Protein–RNA interactions for Protein: A2A432

Cul4b, Cullin-4B, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 970 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cul4bA2A432 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Cul4bA2A432 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Cul4bA2A432 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Cul4bA2A432 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Cul4bA2A432 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Cul4bA2A432 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Cul4bA2A432 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
Cul4bA2A432 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Cul4bA2A432 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Cul4bA2A432 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Cul4bA2A432 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Cul4bA2A432 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Cul4bA2A432 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Cul4bA2A432 Gm16054-201ENSMUST00000139469 1819 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Cul4bA2A432 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
Cul4bA2A432 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Cul4bA2A432 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Cul4bA2A432 Rbm39-202ENSMUST00000109584 667 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Cul4bA2A432 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
Cul4bA2A432 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Cul4bA2A432 Tpsg1-204ENSMUST00000160920 867 ntTSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Cul4bA2A432 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Cul4bA2A432 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Cul4bA2A432 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Cul4bA2A432 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Cul4bA2A432 Mboat1-201ENSMUST00000047311 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Cul4bA2A432 G730003C15Rik-202ENSMUST00000189096 2309 ntBASIC20.45■□□□□ 0.87
Cul4bA2A432 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Cul4bA2A432 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Cul4bA2A432 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Cul4bA2A432 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Cul4bA2A432 Ism1-201ENSMUST00000099307 2944 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Cul4bA2A432 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Cul4bA2A432 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Cul4bA2A432 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
Cul4bA2A432 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Cul4bA2A432 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Cul4bA2A432 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Cul4bA2A432 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Cul4bA2A432 Gm40460-201ENSMUST00000211591 735 ntAPPRIS P1 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Cul4bA2A432 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Cul4bA2A432 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Cul4bA2A432 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Cul4bA2A432 Dixdc1-207ENSMUST00000121634 2420 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Cul4bA2A432 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Cul4bA2A432 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Cul4bA2A432 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Cul4bA2A432 Fgf23-201ENSMUST00000000186 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Cul4bA2A432 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Cul4bA2A432 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Cul4bA2A432 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Cul4bA2A432 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Cul4bA2A432 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Cul4bA2A432 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Cul4bA2A432 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Cul4bA2A432 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Cul4bA2A432 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Cul4bA2A432 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Cul4bA2A432 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
Cul4bA2A432 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Cul4bA2A432 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Cul4bA2A432 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Cul4bA2A432 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Cul4bA2A432 Pex14-201ENSMUST00000103217 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Cul4bA2A432 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Cul4bA2A432 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Cul4bA2A432 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Cul4bA2A432 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Cul4bA2A432 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
Cul4bA2A432 Gm45894-201ENSMUST00000211940 651 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Cul4bA2A432 Nr1h2-202ENSMUST00000107910 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Cul4bA2A432 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Cul4bA2A432 Klhl25-202ENSMUST00000171155 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Cul4bA2A432 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Cul4bA2A432 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Cul4bA2A432 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Cul4bA2A432 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Cul4bA2A432 Map1lc3b-204ENSMUST00000181826 2633 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
Cul4bA2A432 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Cul4bA2A432 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Cul4bA2A432 Dsg2-203ENSMUST00000121837 953 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Cul4bA2A432 Aldoa-ps3-201ENSMUST00000217558 306 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
Cul4bA2A432 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Cul4bA2A432 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Cul4bA2A432 Trpc4ap-202ENSMUST00000103140 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Cul4bA2A432 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Cul4bA2A432 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Cul4bA2A432 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Cul4bA2A432 Ccdc91-201ENSMUST00000032441 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Cul4bA2A432 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Cul4bA2A432 Rbm15b-201ENSMUST00000055843 6511 ntAPPRIS P1 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Cul4bA2A432 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Cul4bA2A432 Ypel3-204ENSMUST00000106359 469 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Cul4bA2A432 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Cul4bA2A432 Dynll2-202ENSMUST00000107923 2443 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Cul4bA2A432 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Cul4bA2A432 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Cul4bA2A432 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Cul4bA2A432 A730060N03Rik-201ENSMUST00000174277 2124 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Cul4bA2A432 Gm37805-201ENSMUST00000192612 1094 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.1 ms