Protein–RNA interactions for Protein: A2A588

Krtap1-3, Keratin-associated protein 1-3, mousemouse

Predictions only

Length 173 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krtap1-3A2A588 Mkln1os-202ENSMUST00000144232 964 ntTSL 1 (best) BASIC9.25□□□□□ -0.93
Krtap1-3A2A588 Prss45-202ENSMUST00000146794 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.25□□□□□ -0.93
Krtap1-3A2A588 Rbm4-203ENSMUST00000178615 1018 ntTSL 1 (best) BASIC9.25□□□□□ -0.93
Krtap1-3A2A588 Gm20878-208ENSMUST00000181518 264 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.25□□□□□ -0.93
Krtap1-3A2A588 Mir1668-201ENSMUST00000184114 107 ntBASIC9.25□□□□□ -0.93
Krtap1-3A2A588 Celrr-203ENSMUST00000185678 937 ntTSL 1 (best) BASIC9.25□□□□□ -0.93
Krtap1-3A2A588 Gm7063-201ENSMUST00000186840 981 ntBASIC9.25□□□□□ -0.93
Krtap1-3A2A588 Arrb2-204ENSMUST00000102564 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.25□□□□□ -0.93
Krtap1-3A2A588 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.25□□□□□ -0.93
Krtap1-3A2A588 Gm11748-201ENSMUST00000153825 1498 ntTSL 2 BASIC9.25□□□□□ -0.93
Krtap1-3A2A588 Arhgap42-203ENSMUST00000183182 1458 ntTSL 1 (best) BASIC9.25□□□□□ -0.93
Krtap1-3A2A588 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.25□□□□□ -0.93
Krtap1-3A2A588 Rab11b-203ENSMUST00000173860 1544 ntTSL 1 (best) BASIC9.25□□□□□ -0.93
Krtap1-3A2A588 B3gat2-202ENSMUST00000140583 1737 ntTSL 1 (best) BASIC9.25□□□□□ -0.93
Krtap1-3A2A588 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.25□□□□□ -0.93
Krtap1-3A2A588 Hspb6-201ENSMUST00000044048 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.24□□□□□ -0.93
Krtap1-3A2A588 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.24□□□□□ -0.93
Krtap1-3A2A588 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC9.24□□□□□ -0.93
Krtap1-3A2A588 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.24□□□□□ -0.93
Krtap1-3A2A588 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.24□□□□□ -0.93
Krtap1-3A2A588 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.24□□□□□ -0.93
Krtap1-3A2A588 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC9.24□□□□□ -0.93
Krtap1-3A2A588 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.24□□□□□ -0.93
Krtap1-3A2A588 Gpr142-202ENSMUST00000106584 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.24□□□□□ -0.93
Krtap1-3A2A588 Rnf5-201ENSMUST00000015622 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.24□□□□□ -0.93
Krtap1-3A2A588 Tulp3-205ENSMUST00000157005 1053 ntTSL 1 (best) BASIC9.24□□□□□ -0.93
Krtap1-3A2A588 Steap1-201ENSMUST00000015796 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.24□□□□□ -0.93
Krtap1-3A2A588 Gm15890-201ENSMUST00000161024 770 ntTSL 1 (best) BASIC9.24□□□□□ -0.93
Krtap1-3A2A588 H2afz-207ENSMUST00000174561 810 ntTSL 1 (best) BASIC9.24□□□□□ -0.93
Krtap1-3A2A588 Tnnt2-205ENSMUST00000178204 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.24□□□□□ -0.93
Krtap1-3A2A588 Tnnt2-207ENSMUST00000179863 1097 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC9.24□□□□□ -0.93
Krtap1-3A2A588 Tnnt2-209ENSMUST00000188028 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC9.24□□□□□ -0.93
Krtap1-3A2A588 Gm28876-201ENSMUST00000188137 703 ntTSL 3 BASIC9.24□□□□□ -0.93
Krtap1-3A2A588 Gm42802-201ENSMUST00000202475 456 ntTSL 2 BASIC9.24□□□□□ -0.93
Krtap1-3A2A588 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC9.24□□□□□ -0.93
Krtap1-3A2A588 Pnmt-201ENSMUST00000041301 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.24□□□□□ -0.93
Krtap1-3A2A588 Gpr142-201ENSMUST00000045319 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.24□□□□□ -0.93
Krtap1-3A2A588 Nudt1-201ENSMUST00000050205 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.24□□□□□ -0.93
Krtap1-3A2A588 Nudt1-202ENSMUST00000071881 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.24□□□□□ -0.93
Krtap1-3A2A588 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.24□□□□□ -0.93
Krtap1-3A2A588 Gpd1-203ENSMUST00000162194 1515 ntTSL 5 BASIC9.24□□□□□ -0.93
Krtap1-3A2A588 Spsb2-203ENSMUST00000112473 1322 ntBASIC9.24□□□□□ -0.93
Krtap1-3A2A588 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC9.24□□□□□ -0.93
Krtap1-3A2A588 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC9.24□□□□□ -0.93
Krtap1-3A2A588 2010016I18Rik-204ENSMUST00000190356 1562 ntTSL 1 (best) BASIC9.24□□□□□ -0.93
Krtap1-3A2A588 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.24□□□□□ -0.93
Krtap1-3A2A588 Ybx2-202ENSMUST00000108601 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.24□□□□□ -0.93
Krtap1-3A2A588 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.23□□□□□ -0.93
Krtap1-3A2A588 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.23□□□□□ -0.93
Krtap1-3A2A588 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC9.23□□□□□ -0.93
Krtap1-3A2A588 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC9.23□□□□□ -0.93
Krtap1-3A2A588 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC9.23□□□□□ -0.93
Krtap1-3A2A588 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC9.23□□□□□ -0.93
Krtap1-3A2A588 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.23□□□□□ -0.93
Krtap1-3A2A588 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC9.23□□□□□ -0.93
Krtap1-3A2A588 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.23□□□□□ -0.93
Krtap1-3A2A588 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC9.23□□□□□ -0.93
Krtap1-3A2A588 Dnajc24-201ENSMUST00000102555 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.23□□□□□ -0.93
Krtap1-3A2A588 Gm13474-201ENSMUST00000122466 815 ntBASIC9.23□□□□□ -0.93
Krtap1-3A2A588 Rps27l-203ENSMUST00000127896 575 ntTSL 5 BASIC9.23□□□□□ -0.93
Krtap1-3A2A588 Gm16075-201ENSMUST00000135873 361 ntTSL 3 BASIC9.23□□□□□ -0.93
Krtap1-3A2A588 Tmem255b-201ENSMUST00000167071 1138 ntTSL 1 (best) BASIC9.23□□□□□ -0.93
Krtap1-3A2A588 Gm6623-201ENSMUST00000173570 544 ntBASIC9.23□□□□□ -0.93
Krtap1-3A2A588 Gm28051-201ENSMUST00000179306 445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.23□□□□□ -0.93
Krtap1-3A2A588 Gm26871-202ENSMUST00000180774 695 ntTSL 2 BASIC9.23□□□□□ -0.93
Krtap1-3A2A588 Gm18206-201ENSMUST00000207027 926 ntBASIC9.23□□□□□ -0.93
Krtap1-3A2A588 CAAA01066804.1-201ENSMUST00000217800 611 ntTSL 3 BASIC9.23□□□□□ -0.93
Krtap1-3A2A588 Hist1h2bq-202ENSMUST00000091749 1254 ntTSL 1 (best) BASIC9.23□□□□□ -0.93
Krtap1-3A2A588 C530025M09Rik-201ENSMUST00000099264 690 ntAPPRIS P1 BASIC9.23□□□□□ -0.93
Krtap1-3A2A588 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC9.23□□□□□ -0.93
Krtap1-3A2A588 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.23□□□□□ -0.93
Krtap1-3A2A588 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.23□□□□□ -0.93
Krtap1-3A2A588 Krt27-201ENSMUST00000017732 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.23□□□□□ -0.93
Krtap1-3A2A588 Cldn7-201ENSMUST00000018713 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.23□□□□□ -0.93
Krtap1-3A2A588 Gm10518-201ENSMUST00000097454 1301 ntAPPRIS P1 BASIC9.23□□□□□ -0.93
Krtap1-3A2A588 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.23□□□□□ -0.93
Krtap1-3A2A588 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.23□□□□□ -0.93
Krtap1-3A2A588 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC9.23□□□□□ -0.93
Krtap1-3A2A588 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC9.23□□□□□ -0.93
Krtap1-3A2A588 Tm6sf2-201ENSMUST00000049197 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.22□□□□□ -0.93
Krtap1-3A2A588 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.22□□□□□ -0.93
Krtap1-3A2A588 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.22□□□□□ -0.93
Krtap1-3A2A588 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.22□□□□□ -0.93
Krtap1-3A2A588 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC9.22□□□□□ -0.93
Krtap1-3A2A588 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.22□□□□□ -0.93
Krtap1-3A2A588 Rhd-201ENSMUST00000030627 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.22□□□□□ -0.93
Krtap1-3A2A588 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.22□□□□□ -0.93
Krtap1-3A2A588 Plxdc1-202ENSMUST00000107564 619 ntTSL 2 BASIC9.22□□□□□ -0.93
Krtap1-3A2A588 Gm11452-201ENSMUST00000122376 690 ntBASIC9.22□□□□□ -0.93
Krtap1-3A2A588 Gm15492-201ENSMUST00000156734 606 ntTSL 1 (best) BASIC9.22□□□□□ -0.93
Krtap1-3A2A588 Nabp2-204ENSMUST00000166608 979 ntTSL 5 BASIC9.22□□□□□ -0.93
Krtap1-3A2A588 Mir2861-201ENSMUST00000175539 82 ntBASIC9.22□□□□□ -0.93
Krtap1-3A2A588 Mir8098-201ENSMUST00000184011 137 ntBASIC9.22□□□□□ -0.93
Krtap1-3A2A588 Gm9694-201ENSMUST00000193347 1189 ntBASIC9.22□□□□□ -0.93
Krtap1-3A2A588 4930458A03Rik-201ENSMUST00000198197 961 ntTSL 1 (best) BASIC9.22□□□□□ -0.93
Krtap1-3A2A588 Gm7791-201ENSMUST00000219066 539 ntBASIC9.22□□□□□ -0.93
Krtap1-3A2A588 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC9.22□□□□□ -0.93
Krtap1-3A2A588 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.22□□□□□ -0.93
Krtap1-3A2A588 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.22□□□□□ -0.93
Krtap1-3A2A588 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.22□□□□□ -0.93
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.4 ms