Protein–RNA interactions for Protein: A0A0U1RP99

Ino80e, INO80 complex subunit E (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 260 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ino80eA0A0U1RP99 St7l-202ENSMUST00000106769 2428 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ino80eA0A0U1RP99 F830208F22Rik-202ENSMUST00000143732 2891 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ino80eA0A0U1RP99 Ocel1-202ENSMUST00000110051 2179 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ino80eA0A0U1RP99 Eda-203ENSMUST00000113776 5105 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ino80eA0A0U1RP99 A130014A01Rik-201ENSMUST00000183021 2323 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Ino80eA0A0U1RP99 Ctnna2-204ENSMUST00000160894 4162 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ino80eA0A0U1RP99 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ino80eA0A0U1RP99 AC069562.2-201ENSMUST00000224644 2146 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Ino80eA0A0U1RP99 Hey2-201ENSMUST00000019924 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ino80eA0A0U1RP99 Gne-202ENSMUST00000102936 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ino80eA0A0U1RP99 Retreg1-201ENSMUST00000022881 3248 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ino80eA0A0U1RP99 Flvcr1-201ENSMUST00000085635 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ino80eA0A0U1RP99 Bmp2k-201ENSMUST00000035635 7387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ino80eA0A0U1RP99 Anks6-201ENSMUST00000084616 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ino80eA0A0U1RP99 Plbd2-201ENSMUST00000031597 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ino80eA0A0U1RP99 Aim2-204ENSMUST00000166137 2079 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ino80eA0A0U1RP99 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ino80eA0A0U1RP99 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ino80eA0A0U1RP99 Lrrc47-205ENSMUST00000169622 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ino80eA0A0U1RP99 Tor1b-201ENSMUST00000028199 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ino80eA0A0U1RP99 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ino80eA0A0U1RP99 Esrp1-202ENSMUST00000108310 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ino80eA0A0U1RP99 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ino80eA0A0U1RP99 D730003I15Rik-202ENSMUST00000194375 1667 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Ino80eA0A0U1RP99 Acss3-201ENSMUST00000044668 2494 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ino80eA0A0U1RP99 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ino80eA0A0U1RP99 Eda-202ENSMUST00000113775 5088 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ino80eA0A0U1RP99 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ino80eA0A0U1RP99 Acadvl-201ENSMUST00000018718 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ino80eA0A0U1RP99 Rimbp3-201ENSMUST00000169803 5787 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ino80eA0A0U1RP99 Grb7-201ENSMUST00000019456 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ino80eA0A0U1RP99 Sprn-201ENSMUST00000059241 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ino80eA0A0U1RP99 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ino80eA0A0U1RP99 Men1-203ENSMUST00000079327 2639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ino80eA0A0U1RP99 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ino80eA0A0U1RP99 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ino80eA0A0U1RP99 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ino80eA0A0U1RP99 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ino80eA0A0U1RP99 Pdap1-201ENSMUST00000031627 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ino80eA0A0U1RP99 Met-203ENSMUST00000115443 6809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ino80eA0A0U1RP99 Kri1-201ENSMUST00000038671 2598 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ino80eA0A0U1RP99 Zfx-201ENSMUST00000088102 7002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ino80eA0A0U1RP99 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ino80eA0A0U1RP99 Hr-201ENSMUST00000022691 5487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ino80eA0A0U1RP99 Nfkbie-201ENSMUST00000024742 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ino80eA0A0U1RP99 Macrod2-201ENSMUST00000043836 3552 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ino80eA0A0U1RP99 Slc35e3-201ENSMUST00000079041 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ino80eA0A0U1RP99 Fam149b-211ENSMUST00000224930 2716 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ino80eA0A0U1RP99 Parg-201ENSMUST00000022470 4413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ino80eA0A0U1RP99 Wapl-201ENSMUST00000048263 6351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ino80eA0A0U1RP99 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ino80eA0A0U1RP99 E230025N22Rik-201ENSMUST00000115682 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ino80eA0A0U1RP99 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ino80eA0A0U1RP99 Prkar2b-202ENSMUST00000036497 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ino80eA0A0U1RP99 Dhx32-203ENSMUST00000106139 2233 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ino80eA0A0U1RP99 Socs4-201ENSMUST00000065562 6877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ino80eA0A0U1RP99 Trpc1-204ENSMUST00000189137 4559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ino80eA0A0U1RP99 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ino80eA0A0U1RP99 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ino80eA0A0U1RP99 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ino80eA0A0U1RP99 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ino80eA0A0U1RP99 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ino80eA0A0U1RP99 A830073O21Rik-202ENSMUST00000205693 3096 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Ino80eA0A0U1RP99 Atp2b2-201ENSMUST00000089003 7067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ino80eA0A0U1RP99 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ino80eA0A0U1RP99 Itgb4-201ENSMUST00000021107 6014 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ino80eA0A0U1RP99 Slc32a1-201ENSMUST00000045738 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ino80eA0A0U1RP99 Anapc5-201ENSMUST00000086216 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ino80eA0A0U1RP99 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ino80eA0A0U1RP99 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ino80eA0A0U1RP99 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ino80eA0A0U1RP99 Bcar1-201ENSMUST00000166232 3142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ino80eA0A0U1RP99 She-201ENSMUST00000050401 5733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ino80eA0A0U1RP99 Camk2n1-201ENSMUST00000050918 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ino80eA0A0U1RP99 Itpripl2-201ENSMUST00000178344 6865 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ino80eA0A0U1RP99 H2-Q4-201ENSMUST00000081435 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ino80eA0A0U1RP99 Ankrd63-201ENSMUST00000104937 4861 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ino80eA0A0U1RP99 Aste1-202ENSMUST00000123807 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ino80eA0A0U1RP99 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ino80eA0A0U1RP99 Nfatc2-205ENSMUST00000137451 2369 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ino80eA0A0U1RP99 Nipsnap1-201ENSMUST00000038570 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ino80eA0A0U1RP99 Ppm1e-201ENSMUST00000055438 6344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ino80eA0A0U1RP99 Fmnl3-203ENSMUST00000120633 4290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ino80eA0A0U1RP99 Cnot9-201ENSMUST00000087215 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ino80eA0A0U1RP99 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ino80eA0A0U1RP99 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ino80eA0A0U1RP99 Zc3h14-203ENSMUST00000110104 3146 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ino80eA0A0U1RP99 Fbxl12os-202ENSMUST00000136376 2349 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ino80eA0A0U1RP99 E230001N04Rik-202ENSMUST00000181029 2091 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Ino80eA0A0U1RP99 Kctd1-202ENSMUST00000168989 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ino80eA0A0U1RP99 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ino80eA0A0U1RP99 Prmt1-203ENSMUST00000207370 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ino80eA0A0U1RP99 4930448E22Rik-202ENSMUST00000215242 2102 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ino80eA0A0U1RP99 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Ino80eA0A0U1RP99 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ino80eA0A0U1RP99 Atp6v0a1-203ENSMUST00000103110 2716 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ino80eA0A0U1RP99 Slc26a10-205ENSMUST00000222911 3067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ino80eA0A0U1RP99 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ino80eA0A0U1RP99 Aspscr1-204ENSMUST00000106159 1615 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ino80eA0A0U1RP99 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.8 ms