Protein–RNA interactions for Protein: P81068

Irx1, Iroquois-class homeodomain protein IRX-1, mousemouse

Predictions only

Length 480 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Irx1P81068 AC161595.1-201ENSMUST00000216389 1993 ntTSL 1 (best) BASIC7.17□□□□□ -1.26
Irx1P81068 CT030181.1-201ENSMUST00000089534 3549 ntTSL 1 (best) BASIC7.17□□□□□ -1.26
Irx1P81068 Aadat-202ENSMUST00000209338 1597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.16□□□□□ -1.26
Irx1P81068 Rnf219-202ENSMUST00000227640 1632 ntAPPRIS ALT2 BASIC7.16□□□□□ -1.26
Irx1P81068 Cyp2c67-201ENSMUST00000067328 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.16□□□□□ -1.26
Irx1P81068 Olfr477-202ENSMUST00000214677 2930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.16□□□□□ -1.26
Irx1P81068 Psd3-201ENSMUST00000038959 11319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.16□□□□□ -1.26
Irx1P81068 Gm45838-201ENSMUST00000207355 2447 ntBASIC7.16□□□□□ -1.26
Irx1P81068 Ttc41-201ENSMUST00000061458 1815 ntTSL 1 (best) BASIC7.16□□□□□ -1.26
Irx1P81068 Tcf7-201ENSMUST00000086844 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.16□□□□□ -1.26
Irx1P81068 Gm37945-201ENSMUST00000192536 4367 ntBASIC7.16□□□□□ -1.26
Irx1P81068 Igkv2-137-201ENSMUST00000103302 501 ntAPPRIS P1 BASIC7.16□□□□□ -1.26
Irx1P81068 1700092K14Rik-201ENSMUST00000106604 395 ntTSL 1 (best) BASIC7.16□□□□□ -1.26
Irx1P81068 Gm15054-201ENSMUST00000117393 281 ntBASIC7.16□□□□□ -1.26
Irx1P81068 Gm14201-201ENSMUST00000117627 289 ntBASIC7.16□□□□□ -1.26
Irx1P81068 Gm14480-201ENSMUST00000118521 433 ntBASIC7.16□□□□□ -1.26
Irx1P81068 Gm11257-201ENSMUST00000121313 315 ntBASIC7.16□□□□□ -1.26
Irx1P81068 Gm11962-201ENSMUST00000145746 255 ntBASIC7.16□□□□□ -1.26
Irx1P81068 Gm15915-201ENSMUST00000147379 908 ntTSL 1 (best) BASIC7.16□□□□□ -1.26
Irx1P81068 Btf3-205ENSMUST00000152704 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.16□□□□□ -1.26
Irx1P81068 Gm13322-201ENSMUST00000152803 246 ntTSL 5 BASIC7.16□□□□□ -1.26
Irx1P81068 Gm12081-201ENSMUST00000152849 501 ntTSL 5 BASIC7.16□□□□□ -1.26
Irx1P81068 Gm22035-201ENSMUST00000157284 228 ntBASIC7.16□□□□□ -1.26
Irx1P81068 Sbp-205ENSMUST00000183017 700 ntTSL 5 BASIC7.16□□□□□ -1.26
Irx1P81068 Ms4a5-202ENSMUST00000186937 816 ntTSL 1 (best) BASIC7.16□□□□□ -1.26
Irx1P81068 Gm7341-201ENSMUST00000192183 926 ntBASIC7.16□□□□□ -1.26
Irx1P81068 Gm38170-201ENSMUST00000195404 816 ntBASIC7.16□□□□□ -1.26
Irx1P81068 Gm42580-201ENSMUST00000197223 753 ntBASIC7.16□□□□□ -1.26
Irx1P81068 Gm44760-201ENSMUST00000206375 1173 ntBASIC7.16□□□□□ -1.26
Irx1P81068 A26c2-201ENSMUST00000207359 997 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.16□□□□□ -1.26
Irx1P81068 AC241534.1-201ENSMUST00000218537 399 ntTSL 2 BASIC7.16□□□□□ -1.26
Irx1P81068 Gm4796-201ENSMUST00000219802 624 ntBASIC7.16□□□□□ -1.26
Irx1P81068 Gm18960-201ENSMUST00000222962 713 ntBASIC7.16□□□□□ -1.26
Irx1P81068 CT033781.1-201ENSMUST00000223128 454 ntTSL 5 BASIC7.16□□□□□ -1.26
Irx1P81068 AC154487.1-201ENSMUST00000224649 226 ntBASIC7.16□□□□□ -1.26
Irx1P81068 AC140267.1-201ENSMUST00000226485 213 ntAPPRIS P1 BASIC7.16□□□□□ -1.26
Irx1P81068 AC125087.1-201ENSMUST00000227552 514 ntBASIC7.16□□□□□ -1.26
Irx1P81068 Ms4a5-201ENSMUST00000067673 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.16□□□□□ -1.26
Irx1P81068 Vmn2r73-201ENSMUST00000077478 2556 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.16□□□□□ -1.26
Irx1P81068 AC155941.4-201ENSMUST00000219731 2705 ntTSL 1 (best) BASIC7.16□□□□□ -1.26
Irx1P81068 Arl5b-201ENSMUST00000017562 6933 ntTSL 1 (best) BASIC7.16□□□□□ -1.26
Irx1P81068 Olfr716-205ENSMUST00000214819 3485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.16□□□□□ -1.26
Irx1P81068 Ampd1-202ENSMUST00000155034 2913 ntTSL 1 (best) BASIC7.16□□□□□ -1.26
Irx1P81068 Gm29220-201ENSMUST00000185862 1501 ntTSL 5 BASIC7.16□□□□□ -1.26
Irx1P81068 Gm28966-201ENSMUST00000188951 1501 ntTSL 5 BASIC7.16□□□□□ -1.26
Irx1P81068 AC158981.2-201ENSMUST00000227565 1537 ntBASIC7.16□□□□□ -1.26
Irx1P81068 Tbc1d23-203ENSMUST00000226586 3112 ntBASIC7.16□□□□□ -1.26
Irx1P81068 Obox3-202ENSMUST00000095217 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.16□□□□□ -1.26
Irx1P81068 Trappc13-206ENSMUST00000179891 1689 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC7.16□□□□□ -1.26
Irx1P81068 Abca15-202ENSMUST00000121265 5335 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.15□□□□□ -1.26
Irx1P81068 Abca15-201ENSMUST00000076272 5335 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.15□□□□□ -1.26
Irx1P81068 Gabrg1-201ENSMUST00000031119 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.15□□□□□ -1.26
Irx1P81068 C330024D21Rik-202ENSMUST00000202634 2020 ntTSL 2 BASIC7.15□□□□□ -1.26
Irx1P81068 Shprh-202ENSMUST00000054814 7225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.15□□□□□ -1.26
Irx1P81068 Igkv12-44-201ENSMUST00000103367 401 ntAPPRIS P1 BASIC7.15□□□□□ -1.26
Irx1P81068 Gm25916-201ENSMUST00000104263 131 ntBASIC7.15□□□□□ -1.26
Irx1P81068 Gm12111-201ENSMUST00000150073 349 ntTSL 3 BASIC7.15□□□□□ -1.26
Irx1P81068 Cd48-201ENSMUST00000015499 922 ntTSL 1 (best) BASIC7.15□□□□□ -1.26
Irx1P81068 Gm21304-201ENSMUST00000180568 1185 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.15□□□□□ -1.26
Irx1P81068 Gm21293-202ENSMUST00000180664 1185 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.15□□□□□ -1.26
Irx1P81068 1700022N22Rik-201ENSMUST00000180932 709 ntTSL 1 (best) BASIC7.15□□□□□ -1.26
Irx1P81068 Gm4340-202ENSMUST00000181036 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC7.15□□□□□ -1.26
Irx1P81068 Gm21312-203ENSMUST00000181239 1185 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC7.15□□□□□ -1.26
Irx1P81068 Gm4340-203ENSMUST00000181615 1258 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC7.15□□□□□ -1.26
Irx1P81068 Gm20765-203ENSMUST00000181707 1185 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC7.15□□□□□ -1.26
Irx1P81068 Gm29016-201ENSMUST00000187523 1013 ntTSL 3 BASIC7.15□□□□□ -1.26
Irx1P81068 Gm18428-201ENSMUST00000194986 791 ntBASIC7.15□□□□□ -1.26
Irx1P81068 Gm45319-201ENSMUST00000210220 318 ntBASIC7.15□□□□□ -1.26
Irx1P81068 Gm45693-201ENSMUST00000211391 1157 ntBASIC7.15□□□□□ -1.26
Irx1P81068 AC134606.1-201ENSMUST00000216324 721 ntTSL 3 BASIC7.15□□□□□ -1.26
Irx1P81068 CT030166.4-201ENSMUST00000220640 404 ntBASIC7.15□□□□□ -1.26
Irx1P81068 CT030182.4-201ENSMUST00000223647 645 ntBASIC7.15□□□□□ -1.26
Irx1P81068 Tpbpb-203ENSMUST00000223978 991 ntAPPRIS ALT2 BASIC7.15□□□□□ -1.26
Irx1P81068 CT025639.2-201ENSMUST00000224440 1220 ntBASIC7.15□□□□□ -1.26
Irx1P81068 AC158981.1-201ENSMUST00000226943 1205 ntBASIC7.15□□□□□ -1.26
Irx1P81068 Ceacam14-201ENSMUST00000023953 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.15□□□□□ -1.26
Irx1P81068 Crisp4-201ENSMUST00000026876 1252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.15□□□□□ -1.26
Irx1P81068 Adgrg4-201ENSMUST00000096431 1137 ntTSL 2 BASIC7.15□□□□□ -1.26
Irx1P81068 Zfp420-201ENSMUST00000057652 2744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.15□□□□□ -1.26
Irx1P81068 Gm31267-201ENSMUST00000218941 1397 ntTSL 3 BASIC7.15□□□□□ -1.26
Irx1P81068 C3ar1-201ENSMUST00000042081 4305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.15□□□□□ -1.27
Irx1P81068 Lrrtm4-208ENSMUST00000147663 3033 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.15□□□□□ -1.27
Irx1P81068 Xrcc4-201ENSMUST00000022115 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.15□□□□□ -1.27
Irx1P81068 Olfr90-205ENSMUST00000216488 3188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.15□□□□□ -1.27
Irx1P81068 Nudcd1-206ENSMUST00000227843 5077 ntAPPRIS P2 BASIC7.15□□□□□ -1.27
Irx1P81068 Soat1-207ENSMUST00000189661 8371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.15□□□□□ -1.27
Irx1P81068 AC155243.1-201ENSMUST00000220141 2262 ntTSL 1 (best) BASIC7.15□□□□□ -1.27
Irx1P81068 Ap4e1-201ENSMUST00000002063 4600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.15□□□□□ -1.27
Irx1P81068 Gm20655-202ENSMUST00000181428 2946 ntTSL 1 (best) BASIC7.14□□□□□ -1.27
Irx1P81068 Fktn-203ENSMUST00000128667 6080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.14□□□□□ -1.27
Irx1P81068 Sspo-202ENSMUST00000169350 15571 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.14□□□□□ -1.27
Irx1P81068 Nsd2-205ENSMUST00000114399 7786 ntTSL 5 BASIC7.14□□□□□ -1.27
Irx1P81068 Vmn1r181-204ENSMUST00000227637 4587 ntAPPRIS P1 BASIC7.14□□□□□ -1.27
Irx1P81068 Vmn1r71-203ENSMUST00000227003 5048 ntAPPRIS P2 BASIC7.14□□□□□ -1.27
Irx1P81068 Gm25593-201ENSMUST00000102272 96 ntBASIC7.14□□□□□ -1.27
Irx1P81068 Gm13871-201ENSMUST00000107318 936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.14□□□□□ -1.27
Irx1P81068 Gm11757-201ENSMUST00000107320 936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.14□□□□□ -1.27
Irx1P81068 Gm11758-201ENSMUST00000107326 936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.14□□□□□ -1.27
Irx1P81068 Gm13930-201ENSMUST00000118569 368 ntBASIC7.14□□□□□ -1.27
Irx1P81068 Gm16330-201ENSMUST00000128324 297 ntBASIC7.14□□□□□ -1.27
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