Protein–RNA interactions for Protein: A0A0U1RP08

1700028J19Rik, RIKEN cDNA 1700028J19 gene (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 172 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
1700028J19RikA0A0U1RP08 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
1700028J19RikA0A0U1RP08 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
1700028J19RikA0A0U1RP08 Klhl25-202ENSMUST00000171155 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
1700028J19RikA0A0U1RP08 Camta1-204ENSMUST00000105670 4961 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
1700028J19RikA0A0U1RP08 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
1700028J19RikA0A0U1RP08 Nr1h2-202ENSMUST00000107910 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
1700028J19RikA0A0U1RP08 AC163637.2-201ENSMUST00000213826 1945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
1700028J19RikA0A0U1RP08 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
1700028J19RikA0A0U1RP08 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
1700028J19RikA0A0U1RP08 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
1700028J19RikA0A0U1RP08 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
1700028J19RikA0A0U1RP08 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
1700028J19RikA0A0U1RP08 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
1700028J19RikA0A0U1RP08 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
1700028J19RikA0A0U1RP08 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
1700028J19RikA0A0U1RP08 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
1700028J19RikA0A0U1RP08 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
1700028J19RikA0A0U1RP08 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
1700028J19RikA0A0U1RP08 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
1700028J19RikA0A0U1RP08 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
1700028J19RikA0A0U1RP08 Adgra2-201ENSMUST00000033876 5760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
1700028J19RikA0A0U1RP08 Gm42939-201ENSMUST00000197514 2205 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
1700028J19RikA0A0U1RP08 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
1700028J19RikA0A0U1RP08 A730060N03Rik-201ENSMUST00000174277 2124 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
1700028J19RikA0A0U1RP08 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
1700028J19RikA0A0U1RP08 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
1700028J19RikA0A0U1RP08 Orai3-201ENSMUST00000061587 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
1700028J19RikA0A0U1RP08 Ism1-201ENSMUST00000099307 2944 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
1700028J19RikA0A0U1RP08 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
1700028J19RikA0A0U1RP08 Coq5-201ENSMUST00000040421 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
1700028J19RikA0A0U1RP08 Elof1-204ENSMUST00000214394 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
1700028J19RikA0A0U1RP08 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
1700028J19RikA0A0U1RP08 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
1700028J19RikA0A0U1RP08 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
1700028J19RikA0A0U1RP08 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
1700028J19RikA0A0U1RP08 Gm21949-201ENSMUST00000182006 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
1700028J19RikA0A0U1RP08 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
1700028J19RikA0A0U1RP08 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
1700028J19RikA0A0U1RP08 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
1700028J19RikA0A0U1RP08 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
1700028J19RikA0A0U1RP08 Ank1-207ENSMUST00000118733 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
1700028J19RikA0A0U1RP08 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
1700028J19RikA0A0U1RP08 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
1700028J19RikA0A0U1RP08 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
1700028J19RikA0A0U1RP08 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
1700028J19RikA0A0U1RP08 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
1700028J19RikA0A0U1RP08 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
1700028J19RikA0A0U1RP08 Nova2-202ENSMUST00000220302 8372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
1700028J19RikA0A0U1RP08 Nova2-201ENSMUST00000032571 8372 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
1700028J19RikA0A0U1RP08 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
1700028J19RikA0A0U1RP08 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
1700028J19RikA0A0U1RP08 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
1700028J19RikA0A0U1RP08 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
1700028J19RikA0A0U1RP08 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
1700028J19RikA0A0U1RP08 Mag-207ENSMUST00000191081 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
1700028J19RikA0A0U1RP08 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
1700028J19RikA0A0U1RP08 4930540M05Rik-201ENSMUST00000180527 2068 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
1700028J19RikA0A0U1RP08 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
1700028J19RikA0A0U1RP08 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
1700028J19RikA0A0U1RP08 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
1700028J19RikA0A0U1RP08 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
1700028J19RikA0A0U1RP08 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
1700028J19RikA0A0U1RP08 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC17.13■□□□□ 0.33
1700028J19RikA0A0U1RP08 Dmtn-207ENSMUST00000228001 2437 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
1700028J19RikA0A0U1RP08 Mdfic-202ENSMUST00000120512 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
1700028J19RikA0A0U1RP08 Tpd52l1-201ENSMUST00000000305 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
1700028J19RikA0A0U1RP08 Anks1b-225ENSMUST00000182966 1625 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
1700028J19RikA0A0U1RP08 Bin2-204ENSMUST00000182775 1908 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
1700028J19RikA0A0U1RP08 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
1700028J19RikA0A0U1RP08 Gm10300-201ENSMUST00000094662 2296 ntAPPRIS P1 BASIC17.13■□□□□ 0.33
1700028J19RikA0A0U1RP08 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
1700028J19RikA0A0U1RP08 Arid1a-202ENSMUST00000105897 8175 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
1700028J19RikA0A0U1RP08 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
1700028J19RikA0A0U1RP08 BC034090-204ENSMUST00000186156 4873 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
1700028J19RikA0A0U1RP08 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
1700028J19RikA0A0U1RP08 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
1700028J19RikA0A0U1RP08 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
1700028J19RikA0A0U1RP08 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
1700028J19RikA0A0U1RP08 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
1700028J19RikA0A0U1RP08 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
1700028J19RikA0A0U1RP08 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
1700028J19RikA0A0U1RP08 Gnb2-204ENSMUST00000111027 1610 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
1700028J19RikA0A0U1RP08 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
1700028J19RikA0A0U1RP08 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
1700028J19RikA0A0U1RP08 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
1700028J19RikA0A0U1RP08 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
1700028J19RikA0A0U1RP08 B230208B08Rik-201ENSMUST00000173049 404 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
1700028J19RikA0A0U1RP08 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
1700028J19RikA0A0U1RP08 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
1700028J19RikA0A0U1RP08 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
1700028J19RikA0A0U1RP08 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
1700028J19RikA0A0U1RP08 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
1700028J19RikA0A0U1RP08 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
1700028J19RikA0A0U1RP08 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
1700028J19RikA0A0U1RP08 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
1700028J19RikA0A0U1RP08 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
1700028J19RikA0A0U1RP08 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
1700028J19RikA0A0U1RP08 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
1700028J19RikA0A0U1RP08 Trpc4ap-202ENSMUST00000103140 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
1700028J19RikA0A0U1RP08 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24 ms