Protein–RNA interactions for Protein: Q640L5

Ccdc18, Coiled-coil domain-containing protein 18, mousemouse

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Length 1,455 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc18Q640L5 AC140409.2-201ENSMUST00000216936 3079 ntTSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Ccdc18Q640L5 Bdnf-201ENSMUST00000053317 4266 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Ccdc18Q640L5 Slc25a40-202ENSMUST00000170496 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Ccdc18Q640L5 Itch-201ENSMUST00000029126 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Ccdc18Q640L5 Mnd1-ps-202ENSMUST00000224435 2574 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
Ccdc18Q640L5 Klrb1-201ENSMUST00000112110 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Ccdc18Q640L5 Gm24719-201ENSMUST00000157520 110 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
Ccdc18Q640L5 Gm23539-201ENSMUST00000157537 224 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
Ccdc18Q640L5 Rpl9-ps1-202ENSMUST00000182502 576 ntAPPRIS P1 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Ccdc18Q640L5 Gm3428-202ENSMUST00000184555 416 ntTSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Ccdc18Q640L5 Gm45514-201ENSMUST00000211531 689 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
Ccdc18Q640L5 AC079681.1-201ENSMUST00000219437 639 ntTSL 3 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Ccdc18Q640L5 Gm46379-201ENSMUST00000222551 265 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
Ccdc18Q640L5 AC154431.2-201ENSMUST00000225215 1055 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
Ccdc18Q640L5 Snora44-201ENSMUST00000082670 129 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
Ccdc18Q640L5 Cep290-210ENSMUST00000220346 8211 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Ccdc18Q640L5 Uba1y-202ENSMUST00000190013 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Ccdc18Q640L5 Sptan1-201ENSMUST00000046257 7820 ntTSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Ccdc18Q640L5 Arhgap1-201ENSMUST00000090614 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Ccdc18Q640L5 Psg22-202ENSMUST00000108481 1871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Ccdc18Q640L5 Psg22-203ENSMUST00000208221 1871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Ccdc18Q640L5 Psg22-201ENSMUST00000051973 1869 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Ccdc18Q640L5 Dst-209ENSMUST00000182697 2704 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Ccdc18Q640L5 Tmod2-206ENSMUST00000215036 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Ccdc18Q640L5 AC159193.3-201ENSMUST00000221902 2622 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
Ccdc18Q640L5 Usp29-201ENSMUST00000054055 2610 ntAPPRIS P1 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Ccdc18Q640L5 Ncoa4-202ENSMUST00000163336 4065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Ccdc18Q640L5 Zfp652-202ENSMUST00000107717 10433 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Ccdc18Q640L5 Rapgef6-210ENSMUST00000207429 5164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Ccdc18Q640L5 Stat1-201ENSMUST00000070968 5151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Ccdc18Q640L5 Olfr452-203ENSMUST00000215719 2728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Ccdc18Q640L5 Ctnna2-202ENSMUST00000159626 3908 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Ccdc18Q640L5 Gm13455-201ENSMUST00000118767 517 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Ccdc18Q640L5 Gm23740-201ENSMUST00000157385 100 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Ccdc18Q640L5 Snora47-201ENSMUST00000157483 138 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Ccdc18Q640L5 Gm28209-201ENSMUST00000187956 775 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Ccdc18Q640L5 Gm9110-201ENSMUST00000219035 617 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Ccdc18Q640L5 Gm8256-203ENSMUST00000228692 591 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Ccdc18Q640L5 Gm12608-201ENSMUST00000122013 1715 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Ccdc18Q640L5 Dock9-201ENSMUST00000040700 7803 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11□□□□□ -0.65
Ccdc18Q640L5 Gm15509-201ENSMUST00000162615 2162 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Ccdc18Q640L5 Klhl32-203ENSMUST00000108214 5970 ntTSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Ccdc18Q640L5 Inpp5f-203ENSMUST00000118605 3220 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Ccdc18Q640L5 Mnat1-201ENSMUST00000021523 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Ccdc18Q640L5 Abca14-201ENSMUST00000084640 5384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Ccdc18Q640L5 Marf1-201ENSMUST00000090300 7765 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
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Ccdc18Q640L5 Gm27048-201ENSMUST00000182891 4627 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Ccdc18Q640L5 Olfr90-205ENSMUST00000216488 3188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Ccdc18Q640L5 Klb-201ENSMUST00000031096 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Ccdc18Q640L5 Frmd4b-204ENSMUST00000113359 4311 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Ccdc18Q640L5 Ccdc187-202ENSMUST00000217256 9411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Ccdc18Q640L5 Gm15217-202ENSMUST00000141358 347 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Ccdc18Q640L5 Gm23030-201ENSMUST00000158004 273 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Ccdc18Q640L5 Scgb1b4-ps-201ENSMUST00000186920 271 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Ccdc18Q640L5 Halr1-203ENSMUST00000189071 511 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Ccdc18Q640L5 Gm4510-201ENSMUST00000218265 427 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Ccdc18Q640L5 AC154634.2-201ENSMUST00000225983 1184 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Ccdc18Q640L5 Arhgdib-201ENSMUST00000032344 1193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Ccdc18Q640L5 Gm9961-201ENSMUST00000068397 547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Ccdc18Q640L5 Olfr726-201ENSMUST00000072370 966 ntAPPRIS P1 BASIC11□□□□□ -0.65
Ccdc18Q640L5 Ccdc80-202ENSMUST00000099498 3671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Ccdc18Q640L5 AC129308.2-203ENSMUST00000224109 2385 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Ccdc18Q640L5 Bcat1-201ENSMUST00000032402 7833 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Ccdc18Q640L5 Dcdc5-201ENSMUST00000037284 3093 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
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Ccdc18Q640L5 Star-201ENSMUST00000033979 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
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Ccdc18Q640L5 Angpt2-201ENSMUST00000033846 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Ccdc18Q640L5 Gm13856-201ENSMUST00000126498 1742 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Ccdc18Q640L5 Aadac-201ENSMUST00000029325 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Ccdc18Q640L5 Gm38416-201ENSMUST00000209648 3565 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Ccdc18Q640L5 Abcc12-201ENSMUST00000080115 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Ccdc18Q640L5 Gm23440-201ENSMUST00000104299 130 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Ccdc18Q640L5 Gm13400-201ENSMUST00000117436 380 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Ccdc18Q640L5 Igkv4-53-201ENSMUST00000166380 292 ntAPPRIS P1 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Ccdc18Q640L5 Gm22548-201ENSMUST00000174899 78 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Ccdc18Q640L5 Rps16-ps3-201ENSMUST00000179126 441 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Ccdc18Q640L5 Gm27853-201ENSMUST00000184176 250 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Ccdc18Q640L5 1700025B11Rik-201ENSMUST00000190233 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Ccdc18Q640L5 Rpl28-ps2-201ENSMUST00000194739 554 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Ccdc18Q640L5 Gm38133-201ENSMUST00000195109 815 ntTSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Ccdc18Q640L5 Gm44312-201ENSMUST00000203536 469 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Ccdc18Q640L5 Gm18839-201ENSMUST00000204292 670 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Ccdc18Q640L5 Gm5119-201ENSMUST00000215858 634 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Ccdc18Q640L5 Gm40645-202ENSMUST00000219828 874 ntTSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Ccdc18Q640L5 AC174797.2-203ENSMUST00000224017 716 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Ccdc18Q640L5 Bex6-201ENSMUST00000099990 764 ntAPPRIS P1 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Ccdc18Q640L5 Mgat4a-206ENSMUST00000154819 2796 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Ccdc18Q640L5 Olfr316-202ENSMUST00000215071 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Ccdc18Q640L5 Golgb1-202ENSMUST00000039855 10847 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Ccdc18Q640L5 Cd36-203ENSMUST00000169095 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
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