX0 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
Rbbp8nlA2ABX0 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Rbbp8nlA2ABX0 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Rbbp8nlA2ABX0 Gm10653-202ENSMUST00000139570 835 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
Rbbp8nlA2ABX0 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
Rbbp8nlA2ABX0 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Rbbp8nlA2ABX0 Stac2-201ENSMUST00000017544 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Rbbp8nlA2ABX0 Dynll2-202ENSMUST00000107923 2443 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Rbbp8nlA2ABX0 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Rbbp8nlA2ABX0 Mrpl10-201ENSMUST00000001485 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Rbbp8nlA2ABX0 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Rbbp8nlA2ABX0 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Rbbp8nlA2ABX0 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Rbbp8nlA2ABX0 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Rbbp8nlA2ABX0 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Rbbp8nlA2ABX0 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Rbbp8nlA2ABX0 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Rbbp8nlA2ABX0 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Rbbp8nlA2ABX0 Gm11527-201ENSMUST00000153795 596 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Rbbp8nlA2ABX0 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Rbbp8nlA2ABX0 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Rbbp8nlA2ABX0 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Rbbp8nlA2ABX0 Wnt10b-202ENSMUST00000166022 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Rbbp8nlA2ABX0 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Rbbp8nlA2ABX0 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Rbbp8nlA2ABX0 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Rbbp8nlA2ABX0 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC21.89■■□□□ 1.1
Rbbp8nlA2ABX0 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Rbbp8nlA2ABX0 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Rbbp8nlA2ABX0 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Rbbp8nlA2ABX0 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Rbbp8nlA2ABX0 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Rbbp8nlA2ABX0 Gm27011-201ENSMUST00000182352 972 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
Rbbp8nlA2ABX0 Gm37856-201ENSMUST00000191634 999 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
Rbbp8nlA2ABX0 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
Rbbp8nlA2ABX0 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Rbbp8nlA2ABX0 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Rbbp8nlA2ABX0 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Rbbp8nlA2ABX0 Aldh7a1-206ENSMUST00000172734 1880 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Rbbp8nlA2ABX0 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Rbbp8nlA2ABX0 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Rbbp8nlA2ABX0 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Rbbp8nlA2ABX0 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Rbbp8nlA2ABX0 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Rbbp8nlA2ABX0 Tpd52l1-201ENSMUST00000000305 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Rbbp8nlA2ABX0 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Rbbp8nlA2ABX0 Arl6ip4-202ENSMUST00000122394 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Rbbp8nlA2ABX0 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Rbbp8nlA2ABX0 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Rbbp8nlA2ABX0 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Rbbp8nlA2ABX0 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Rbbp8nlA2ABX0 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Rbbp8nlA2ABX0 Slc29a1-201ENSMUST00000051574 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Rbbp8nlA2ABX0 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Rbbp8nlA2ABX0 Golga7-202ENSMUST00000121783 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Rbbp8nlA2ABX0 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Rbbp8nlA2ABX0 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Rbbp8nlA2ABX0 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Rbbp8nlA2ABX0 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Rbbp8nlA2ABX0 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Rbbp8nlA2ABX0 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.5 ms