Protein–RNA interactions for Protein: Q80TM9

Nisch, Nischarin, mousemouse

Predictions only

Length 1,593 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NischQ80TM9 Gm6525-201ENSMUST00000193882 1029 ntAPPRIS P1 BASIC13.94□□□□□ -0.18
NischQ80TM9 Gm8869-201ENSMUST00000195222 947 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
NischQ80TM9 Ddr2-202ENSMUST00000170800 8289 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
NischQ80TM9 Ctnnd1-207ENSMUST00000111676 5852 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
NischQ80TM9 Ctnnd1-209ENSMUST00000111678 5870 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
NischQ80TM9 Gm15462-201ENSMUST00000133653 4580 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
NischQ80TM9 Edar-201ENSMUST00000003312 3637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
NischQ80TM9 Zfp871-202ENSMUST00000159086 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
NischQ80TM9 Slc7a2-204ENSMUST00000118432 3681 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
NischQ80TM9 Enpp6-201ENSMUST00000039840 4970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
NischQ80TM9 Aspa-206ENSMUST00000184572 1746 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
NischQ80TM9 Vmn1r33-202ENSMUST00000227418 2414 ntAPPRIS P1 BASIC13.94□□□□□ -0.18
NischQ80TM9 Olfr1380-202ENSMUST00000215360 2498 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
NischQ80TM9 Trav6-6-201ENSMUST00000103584 344 ntAPPRIS P1 BASIC13.93□□□□□ -0.18
NischQ80TM9 Trav6n-5-201ENSMUST00000103611 338 ntAPPRIS P1 BASIC13.93□□□□□ -0.18
NischQ80TM9 Trav6d-7-201ENSMUST00000178650 358 ntAPPRIS P1 BASIC13.93□□□□□ -0.18
NischQ80TM9 Trav6n-7-201ENSMUST00000179607 358 ntAPPRIS P1 BASIC13.93□□□□□ -0.18
NischQ80TM9 Gm28777-201ENSMUST00000191402 535 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
NischQ80TM9 Trav6d-6-201ENSMUST00000197754 344 ntAPPRIS P1 BASIC13.93□□□□□ -0.18
NischQ80TM9 Gm42799-201ENSMUST00000201331 328 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
NischQ80TM9 Cx3cl1-205ENSMUST00000211947 377 ntTSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
NischQ80TM9 Gm33619-201ENSMUST00000215633 662 ntTSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
NischQ80TM9 BC147527-201ENSMUST00000081558 504 ntAPPRIS P1 BASIC13.93□□□□□ -0.18
NischQ80TM9 Cbx3-ps4-201ENSMUST00000091531 549 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
NischQ80TM9 Nlgn1-205ENSMUST00000193603 11807 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
NischQ80TM9 Pappa2-202ENSMUST00000159861 9518 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
NischQ80TM9 Gm3591-201ENSMUST00000164408 1745 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
NischQ80TM9 Zscan4e-201ENSMUST00000166753 1722 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
NischQ80TM9 Rrh-201ENSMUST00000029648 1506 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
NischQ80TM9 Angptl1-202ENSMUST00000111720 1332 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
NischQ80TM9 Slc38a9-201ENSMUST00000052514 8910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
NischQ80TM9 Cep57l1-205ENSMUST00000187143 1769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
NischQ80TM9 Tnik-203ENSMUST00000159680 4380 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
NischQ80TM9 Havcr1-202ENSMUST00000081819 2030 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
NischQ80TM9 Als2cr12-203ENSMUST00000188772 1382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
NischQ80TM9 Gm25917-201ENSMUST00000104267 130 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
NischQ80TM9 Gm13090-201ENSMUST00000105667 746 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.92□□□□□ -0.18
NischQ80TM9 Selenok-ps1-201ENSMUST00000125204 785 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
NischQ80TM9 Rpl28-ps4-201ENSMUST00000170447 377 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
NischQ80TM9 Arhgap39-209ENSMUST00000177026 371 ntTSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
NischQ80TM9 Rpap3-ps1-201ENSMUST00000190928 454 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
NischQ80TM9 Gm37375-201ENSMUST00000193859 387 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
NischQ80TM9 Gm37385-201ENSMUST00000195223 387 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
NischQ80TM9 Gm43798-201ENSMUST00000202056 394 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
NischQ80TM9 Gm9269-201ENSMUST00000221661 578 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
NischQ80TM9 AC154633.1-201ENSMUST00000223276 449 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
NischQ80TM9 AC154595.2-201ENSMUST00000225067 310 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
NischQ80TM9 Gm21123-201ENSMUST00000210822 1734 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
NischQ80TM9 Sema6d-205ENSMUST00000103238 3165 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
NischQ80TM9 Atxn7l1-208ENSMUST00000136644 3155 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
NischQ80TM9 Cacna1c-209ENSMUST00000187386 6906 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
NischQ80TM9 Ccdc169-201ENSMUST00000052904 2889 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
NischQ80TM9 Zzef1-201ENSMUST00000069395 11150 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
NischQ80TM9 Stat2-201ENSMUST00000085708 4394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
NischQ80TM9 Csde1-211ENSMUST00000198180 3849 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
NischQ80TM9 Ap1g1-201ENSMUST00000034171 3692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
NischQ80TM9 Panct2-201ENSMUST00000181489 3849 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
NischQ80TM9 Nqo2-202ENSMUST00000058978 3842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
NischQ80TM9 Zfyve26-201ENSMUST00000021547 9391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
NischQ80TM9 Fam160a1-202ENSMUST00000118408 4445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
NischQ80TM9 Tmcc3-203ENSMUST00000117929 3317 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
NischQ80TM9 Dab2-209ENSMUST00000161040 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
NischQ80TM9 Vmn2r-ps131-201ENSMUST00000176094 1046 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
NischQ80TM9 Gm19560-201ENSMUST00000177510 514 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
NischQ80TM9 Mir6367-201ENSMUST00000183385 102 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
NischQ80TM9 Gm36448-201ENSMUST00000199916 438 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
NischQ80TM9 AC154250.1-201ENSMUST00000224775 489 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
NischQ80TM9 Eif3e-201ENSMUST00000022960 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
NischQ80TM9 Zfp51-201ENSMUST00000039577 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
NischQ80TM9 Zfp790-202ENSMUST00000178162 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
NischQ80TM9 Gm37234-201ENSMUST00000193259 1441 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
NischQ80TM9 Gm43719-201ENSMUST00000200088 2199 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
NischQ80TM9 AC163660.4-201ENSMUST00000224983 2171 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
NischQ80TM9 4931406B18Rik-208ENSMUST00000191516 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
NischQ80TM9 Cldn12-202ENSMUST00000115445 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
NischQ80TM9 Tgif1-211ENSMUST00000186358 1455 ntTSL 3 BASIC13.91□□□□□ -0.18
NischQ80TM9 Gm44553-201ENSMUST00000206316 2037 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
NischQ80TM9 Zbtb18-212ENSMUST00000195612 3790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
NischQ80TM9 Gm11242-201ENSMUST00000120103 2457 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
NischQ80TM9 Tmem216-203ENSMUST00000123788 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.91□□□□□ -0.18
NischQ80TM9 Gm23071-201ENSMUST00000158242 115 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
NischQ80TM9 Gm18290-201ENSMUST00000202900 844 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
NischQ80TM9 AY512915-201ENSMUST00000089303 1823 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
NischQ80TM9 Sncaip-206ENSMUST00000178678 3724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
NischQ80TM9 4931406P16Rik-201ENSMUST00000085592 5798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
NischQ80TM9 Ect2l-201ENSMUST00000095817 2900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
NischQ80TM9 Rtel1-203ENSMUST00000098971 4307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
NischQ80TM9 C330024D21Rik-203ENSMUST00000202828 1714 ntTSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
NischQ80TM9 Serpina7-202ENSMUST00000060824 1895 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
NischQ80TM9 Vmn1r193-203ENSMUST00000227562 6840 ntAPPRIS P1 BASIC13.9□□□□□ -0.18
NischQ80TM9 Rps6ka6-201ENSMUST00000065976 3867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
NischQ80TM9 Nin-211ENSMUST00000222237 9919 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
NischQ80TM9 AC164883.2-201ENSMUST00000227931 3815 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
NischQ80TM9 AC154828.1-201ENSMUST00000220696 2810 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
NischQ80TM9 Tns1-208ENSMUST00000187584 9916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
NischQ80TM9 Trmt13-201ENSMUST00000041524 3402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
NischQ80TM9 Zbtb18-201ENSMUST00000077225 4944 ntAPPRIS P3 BASIC13.9□□□□□ -0.18
NischQ80TM9 Zmynd8-202ENSMUST00000088113 3757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
NischQ80TM9 Trim16-201ENSMUST00000055006 3906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
NischQ80TM9 Gm14237-201ENSMUST00000122080 430 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
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