Protein–RNA interactions for Protein: Q9DBU5

Rnf6, E3 ubiquitin-protein ligase RNF6, mousemouse

Predictions only

Length 667 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf6Q9DBU5 Adar-201ENSMUST00000029563 3753 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
Rnf6Q9DBU5 Ap4e1-201ENSMUST00000002063 4600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
Rnf6Q9DBU5 Olfr845-203ENSMUST00000215572 3446 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.27□□□□□ -1.25
Rnf6Q9DBU5 Gm4876-203ENSMUST00000139701 2225 ntTSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
Rnf6Q9DBU5 D830026I12Rik-203ENSMUST00000151170 1607 ntTSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
Rnf6Q9DBU5 Ccdc83-202ENSMUST00000107220 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.27□□□□□ -1.25
Rnf6Q9DBU5 Angptl1-202ENSMUST00000111720 1332 ntTSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
Rnf6Q9DBU5 Abca6-201ENSMUST00000044003 5240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
Rnf6Q9DBU5 Gria3-202ENSMUST00000115103 3081 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC7.26□□□□□ -1.25
Rnf6Q9DBU5 Cdhr3-201ENSMUST00000095774 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
Rnf6Q9DBU5 Olfr472-203ENSMUST00000216937 5392 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.26□□□□□ -1.25
Rnf6Q9DBU5 Lilra6-204ENSMUST00000206077 2281 ntTSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
Rnf6Q9DBU5 Gm37855-201ENSMUST00000192571 3700 ntTSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
Rnf6Q9DBU5 Adgrl2-215ENSMUST00000199750 4399 ntTSL 5 BASIC7.26□□□□□ -1.25
Rnf6Q9DBU5 Olfr1393-202ENSMUST00000213323 3010 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.26□□□□□ -1.25
Rnf6Q9DBU5 Clca4a-201ENSMUST00000029923 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
Rnf6Q9DBU5 Vmn1r198-204ENSMUST00000227167 5990 ntAPPRIS ALT2 BASIC7.26□□□□□ -1.25
Rnf6Q9DBU5 AC153962.2-202ENSMUST00000219391 1382 ntTSL 5 BASIC7.26□□□□□ -1.25
Rnf6Q9DBU5 Awat1-201ENSMUST00000096361 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
Rnf6Q9DBU5 AC159264.1-202ENSMUST00000224856 3162 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
Rnf6Q9DBU5 Gm23748-201ENSMUST00000104227 131 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
Rnf6Q9DBU5 Gm5809-201ENSMUST00000121854 529 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
Rnf6Q9DBU5 Gm20615-201ENSMUST00000177503 705 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
Rnf6Q9DBU5 Gm37493-201ENSMUST00000193167 433 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
Rnf6Q9DBU5 Ccl2-201ENSMUST00000000193 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
Rnf6Q9DBU5 Gm43160-201ENSMUST00000196453 421 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
Rnf6Q9DBU5 Gm44342-201ENSMUST00000196874 129 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
Rnf6Q9DBU5 Gm44383-201ENSMUST00000198940 129 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
Rnf6Q9DBU5 AC172194.1-201ENSMUST00000214246 1020 ntTSL 5 BASIC7.26□□□□□ -1.25
Rnf6Q9DBU5 AC122305.2-201ENSMUST00000215148 834 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
Rnf6Q9DBU5 Gm17849-201ENSMUST00000219788 853 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
Rnf6Q9DBU5 Gm24411-201ENSMUST00000083428 131 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
Rnf6Q9DBU5 Gm42523-201ENSMUST00000199378 2872 ntTSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
Rnf6Q9DBU5 Copa-201ENSMUST00000027833 4351 ntTSL 5 BASIC7.26□□□□□ -1.25
Rnf6Q9DBU5 Arhgap32-203ENSMUST00000174641 13568 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.26□□□□□ -1.25
Rnf6Q9DBU5 Gm10619-201ENSMUST00000098372 2695 ntTSL 5 BASIC7.26□□□□□ -1.25
Rnf6Q9DBU5 Trim43b-202ENSMUST00000189557 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
Rnf6Q9DBU5 Olfr645-201ENSMUST00000057104 3677 ntAPPRIS P1 BASIC7.26□□□□□ -1.25
Rnf6Q9DBU5 Fam47c-201ENSMUST00000105110 1639 ntAPPRIS P1 BASIC7.26□□□□□ -1.25
Rnf6Q9DBU5 P2ry14-203ENSMUST00000196081 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
Rnf6Q9DBU5 Gm45297-201ENSMUST00000209893 3483 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
Rnf6Q9DBU5 Fancd2-208ENSMUST00000204827 4707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
Rnf6Q9DBU5 Hdac9-205ENSMUST00000209902 7940 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.26□□□□□ -1.25
Rnf6Q9DBU5 Gm6011-201ENSMUST00000211736 1796 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
Rnf6Q9DBU5 Plk4-202ENSMUST00000167556 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.25□□□□□ -1.25
Rnf6Q9DBU5 Cd36-203ENSMUST00000169095 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
Rnf6Q9DBU5 Gm43549-201ENSMUST00000198856 2661 ntTSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
Rnf6Q9DBU5 Gstz1-201ENSMUST00000063117 1656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
Rnf6Q9DBU5 AC153729.1-201ENSMUST00000214055 2562 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
Rnf6Q9DBU5 Ralgapa2-205ENSMUST00000131824 5624 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.25□□□□□ -1.25
Rnf6Q9DBU5 Cdc42bpa-202ENSMUST00000097450 5160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
Rnf6Q9DBU5 Robo2-202ENSMUST00000117200 5988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.25□□□□□ -1.25
Rnf6Q9DBU5 Plch1-206ENSMUST00000159676 6560 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
Rnf6Q9DBU5 Olfr694-203ENSMUST00000216118 5035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.25□□□□□ -1.25
Rnf6Q9DBU5 Vmn1r9-203ENSMUST00000228714 4573 ntAPPRIS P1 BASIC7.25□□□□□ -1.25
Rnf6Q9DBU5 E330011O21Rik-204ENSMUST00000210839 1361 ntTSL 5 BASIC7.25□□□□□ -1.25
Rnf6Q9DBU5 Gm44620-201ENSMUST00000209183 2887 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
Rnf6Q9DBU5 Vmn1r50-202ENSMUST00000089417 2059 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.25□□□□□ -1.25
Rnf6Q9DBU5 Ighv1-53-201ENSMUST00000103523 351 ntAPPRIS P1 BASIC7.25□□□□□ -1.25
Rnf6Q9DBU5 Ighv1-69-201ENSMUST00000103539 348 ntAPPRIS ALT2 BASIC7.25□□□□□ -1.25
Rnf6Q9DBU5 Tpmt-202ENSMUST00000110118 881 ntTSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
Rnf6Q9DBU5 Gm15149-201ENSMUST00000119370 360 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
Rnf6Q9DBU5 Gm7113-201ENSMUST00000120477 958 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
Rnf6Q9DBU5 Gm11820-201ENSMUST00000139614 664 ntTSL 3 BASIC7.25□□□□□ -1.25
Rnf6Q9DBU5 Gm12629-201ENSMUST00000145751 711 ntTSL 3 BASIC7.25□□□□□ -1.25
Rnf6Q9DBU5 Ulbp1-201ENSMUST00000169796 1093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
Rnf6Q9DBU5 Pid1-205ENSMUST00000176720 450 ntTSL 5 BASIC7.25□□□□□ -1.25
Rnf6Q9DBU5 Gm20614-201ENSMUST00000177106 632 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
Rnf6Q9DBU5 Gm5930-202ENSMUST00000178002 489 ntTSL 5 BASIC7.25□□□□□ -1.25
Rnf6Q9DBU5 Gm27152-201ENSMUST00000183828 99 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
Rnf6Q9DBU5 Mir8105-201ENSMUST00000184718 89 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
Rnf6Q9DBU5 Gm29353-201ENSMUST00000185801 620 ntTSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
Rnf6Q9DBU5 Gm28340-201ENSMUST00000189218 202 ntTSL 3 BASIC7.25□□□□□ -1.25
Rnf6Q9DBU5 Gm39463-201ENSMUST00000214575 735 ntTSL 3 BASIC7.25□□□□□ -1.25
Rnf6Q9DBU5 1700021G15Rik-201ENSMUST00000217671 528 ntTSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
Rnf6Q9DBU5 Gm19047-201ENSMUST00000220922 1099 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
Rnf6Q9DBU5 Gm7252-201ENSMUST00000223284 456 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
Rnf6Q9DBU5 Ly6g-201ENSMUST00000023246 336 ntTSL 5 BASIC7.25□□□□□ -1.25
Rnf6Q9DBU5 Olfr1501-201ENSMUST00000073966 948 ntAPPRIS P1 BASIC7.25□□□□□ -1.25
Rnf6Q9DBU5 Pde1a-203ENSMUST00000102652 1646 ntTSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
Rnf6Q9DBU5 Cnot2-210ENSMUST00000168036 2693 ntTSL 5 BASIC7.25□□□□□ -1.25
Rnf6Q9DBU5 Gm10735-201ENSMUST00000099162 2943 ntAPPRIS P1 BASIC7.25□□□□□ -1.25
Rnf6Q9DBU5 St18-212ENSMUST00000151281 3533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
Rnf6Q9DBU5 Zfp934-208ENSMUST00000222429 1653 ntTSL 3 BASIC7.25□□□□□ -1.25
Rnf6Q9DBU5 Olfr1390-202ENSMUST00000215014 2875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.25□□□□□ -1.25
Rnf6Q9DBU5 Rabgap1l-202ENSMUST00000028052 6338 ntTSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
Rnf6Q9DBU5 Ccdc82-201ENSMUST00000110583 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
Rnf6Q9DBU5 Olfr62-202ENSMUST00000213189 2570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.24□□□□□ -1.25
Rnf6Q9DBU5 Klhl13-203ENSMUST00000115316 3064 ntTSL 5 BASIC7.24□□□□□ -1.25
Rnf6Q9DBU5 Gm37423-201ENSMUST00000194246 3342 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
Rnf6Q9DBU5 Nyap2-203ENSMUST00000123285 7501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
Rnf6Q9DBU5 Smc5-201ENSMUST00000087556 5683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
Rnf6Q9DBU5 Zfp934-209ENSMUST00000222746 2206 ntTSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
Rnf6Q9DBU5 Vmn1r181-204ENSMUST00000227637 4587 ntAPPRIS P1 BASIC7.24□□□□□ -1.25
Rnf6Q9DBU5 Eya4-202ENSMUST00000092665 5304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
Rnf6Q9DBU5 Zim3-202ENSMUST00000203365 3226 ntTSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
Rnf6Q9DBU5 AC122828.2-201ENSMUST00000222511 2880 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
Rnf6Q9DBU5 Vmn1r22-206ENSMUST00000228905 2394 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
Rnf6Q9DBU5 Zfp799-205ENSMUST00000202988 6012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
Rnf6Q9DBU5 Ptprd-220ENSMUST00000174831 4518 ntTSL 5 BASIC7.24□□□□□ -1.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 80.9 ms